Luke Research / Expert - Pennanen Taina

A1 Journal article (refereed)

Chowdhury, Shaswati; von Post, Maria; Vallejo, Roger Roca; Naciph Mora, Karen; Hultman, Jenni; Pennanen, Taina; Lindroos, Antti-Jussi; Helming, Katharina. 2024. Drivers of soil health across European Union : Data from the literature review. Data in brief 57: 111064.

Hamberg, Leena; Vanhatalo, Jarno; Velmala, Sannakajsa; Taylor, Andy FS; MacKay, John; Caron, Sébastien; Asiegbu, Fred O; Sievänen, Risto; Raumonen, Pasi; Hytönen, Tuija; Pennanen, Taina. 2024. The community of root fungi is associated with the growth rate of Norway spruce (Picea abies). Environmental microbiology 26 e16662:

Himanen, Katri; Nygren, Markku; Pennanen, Taina. 2024. Mycelial inoculation of containerized Norway spruce seedlings with ectomycorrhizal fungi. New forests 55: 47-61.

Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Lloret, Eva; Ollio, Irene; Hyvönen, Juha; Liski, Eero; Brandt, Kristian K.; Campillo-Cora, Claudia; Fritze, Hannu; Iivonen, Sari; Lassen, Simon B.; Loit, Kaire; Martínez-Martínez, Silvia; Pennanen, Taina; Põldmets, Marian; Schrader, Stefan; Shanskiy, Merrit; Zornoza, Raúl; Waeyenberge, Lieven; Calviño, David Fernández. 2024. Soil and climatic characteristics and farming system shape fungal communities in European wheat fields. Agriculture ecosystems and environment 370: 109035.

Salmela, Matti J.; Velmala, Sannakajsa M.; Himanen, Katri; Ylioja, Tiina; Pennanen, Taina. 2024. Soil factors and genetic variation regulate intraspecific growth in Norway spruce (Picea abies). Forest ecology and management 558: 12 p.

Adamczyk, Sylwia; Latvala, Satu; Poimala, Anna; Adamczyk, Bartosz; Hytönen, Tuija; Pennanen, Taina. 2023. Diterpenes and triterpenes show potential as biocides against pathogenic fungi and oomycetes: a screening study. Biotechnology Letters:

Hagner, Marleena; Pohjanlehto, Ida; Nuutinen, Visa; Setälä, Heikki; Velmala, Sannakajsa; Vesterinen, Eero; Pennanen, Taina; Lemola, Riitta; Peltoniemi, Krista. 2023. Impacts of long-term organic production on soil fauna in boreal dairy and cereal farming. Applied Soil Ecology 189: 10 p.

Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Fritze, Hannu; Jyske, Tuula; Rasi, Saija; Pennanen, Taina. 2023. Impacts of coniferous bark-derived organic soil amendments on microbial communities in arable soil – a microcosm study. FEMS Microbiology Ecology 99 3: 1-14.

Velmala, Sannakajsa; Salmela, Matti; Chan, Tommy; Hölttä, Teemu; Hamberg, Leena; Sievänen, Risto; Pennanen, Taina. 2022. Genotypes exhibit no variation in precision foraging in mycorrhizal Norway spruce seedlings. Plant and soil:

Adamczyk, Bartosz; Adamczyk, Sylwia; Kitunen, Veikko; Hytönen, Tuija; Mäkipää, Raisa; Pennanen, Taina. 2021. Variation in the chemical quality of woody supplements for nursery growing media affects growth of tree seedlings. New forests:

Heikkinen, Jaakko; Ketoja, Elise; Seppänen, Leena; Luostarinen, Sari; Fritze, Hannu; Pennanen, Taina; Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Hanajik, Peter; Regina, Kristiina. 2021. Chemical composition controls the decomposition of organic amendments and influences the microbial community structure in agricultural soils. Carbon management 12 4: 359-376.

Peltoniemi, Krista; Adamczyk, Sylwia; Fritze, Hannu; Minkkinen, Kari; Pennanen, Taina; Penttilä, Timo; Sarjala, Tytti; Laiho, Raija. 2021. Site fertility and soil water‐table level affect fungal biomass production and community composition in boreal peatland forests. Environmental microbiology:

Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Fritze, Hannu; Lemola, Riitta; Pennanen, Taina. 2021. Long-term impacts of organic and conventional farming on the soil microbiome in boreal arable soil. European journal of soil biology 104: 103314.

Kiheri, Heikki; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Timonen, Sari; Sietiö, Outi-Maaria; Fritze, Hannu; Heinonsalo, Jussi; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Larmola, Tuula. 2020. Fungal colonization patterns and enzymatic activities of peatland ericaceous plants following long-term nutrient addition. Soil biology and biochemistry 147: 11 p.

Kosunen, Maiju; Peltoniemi, Krista; Pennanen, Taina; Lyytikäinen-Saarenmaa, Päivi; Adamczyk, Bartosz; Fritze, Hannu; Zhou, Xuan; Starr, Mike. 2020. Storm and Ips typographus disturbance effects on carbon stocks, humus layer carbon fractions and microbial community composition in boreal Picea abies stands. Soil biology and biochemistry 148: 10 p.

Rasa, Kimmo; Pennanen, Taina; Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Fritze, Hannu; Kaseva, Janne; Joona, Juuso; Uusitalo, Risto. 2020. Pulp and Paper Mill Sludges Decrease Soil Erodibility. Journal of environmental quality:

Salmela, Matti J.; Velmala, Sannakajsa M.; Pennanen, Taina. 2020. Seedling traits from root to shoot exhibit genetic diversity and distinct responses to environmental heterogeneity within a tree population. Oikos 129 4: 544-558.

Soinne, Helena; Keskinen, Riikka; Heikkinen, Jaakko; Hyväluoma, Jari; Uusitalo, Risto; Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Fritze, Hannu; Kaseva, Janne; Hannula, Markus; Rasa, Kimmo. 2020. Are there environmental or agricultural benefits in using forest residue biochar in boreal agricultural clay soil? Science of the total environment 731: 12 p.

Tarvainen, Oili; Saravesi, Karita; Pennanen, Taina; Markkola, Anna-Mari; Suokas, Marko; Fritze, Hannu. 2020. Fungal communities in decomposing wood along an energy wood harvest gradient. Forest Ecology and Management 465: 10 p.

Pennanen, Taina; Fritze, Hannu; de Boer, Wietze; Baldrian, Petr. 2019. Editorial: special issue on the ecology of soil microorganisms. FEMS Microbiology Ecology 95 12:

Hamberg, Leena; Velmala, Sannakajsa M.; Sievänen, Risto; Kalliokoski, Tuomo; Pennanen, Taina. 2018. Early root growth and architecture of fast- and slow-growing Norway spruce (Picea abies) families differ—potential for functional adaptation. Tree Physiology 38 6: 853-864.

Poimala, A.; Werres, S.; Pennanen, T.; Hantula, J. 2018. First report of alder Phytophthora closely related to P. uniformis on Alnus glutinosa seedling in Finland. Plant Disease 102 2: 454.

Velmala, Sannakajsa; Vuorinen, I.; Uimari, Anne; Piri, Tuula; Pennanen, Taina. 2018. Ectomycorrhizal fungi increase the vitality of Norway spruce seedlings under the pressure of Heterobasidion root rot in vitro but may increase susceptibility to foliar necrotrophs. Fungal Biology 122 2-3: 101-109.

Badia-Fabregat, Marina; Lucas, Daniel; Tuomivirta, Tero; Fritze, Hannu; Pennanen, Taina; Rodriguez-Mozaz, Sara; Barcelo, Damia; Caminal, Gloria; Vicent, Teresa. 2017. Study of the effect of the bacterial and fungal communities present in real wastewater effluents on the performance of fungal treatments. Science of the Total Environment 579: 366-377.

Mäkipää, Raisa; Rajala, Tiina; Schigel, Dmitry; Rinne, Katja T.; Pennanen, Taina; Abrego, Nerea; Ovaskainen, Otso. 2017. Interactions between soil- and dead wood-inhabiting fungal communities during the decay of Norway spruce logs. The ISME Journal 11 9: 1964-1974.

Vainio, Eeva; Pennanen, Taina; Rajala, Tiina; Hantula, Jarkko. 2017. Occurrence of similar mycoviruses in pathogenic, saprotrophic and mycorrhizal fungi inhabiting the same forest stand. FEMS Microbiology Ecology 93 3: 11 p.

Badia-Fabregat, Marina; Lucas, Daniel; Alcina Pereira, Maria; Alves, Madalena; Pennanen, Taina; Fritze, Hannu; Rodriguez-Mozaz, Sara; Barcelo, Damia; Vicent, Teresa; Caminal, Gloria. 2016. Continuous fungal treatment of non-sterile veterinary hospital effluent: pharmaceuticals removal and microbial community assessment. Applied Microbiology and Biotechnology 100: 2401-2415.

Gaitnieks, Talis; Klavina, Darta; Muiznieks, Indrikis; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Vasaitis, Rimvydas; Menkis, Audrius. 2016. Impact of Heterobasidion root-rot on fine root morphology and associated fungi in Picea abies stands on peat soils. Mycorrhiza 26 5: 465-473.

Klavina, Darta; Menkis, Audrius; Gaitnieks, Talis; Pennanen, Taina; Lazdins, Andis; Velmala, Sannakajsa; Vasaitis, Rimvydas. 2016. Low impact of stump removal on mycorrhization and growth of replanted Picea abies: Data from three types of hemiboreal forest. Baltic Forestry 22 1: 16-24.

Klavina, Darta; Menkis, Audrius; Gaitnieks, Talis; Velmala, Sannakajsa; Lazdins, Andis; Rajala, Tiina; Pennanen, Taina. 2016. Analysis of Norway spruce dieback phenomenon in Latvia - a belowground perspective. Scandinavian Journal of Forest Research 31 2: 156-165.

Klavina, Darta; Pennanen, Taina; Gaitnieks, Talis; Velmala, Sannakajsa; Lazdins, Andis; Lazdina, Dagnija; Menkis, Audrius. 2016. The ectomycorrhizal community of conifer stands on peat soils 12 years after fertilization with wood ash. Mycorrhiza 26 2: 153-160.

Santalahti, Minna; Sun, Hui; Jumpponen, Ari; Pennanen, Taina; Heinonsalo, Jussi. 2016. Vertical and seasonal dynamics of fungal communities in boreal Scots pine forest soil. FEMS Microbiology Ecology 92, 92 11, 11:

Taylor, D. Lee; Walters, William A.; Lennon, Niall J.; Bochicchio, James; Krohn, Andrew; Caporaso, J. Gregory; Pennanen, Taina. 2016. Accurate estimation of fungal diversity and abundance through improved lineage-specific primers optimized for Illumina amplicon sequencing. Applied and Environmental Microbiology 82 24: 7217-7226.

Huusko, Karoliina; Tarvainen, Oili; Saravesi, Karita; Pennanen, Taina; Fritze, Hannu; Kubin, Eero; Markkola, Annamari. 2015. Short-term impacts of energy wood harvesting on ectomycorrhizal fungal communities of Norway spruce saplings. The ISME Journal 9 3: 581-591.

Klavina, Darta; Zaluma, Astra; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa M.; Gaitnieks, Talis; Gailis, Arnis; Menkis, Audrius. 2015. Seed provenance impacts growth and ectomycorrhizal colonisation of Picea abies seedlings. Baltic Forestry 21 2:

Llorens-Blanch, Guillem; Badia-Fabregat, Marina; Lucas, Daniel; Rodriguez-Mozaz, Sara; Barceló, Damiá; Pennanen, Taina; Caminal, Gloria; Blánquez, Paqui. 2015. Degradation of pharmaceuticals from membrane biological reactor sludge with Trametes versicolor. Environmental Science : Processes & Impacts 17: 429-440.

Peltoniemi, Krista; Laiho, Raija; Juottonen, Heli; Kiikkilä, Oili; Mäkiranta, Päivi; Minkkinen, Kari; Pennanen, Taina; Penttilä, Timo; Sarjala, Tytti; Tuittila, Eeva-Stiina; Tuomivirta, Tero; Fritze, Hannu. 2015. Microbial ecology in a future climate: effects of temperature and moisture on microbial communities of two boreal fens. FEMS Microbiology Ecology 91 7: Article number: fiv062.

Rajala, Tiina; Tuomivirta, Tero; Pennanen, Taina; Mäkipää, Raisa. 2015. Habitat models of wood-inhabiting fungi along a decay gradient of Norway spruce logs. Fungal ecology 18: 48-55.

Vaario, Lu-Min; Pennanen Taina, Lu Jinrong, Palmén Jorma, Stenman Jarkko, Leveinen Jussi, Kilpeläinen Petri, Kitunen Veikko 2015. Tricholoma matsutake can absorb and accumulate trace elements directly from rock fragments in the shiro. Mycorrhiza 25. 10 s.

Vuorinen, Irmeli; Hamberg, Leena; Müller, Michael; Seiskari, Pekka; Pennanen, Taina. 2015. Development of growth media for solid substrate propagation of ectomycorrhizal fungi for inoculation of Norway spruce (Picea abies) seedlings. Mycorrhiza 25 4: 311-324.

Rajala, T., Velmala, S.M., Vesala, R., Smolander, A. & Pennanen, T. 2014. The community of needle endophytes reflects the current physiological state of Norway spruce. Fungal Biology 118: 309-315.

Valentín, L., Rajala, T., Peltoniemi, M., Heinonsalo, J., Pennanen, T. & Mäkipää, R. 2014. Loss of diversity in wood-inhabiting fungal communities affects decomposition activity in Norway spruce wood. Frontiers in Terrestrial Microbiology 5: 230.

Velmala, S.M., Rajala, T., Heinonsalo, J., Taylor, A.F.S. & Pennanen, T. 2014. Profiling functions of ectomycorrhizal diversity and root structuring in seedlings of Norway spruce (Picea abies) with fast- and slow-growing phenotypes. New Phytologist 201: 610-622.

Velmala SM, Rajala T, Smolander A, Petäistö R-L, Lilja A & Pennanen T. 2014. Infection with foliar pathogenic fungi does not alter the receptivity of Norway spruce seedlings to ectomycorrhizal fungi. Plant and Soil 385(1-2): 329-342.

Hyder, R., Pennanen, T., Hamberg, L., Vainio, E.J., Piri, T. & Hantula, J. 2013. Two viruses of Heterobasidion confer beneficial, cryptic or detrimental effects to their hosts in different situations. Fungal Ecology 6(5): 387-396.

Lindahl, B., Nilsson, R.H., Tedersoo, L., Abarenkov, K., Bibartondo, M., Carlsen, T., Kjøller, R., Kõljalg,U., Pennanen, T., Rosendahl, S., Stenlid, J. & Kauserud, H. 2013. Fungal community analysis by high-throughput sequencing of amplified markers - a user's guide. New Phytologist 199: 288-299.

Rajala, T., Velmala, S.M., Tuomivirta, T., Haapanen, M., Müller, M. & Pennanen, T. 2013. Endophyte communities vary in the needles of Norway spruce clones. Fungal Biology 117(3): 182-190.

Velmala, S.M., Rajala, T., Haapanen, M., Taylor, A.F.S. & Pennanen, T. 2013. Genetic host-tree effects on the ectomycorrhizal community and root characteristics of Norway spruce. Mycorrhiza 23(1): 21-33.

Kataja-Aho, S., Pennanen, T., Lensu, A. & Haimi, J. 2012. Does stump removal affect early growth and mycorrhizal infection of spruce (Picea abies) seedlings in clear-cuts? Scandinavian Journal of Forest Research 27: 746-753.

Kähkölä, A.-K., Nygren, P., Leblanch, H.A., Pennanen, T. & Pietikäinen. J. 2012. Leaf and root litter of a legume tree as nitrogen sources for cacaos with different root colonisation by arbuscular mycorrhizae. Nutrient Cycling in Agroecosystems 92: 51-65.

Peltoniemi, K., Straková, P., Fritze, H., Iráizoz, P.A., Pennanen, T. & Laiho, R. 2012. How water-level drawdown modifies litter decomposing fungal and actinobacterial communities in boreal peatlands. Soil Biology & Biochemistry 51: 20-34.

Rajala, T., Peltoniemi, M., Pennanen, T. & Mäkipää, R. 2012. Fungal community dynamics in relation to substrate quality of decaying Norway spruce (Picea abies [L.] Karst.) logs in boreal forests. FEMS Microbiology Ecology 81(2): 494-505.

Vaario, L.-M., Heinonsalo, J., Spetz, P., Pennanen, T., Heinonen, J., Tervahauta, A. & Fritze, H. 2012. The ectomycorrhizal fungus Tricholoma matsutake is a facultative saprotroph in vitro. Mycorrhiza 22(6): 409-418.

Nieminen, M., Laurén, A., Hökkä, H., Sarkkola, S., Koivusalo, H. & Pennanen, T. 2011. Recycled iron phosphate as a fertilizer raw material for tree stands on drained boreal peatlands. Forest Ecology and Management 261: 105-110.

Rajala, T., Peltoniemi, M., Hantula, J., Mäkipää, R. & Pennanen, T. 2011. RNA reveals a succession of active fungi during the decay of Norway spruce logs. Fungal Ecology 4(6): 437-448.

Vaario, L.-M., Fritze, H., Spetz, P., Heinonsalo, J., Hanajík, P. & Pennanen, T. 2011. Tricholoma matsutake dominates diverse microbial communities in different forest soils. Applied and Environmental Microbiology 77(24): 8523-8531.

Abarenkov, K., Nilsson, R.H. Larsson, K.-H., Alexander, I.J., Eberhardt, U., Erland, S., Høiland, K., Kjøller, R., Larsson, E., Pennanen, T., Sen, R., Taylor, A.F.S., Tedersoo, L., Ursing, B.M., Vrålstad, T., Liimatainen K., Peintner, U. & Kõljalg, U. 2010. The UNITE database for molecular identification of fungi - recent updates and future perspectives. New Phytologist 186(2): 281-285.

Kalliokoski, T., Pennanen, T., Nygren, P., Sievänen, R. & Helmisaari, H.-S. 2010. Belowground interspecific competition in mixed boreal forests: fine root and ectomycorrhiza characteristics along stand developmental stage and soil fertility gradients. Plant and Soil 330: 73-89.

Ovaskainen, O., Nokso-Koivisto, J., Hottola, J., Rajala, T., Pennanen, T., Ali-Kovero, H., Miettinen, O., Oinonen, P., Auvinen, P., Paulin, L., Larsson, K.-H. & Mäkipää, R. 2010. Identifying wood-inhabiting fungi with 454 sequencing - What is the probability that BLAST gives the correct species? Fungal Ecology 3: 274-283.

Rajala, T., Peltoniemi, M., Pennanen, T. & Mäkipää, R. 2010. Relationship between wood-inhabiting fungi determined by molecular analysis (denaturing gradient gel electrophoresis) and quality of decaying logs. Canadian Journal of Forest Research 40: 2384-2397.

Vaario, L.-M., Pennanen, T., Sarjala, T., Savonen, E.-M. & Heinonsalo, J. 2010. Ectomycorrhization of Tricholoma matsutake and two major conifers in Finland - An assessment of in vitro mycorrhiza formation. Mycorrhiza 20: 511-518.

Vaario, L.-M., Tervonen, A., Haukioja, K., Haukioja, M., Pennanen, T. & Timonen, S. 2009. The effect of nursery substrate and fertilization on the growth and ectomycorrhizal status of containerized and outplanted seedlings of Picea abies. Canadian Journal of Forest Research 39(1): 64-75.

Bidartondo, M.I. et al. 2008. Preserving accuracy in GenBank (Letters -osiossa). Science 319: 1616.

Flykt, Enni; Timonen, Sari; Pennanen, Taina. 2008. Variation of ectomycorrhizal colonization of spruce seedlings in Finnish forest nurseries. Silva Fennica 42 4: 571-585.

Jaatinen, K., Laiho, R., del Castillo, U., Vuorenmaa, A., Minkkinen, K., Pennanen, T., Penttilä, T. & Fritze, H. 2008. Responses of aerobic microbial communities and soil respiration to water-level drawdown in a northern boreal fen. Environmental Microbiology 10: 339-353.

Korkama-Rajala, T., Müller, M.M. & Pennanen, T. 2008. Decomposition and fungi of needle litter from slow- and fast-growing Norway spruce (Picea abies) clones. Microbial Ecology 56: 76-89.

Rantalainen, M.-L., Haimi, J., Fritze, H., Pennanen, T. & Setälä, H. 2008. Soil decomposer community as a model system in studying the effects of habitat fragmentation and habitat corridors. Soil Biology & Biochemistry 40: 853-863.

Korkama, T., Fritze, H., Kiikkilä, O. & Pennanen, T. 2007. Do same-aged but different height Norway spruce (Picea abies) clones affect soil microbial community? Soil Biology & Biochemistry 39(9): 2420-2423.

Korkama, T., Fritze, H., Pakkanen, A. & Pennanen, T. 2007. Interactions between extraradical ectomycorrhizal mycelia, microbes associated with the mycelia and growth rate of Norway spruce (Picea abies) clones. New Phytologist 173: 798-807.

Korkama, T., Pakkanen, A. & Pennanen, T. 2006. Ectomycorrhizal community structure varies among Norway spruce (Picea abies) clones. New Phytologist 171(4): 815-824.

Kõljalg, U., Larsson, K.-H., Abarankov, K., Nilsson, H.R., Alexander, I., Eberhardt, U., Erland, S., Hoiland, K., Kjøller, R., Larsson, E., Pennanen, T., Sen, R., Taylor, A.F.S., Tedersoo, L., Vrålstad, T. & Ursing, B.M. 2005. UNITE - a database providing web-based methods for the molecular identification of ectomycorrhizal fungi. New Phytologist 166(3): 1063-1068.

Pennanen, T., Heiskanen, J. & Korkama, T. 2005. Dynamics of ectomycorrhizal fungi and growth of Norway spruce seedlings after planting on a mounded forest clearcut. Forest Ecology and Management 213: 243-252.

Rantalainen, M.-L., Fritze, H., Haimi, J., Pennanen, T. & Setälä, H. 2005. Colonisation of newly established habitats by soil decomposer organisms: the effect of habitat corridors in relation to colonisation distance and habitat size. Applied Soil Ecology 28: 67-77.

Rantalainen, M.-L., Fritze, H., Haimi, J., Pennanen, T. & Setälä, H. 2005. Species richness and food web structure of soil decomposer community as affected by the scale of habitat fragmentation and habitat corridors. Global Change Biology (online) 11: 1614-1627.

Pennanen, T., Caul, S., Daniell, T.J., Griffiths, B.S., Ritz, K. & Wheatley, R.E. 2004. Community-level responses of metabolically-active soil microorganisms to the quantity and quality of substrate inputs. Soil Biology & Biochemistry 36(5): 841-848.

Rantalainen, M.-L., Fritze, H., Haimi, J., Kiikkilä, O., Pennanen, T. & Setälä, H. 2004. Do enchytraeid worms and habitat corridors facilitate the colonisation of habitat patches by soil microbes? Biology and Fertility of Soils 39: 200-208.

Kiikkilä, O., Pennanen, T., Perkiömäki, J., Derome, J. & Fritze, H. 2002. Organic material as a copper immobilising agent: a microcosm study on bioremediation. Basic and Applied Ecology 3(3): 245-253.

Liiri, M., Setälä, H., Haimi, J., Pennanen, T. & Fritze, H. 2002. Relationship between soil microarthropod species diversity and plant growth does not change when the system is disturbed. Oikos 96: 137-149.

Liiri, M., Setälä, H., Haimi, J., Pennanen, T. & Fritze, H. 2002. Soil processes are not influenced by the functional complexity of soil decomposer food webs under disturbance. Soil Biology & Biochemistry 34(7): 1009-1020.

Fritze, H., Perkiömäki, J., Petänen, T., Pennanen, T., Romantschuck, M., Karp, M. & Yrjälä, K. 2001. A microcosmos study on the effects of Cd-containing wood ash on the coniferous forest humus fungal community and Cd bioavailability. Journal of Soils and Sediments 1(3): 146-150.

Kiikkilä, O., Perkiömäki, J., Barnette, M., Derome, J., Pennanen, T., Tulisalo, E. & Fritze, H. 2001. In situ bioremediation through mulching of soil polluted by a copper-nickel smelter. Journal of Environmental Quality 30: 1134-1143.

Liiri, M., Setälä, H., Haimi, J., Pennanen, T. & Fritze, H. 2001. Influence of Cognettia spaghnetorum (Enchytraeidae) on birch growth and microbial activity, composition and biomass in soil with or without wood ash. Biology and Fertility of Soils 34: 185-195.

Pennanen, T. 2001. Microbial communities in boreal coniferous forest humus exposed to heavy metals and changes in soil pH - a summary of the use of phospholipid fatty acids, Biologâ and 3H-thymidine incorporation methods in field studies. Geoderma 100: 91-126.

Pennanen, T., Paavolainen, L, & Hantula, J. 2001. Rapid PCR-based method for the direct analysis of fungal communities in complex environmental samples. Soil Biology & Biochemistry 33: 697-699.

Pennanen, T., Strömmer, R., Markkola, A. & Fritze, H. 2001. Microbial and plant community structure across a primary succession gradient. Scandinavian Journal of Forest Research 16: 37-43.

Priha, O., Grayston, S.J., Hiukka, R., Pennanen, T. & Smolander, A. 2001. Microbial community structure and characteristics of the organic matter in soils under Pinus sylvestris, Picea abies and Betula pendula at two forest sites. Biology and Fertility of Soils 33: 17-24.

Fritze, H., Pietikäinen, J. & Pennanen, T. 2000. Distribution of microbial biomass and phospholipid fatty acids in Podzol profiles under coniferous forest. European Journal of Soil Science 51: 565-573.

Kiikkilä, O., Pennanen, T., Pietikäinen, J. & Fritze, H. 2000. Some observations on the copper tolerance of bacterial communities using the 3H-thymidine incorporation method in heavy metal polluted humus. Soil Biology & Biochemistry 32: 883-885.

Fritze, H., Tikka, P., Pennanen, T., Saano, A., Jurgens, A., Nilsson, M., Bergman, I. & Kitunen, V. 1999. Detection of Archaeal diether lipid by gas chromatography from humus and peat. Scandinavian Journal of Forest Research 14: 545-551.

Ohtonen, R., Fritze, H., Pennanen, T., Jumpponen, A. & Trappe, T. 1999. Ecosystem properties and microbial community changes in primary succession on a glacier forefront. Oecologia 119(2): 239-246.

Pennanen, T., Liski, J., Bååth, E., Kitunen, V., Uotila, J., Westman, C.-J. & Fritze, H. 1999. Structure of the microbial communities in coniferous forest soils in relation to site fertility and stand development stage. Microbial Ecology 38: 168-179.

Priha, O., Grayston, S.J., Pennanen, T. & Smolander, A. 1999. Microbial activities related to C and N cycling and microbial community structure in the rhizospheres of Pinus sylvestris, Picea abies and Betula pendula seedlings in an organic and mineral soil. FEMS Microbiology Ecology 30: 187-199.

Fritze,, H., Pennanen, T. & Kitunen, V. 1998. Characterization of dissolved organic carbon from burned humus and its effects on microbial activity and community structure. Soil Biology & Biochemistry 30(6): 687-693.

Pennanen, T., Fritze, H., Vanhala, P., Kiikkilä, O., Neuvonen, S. & Bååth, E. 1998. Structure of a microbial community in soil after prolonged addition of low levels of simulated acid rain. Applied and Environmental Microbiology 64(6): 2173-2180.

Pennanen, T., Perkiömäki, J., Kiikkilä, O., Vanhala, P., Neuvonen, S. & Fritze, H. 1998. Prolonged, simulated acid rain and heavy metal deposition: separated and combined effects on forest soil microbial community structure. FEMS Microbiology Ecology 27: 291-300.

Kortemaa, H., Pennanen, T., Smolander, A. & Haahtela, K. 1997. Distribution of antagonistic Streptomyces griseoviridis in rhizosphere and non-rhizosphere sand. Journal of Phytopathology 145: 137-143.

Pennanen, T., Frostegård, Å., Fritze, H. & Bååth, E. 1996. Phospolipid fatty acid composition and heavy metal tolerance of soil microbial communities along two heavy metal-polluted gradients in coniferous forests. Applied and Environmental Microbiology 62(2): 420-428.

Bååth, E., Frostegård, Å., Pennanen, T. & Fritze, H. 1995. Microbial community structure and pH response in relation to soil organic matter quality in wood-ash fertilized, clear-cut or burned coniferous forest soil. Soil Biology & Biochemistry 27(2): 229-240.

Rönkkö, R., Pennanen, T., Smolander, A., Kitunen, V., Kortemaa, H. & Haahtela, K. 1994. Quantification of Frankia strains and other root-associated bacteria in pure cultures and in the rhizosphere of axenic seedlings by high-performance liquid chromatography-based muramic acid assay. Applied and Environmental Microbiology 60(10): 3672-3678.

A2 Review article in a scientific journal (refereed)

Bakker, Mark R.; Brunner, Ivano; Ashwood, Francis; Bjarnadottir, Brynhildur; Bolger, Tom; Børja, Isabella; Carnol, Monique; Cudlin, Pavel; Dalsgaard, Lise; Erktan, Amandine; Godbold, Douglas; Kraigher, Hojka; Meier, Ina C.; Merino-Martín, Luis; Motiejūnaitė, Jurga; Mrak, Tanja; Oddsdóttir, Edda S.; Ostonen, Ivika; Pennanen, Taina L.; Püttsepp, Ülle; Suz, Laura M.; Vanguelova, Elena I.; Vesterdal, Lars; Soudzilovskaia, Nadejda A. 2019. Belowground Biodiversity Relates Positively to Ecosystem Services of European Forests. Frontiers in Forests and Global Change 2: 23 p.

Nilsson, R.H., Tedersoo, L., Lindahl, B., Kjøller, R., Carlsen, T., Quince C., Abarenkov, K., Pennanen, T., Stenlid, J., Bruns, T., Larsson, K.-H., Kõljalg, U. & Kauserud, H. 2011. Towards standardization of the description and publication of next-generation sequencing datasets of fungal communities. New Phytologist 191: 314-319.

A3 Part of a book or another research book (refereed)

Fritze,, H., Pennanen, T. & Vanhala, P. 1997. Impact of fertilizers on the humus layer microbial community of Scots pine stands growing along a gradient of heavy metal pollution. In: Insam, H. & Rangger, A. (eds.). Microbial communities: Functional versus structural approaches. Springer-Verlag, Berlin. p. 68-83.

B1 Article in a scientific magazine (non-refereed)

Baldrian, Petr; Pennanen, Taina; Kohout, Petr; Fritze, Hannu. 2024. Editorial: Theme issue on the ecology of soil microorganisms. Fems microbiology ecology 100 4: 3 p.

Rajala, Tiina; Peltoniemi, Mikko; Valentin-Carrera, Lara; Pennanen, Taina; Mäkipää, Raisa. 2012. Sienidiversiteetin merkitys puiden lahoamisprosessissa ja taimien kasvussa. Metsätieteen aikakauskirja 2: 142-146.

Pennanen, Taina; Müller, Michael. 2011. Kuusentaimien juuristosienet ja niiden merkitys taimien alkukehitykselle. Metsätieteen aikakauskirja 1: 60-62.

Timonen, Sari; Pennanen, Taina. 2008. Kuusentaimien sienijuurien määrä ja laatu suomalaisilla metsätaimitarhoilla. Metsätieteen aikakauskirja 4: 318.

B2 Part of a book or another research book (non-refereed)

Pennanen, Taina. 2018. Pintasienijuuria muodostavat sienilajit Suomessa. In: Rihman kiertämät – Kasvien ja sienten erottamaton elämä / M. VestbergS. Timonen (toim.). MAKS Press. s. 51-59.

Fritze, H., Pennanen, T., Haimi, J., Siira-Pietikäinen, A. & Vanhala, P. 2000. Effects of heavy metals on soil microflora. In: Mälkönen, E. (ed.). Forest condition in a changing environment - the Finnish case. Forestry Sciences, Vol. 65. Kluwer Academic Publishers. p. 260-265.

Pennanen, T., Vanhala, P., Kiikkilä, O. & Fritze, H. 2000. Effects of acidic deposition on forest soil microbiology. In: Mälkönen, E. (ed.). Forest condition in a changing environment - the Finnish case. Forestry Sciences, Vol. 65. Kluwer Academic Publishers. p. 200-202.

B3 Non-refereed article in conference proceedings

Vaario, L.-M., Heinonsalo, J., Spetz, P., Pennanen, T. & Fritze, H. 2011. Tricholoma matsutake - an ectomycorrhizal fungus, lives between symbiotic and saprophytic when need arises. In: Proceedings of the 7th International Conference on Mushroom Biology and Mushroom Products, 4-7 October, 2011, Arcachon, France. Vol. 1. p. 500-505.

D1 Article in a trade journal

Fritze, Hannu; Peltoniemi, Krista; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Hultman, Jenni; Korpela, Leila; Tarvainen, Oili; Karhu, Jouni; Laurila, Marika; Kangas, Katja. 2024. Monipuolisia mikrobiyhteisöjä, vanhoja ystäviä. Viherympäristö 5: s. 46-49.

Pennanen, Taina. 2023. How changes in the soil microbiome can impact our climate, food chains and human health. Agro food industry hi-tech 34 2:

Suojala-Ahlfors, Terhi; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Latvala, Satu; Karisto, Petteri; Haapalainen, Minna; Kivijärvi, Pirjo. 2023. Goda eller skadliga mikrober i marken påverkar hållbarheten. Trädgårdsnytt 10/2023: 10-11.

Suojala-Ahlfors, Terhi; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Kivijärvi, Pirjo; Haapalainen, Minna. 2022. Monipuoliset mikrobiyhteisöt auttavat kasvitautien hallinnassa. Puutarha & kauppa 26 5: 22-23.

Suojala-Ahlfors, Terhi; Pennanen, Taina; Haapalainen, Minna; Hannukkala, Asko; Kivijärvi, Pirjo; Velmala, Sannakajsa. 2020. Mikrobiyhteisöt tarkasteluun porkkanapelloilla. Puutarha & kauppa 24 8/2020: s. 27.

Pennanen, Taina; Tahvonen, Raija. 2018. Korvaamattomat mikrobit. Pähkylä 2/2018:

Pennanen, Taina; Vainio, Eeva; Hyder, Rafiqul; Hamberg, Leena; Piri, Tuula; Hantula, Jarkko. 2014. Juurikäävän torjuntaan etsitään uusia menetelmiä. In: Taimiuutiset 2/2014. Taimiuutiset 17 2: 12-13.

Pennanen, T. 2010. Kuinka monta kilometriä sienirihmastoa on puissa? Metsäntutkimus 14 1: 31.

Timonen, S. & Pennanen, T. 2009. Viisas asiakas tarkastaa metsätaimen juuret. Metsälehti 3: 22.

Hantula, Jarkko; Pennanen, T. 2008. Mistä johtuu sienien erilaisuus? Metsäntutkimus 12 1: 26-27.

Pennanen, Taina; Müller, Michael; Timonen, Sari. 2008. Juuri/verso-suhde ja mykorritsoituminen vaikuttavat kuusentaimien kasvuun istutuksen jälkeen. In: Taimiuutiset 2/2008. Taimiuutiset 11 2: 9-10.

Timonen, S. & Pennanen, T. 2007. Sienet, metsien avohakkuut ja kannonnosto. Forest fungi, clear cutting and stump removal. Sienilehti 59(2): 54-58.

Pennanen, Taina; Müller, Michael. 2004. Mykorritsasienet metsätaimitarhoilla. In: Taimiuutiset 2/2004. Taimiuutiset 7 2: 4-6.

Pennanen, T. & Müller, M. 2002. Mykorritsasiirroksella elinvoimaa kuusentaimille? Inocula 1: 13-14.

Müller, Michael; Pennanen, Taina; Rikala, Risto. 2001. Metlassa käynnistetyn tutkimushankkeen tavoitteena mykorritsasiirros kuusentaimille. In: Taimiuutiset 3/2001. Taimiuutiset 4 3: 10-11.

Pennanen, T. & Fritze, H. 1998. Raskasmetallit vaurioittavat maaperän pieneliöstöä. Heavy metals have disturbed the soil biota. Ilmansuojelu 2: 11-12.

Pennanen, T. 1994. Tymidiini-inkorporaatio maaperäbakteerien kasvunopeuden kuvaajana. Inocula 1.

D2 Article in professional manuals or guides or professional information systems or text book material

Muilu-Mäkelä, Riina; Martz, Francoise; Hagner, Marleena; Pennanen, Taina; Yli-Hemminki, Pirjo; Palojärvi, Ansa. 2024. Biostimulants and biopestisides from plant-based biomass. In: Valuable biochemicals of the future : The outlook for bio-based value-added chemicals and their growing markets. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 85/2024: s. 27-30.

Lehto, Tarja; Pennanen, Taina. 2023. 9. Sienisadot muuttuvassa maailmassa. In: Metsätuhot vuonna 2022. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 48/2023: s. 40-41.

Nissinen, Anne; Pennanen, Taina; Suojala-Ahlfors, Terhi. 2023. 4. Johtopäätökset: biologisten torjuntamenetelmien hyödyntämismahdollisuudet tulevaisuudessa. In: Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 111/2023: s. 40-41.

Suojala-Ahlfors, Terhi; Nissinen, Anne; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Latvala, Satu; Karisto, Petteri; Kivijärvi, Pirjo; Haapalainen, Minna; Pirhonen, Minna. 2023. Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä - 1. Johdanto. In: Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 111/2023: s. 5-6.

Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Suojala-Ahlfors, Terhi; Latvala, Satu; Karisto, Petteri; Kivijärvi, Pirjo; Haapalainen, Minna; Pirhonen, Minna; Adamczyk, Sylwia; Jääskeläinen, Oona. 2023. 3. Porkkanan varastotautien hallinta mikrobien avulla. In: Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 111/2023: s. 16-39.

Keskitalo, Marjo; Känkänen, Hannu; Palojärvi, Ansa; Pennanen, Taina; Schulman, Alan; Tanhuanpää, Pirjo; Viitala, Sirja. 2022. 4. Biologiset prosessit kasvin typensaannin turvaajana. In: Maatalouden typpihaaste – vaihtoehtoja ja ratkaisuja : Synteesiraportti. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 53/2022: 34-45.

Pennanen, Taina; Timonen, Sari; Heinonsalo, Jussi. 2018. Pintasienijuuret ja metsätalous. In: Rihman kiertämät – Kasvien ja sienten erottamaton elämä / M. VestbergS. Timonen (toim.). MAKS Press. s. 217-229.

Pennanen, T. & Timonen, S. 2013. Sienten bakteerit. Julkaisussa: Timonen, S. & Valkonen, J. (toim.). Sienten biologia. Gaudeamus, Helsinki. s. 321-329.

Derome, J., Fritze, H., Heiskanen, J., Helmisaari, H.-S., Levula, T., Mälkönen, E., Pennanen, T., Saarsalmi, A., Smolander, A., Starr, M. & Tamminen, P. 1999. Vastanneet anonyymeina julkaisun 'Näytteenotto metsämaan ominaisuuksien määrittämistä varten' (Metsäntutkimuslaitoksen tiedonantoja 729, 54 s., toim. Tamminen P. & Mälkönen, E.) artikkeleiden kirjoittamisesta.

D4 Published development or research report or study

Muilu-Mäkelä, Riina; Brännström, Hanna; Weckroth, Mikko; Kohl, Johanna (Eds.) 2024. Valuable biochemicals of the future : The outlook for bio-based value-added chemicals and their growing markets. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 85/2024: 85 p. Luonnonvarakeskus

Haavisto, Teija (Eds.) 2023. Suomen maaperän seuranta, tila ja käytön ohjauskeinot. Ympäristöministeriön julkaisuja 2023 33: 255 s. Ympäristöministeriö

Suojala-Ahlfors, Terhi (Eds.) 2023. Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 111/2023: 45 s. Luonnonvarakeskus

Sutela, Suvi; Kykkänen, Sanna; Semberg, Sanni; Pennanen, Taina; Terhonen, Eeva. 2023. Hankkeen A78729 TP1 raportti: Tummaväliseinäisten sienien hyötykäyttömahdollisuudet kasvien terveyden edistämisessä ja hiilensidonnassa. 12 s. Luonnonvarakeskus

Terhonen, Eeva; Melin, Markus (Eds.) 2023. Metsätuhot vuonna 2022. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 48/2023: 98 s. Luonnonvarakeskus

Vainio, Eeva; Merilä, Päivi; Ilvesniemi, Hannu; Kekkonen, Hanna; Mäkipää, Raisa; Nieminen, Tiina M.; Pennanen, Taina; Tolvanen, Anne. 2023. Three key messages concerning the proposal for EU Soil Monitoring Law. Luke Position paper: 4 p.

Vainio, Eeva (Eds.) 2022. Maatalouden typpihaaste – vaihtoehtoja ja ratkaisuja : Synteesiraportti. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 53/2022: 68 s. Luonnonvarakeskus (Luke)

Norros, Veera; Laamanen, Tiina; Meissner, Kristian; Iso-Touru, Terhi; Kahilainen, Aapo; Lehtinen, Sirpa; Lohtander-Buckbee, Katileena; Nygård, Henrik; Pennanen, Taina; Ruohonen-Lehto, Marja; Sirkiä, Päivi; Suikkanen, Sanna; Tolkkinen, Mikko; Vainio, Eeva; Velmala, Sannakajsa; Vuorio, Kristiina; Vihervaara, Petteri. 2022. Roadmap for implementing environmental DNA (eDNA) and other molecular monitoring methods in Finland–Vision and action plan for 2022–2025. Reports of the Finnish Environment Institute 20/2022: 74 p.

D6 Edited professional books

Leppälammi-Kujansuu, Jaana; Pennanen, Taina; Rankinen, Katri; Salo, Tapio; Soinne, Helena; Hänninen, Pekka (Eds.) 2017. Maaperä kiertotalouden perustana : IX Maaperätieteiden päivien abstraktit. Pro Terra 71: 102 p. Suomen Maaperätieteiden Seura

Leppälammi-Kujansuu, Jaana; Pennanen, Taina; Rankinen, Katri; Salo, Tapio; Soinne, Helena; Hänninen, Pekka (Eds.) 2015. VIII Maaperätieteiden päivien abstraktit. Pro Terra 67: 108 p. Suomen Maaperätieteiden Seura, Helsingin yliopisto, Elintarvike- ja ympäristötieteiden laitos

E1 Popularised article, newspaper article

Pennanen, T. & Timonen, S. 2003. Yksinäinen taimi etsii luotettavaa mikrobiseuraa (vierasyliö). Maaseudun Tulevaisuus 20.1.

G5 Doctoral dissertation (article)

Pennanen, T. 1998. Structure of the microbial communities in boreal coniferous forest humus exposed to heavy metals and changes in soil pH. Helsingin yliopisto, biotieteiden laitos. Väitöskirja. 49 s. + 6 osajulk.

M1 Texts about research activities

Pennanen, Taina; Fritze, Hannu. 2015. Kuinka tutkia maaperän mikrobiston monimuotoisuutta? Luonnonvarakeskus

M2 Presentation or poster

Kiheri, Heikki; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Timonen, Sari; Sietiö, Outi-Maaria; Heinonsalo, Jussi; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Fritze, Hannu; Larmola, Tuula. 2018. Effects of 15 Years of Nutrient Addition on Ericoid Mycorrhizal Colonization at Whim Bog. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 133.

Kiheri, Heikki; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Timonen, Sari; Sietiö, Outi-Maaria; Heinonsalo, Jussi; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Fritze, Hannu; Larmola, Tuula. 2018. Pitkäaikaisen typpilannoituksen vaikutukset varpujen sienijuuriin karulla Whim-suolla. In: Suopäivä 2018 : abstraktikirja. Suoseura. p. 48.

Larmola, Tuula; Kiheri, Heikki; Bubier, Jill L.; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Hobbie, Erik A.; Moore, Tim R.; Pennanen, Taina; Timonen, Sari. 2018. Do foliar 15N patterns indicate shifts in mycorrhizal abundance and function under nutrient load? In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 139.

Larmola, Tuula; Kiheri, Heikki; Bubier, Jill L.; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Hobbie, Erik A.; Moore, Tim R.; Pennanen, Taina; Timonen, Sari. 2018. Do foliar δ15N patterns indicate shifts in the mycorrhizal abundance and function under nutrient load? Geophysical Research Abstracts 20: 1 p.

Peltoniemi, Krista; Fritze, Hannu; Pennanen, Taina; Penttilä, Timo; Sarjala, Tytti; Adamczyk, Sylwia; Laiho, Raija. 2018. Fungal biomass and species composition in boreal peatland forests estimated by in-growth mesh bag method. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 163.

Pennanen, Taina; Hamberg, Leena; Salmela, Matti; Sievänen, Risto; Velmala, Sannakajsa. 2018. The mycorrhiza-root interphase of spruce is under genetic control of the host and adaptive to soil characteristics. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 53.

Vainio, Eeva; Piri, Tuula; Hyder, Rafiqul; Pennanen, Taina; Hantula, Jarkko. 2018. Virus communities of forest fungi inhabiting decomposing wood and tree roots. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 66.

Velmala, Sannakajsa; Salmela, Matti; Hamberg, Leena; Hölttä, Teemu; Chan, Tommy; Pennanen, Taina. 2018. Fine root foraging strategies of Norway spruce seedlings with contrasting future phenotypes in response to nutrient-rich patches. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 51.

Larmola, Tuula; Kiheri, Heikki; Fritze, Hannu; Laiho, Raija; Pennanen, Taina; Hobbie, Erik A.; Bubier, Jill L.; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Moore, Tim R.; Nilsson, Mats B.; Talbot, Julie. 2017. Typpilaskeuman vaikutus soiden hiilen sidontaan ja ravinnekiertoon: varpu-sieni vuorovaikutuksen merkitys. In: Maaperä kiertotalouden perustana : IX Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 71: p. 57.

Mäkipää, Raisa; Pennanen, Taina; Rajala, Tiina; Schigel, Dmitry; Rinne, Katja T.; Ovaskainen, Otso. 2017. Interaction between soil- and dead wood-inhabiting fungi of an unmanaged Norway spruce stand. In: Maaperä kiertotalouden perustana : IX Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 71: p. 58.

Velmala, Sannakajsa; Hamberg, Leena; Sievänen, Risto; Kalliokoski, Tuomo; Pennanen, Taina. 2017. Early root growth and architecture of seedlings of fast- and slow-growing Norway spruce families. In: Maaperä kiertotalouden perustana : IX Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 71: p. 17.

Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Rajala, Tiina; Vuorinen, Irmeli; Vaario, Lu-Min. 2015. Symbionttiset pintajuurisienet ja kuusentaimien kasvu. In: VIII Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 67: p. 84-85.

Pennanen, T.; Velmala, S. M.; Rajala, T. 2015. Atheliaceae fungi are potential keystone species building up the belowground growth of Norway spruce. In: 8th International conference on mycorrhizasAugust 3-72015Northern Arizona university : ICOM 8 paper and poster abstracts. Northern Arizona University. p. 138.

Rajala, Tiina; Tuomivirta, Tero; Schiegel, Dmitry; Pennanen, Taina; Ovaskainen, Otso; Mäkipää, Raisa. 2015. Decaying wood harbors high fungal diversity in boreal forests. In: Towards a new era of forest science in the boreal region : abstracts of the 17th IBFRA conference May 24–29, 2015, Rovaniemi, Finland / Raisa Mäkipää and Tuire Kilponen (eds.). Natural resources and bioeconomy studies 29/2015: p. 110.

Vainio, Eeva; Pennanen, Taina; Rajala, Tiina; Hantula, Jarkko. 2015. Common viruses in pathogenic, mycorrhizal and saprotrophic fungal species in a boreal forest. In: Ecology of soil microorganisms 2015November 29 - December 32015PragueCzech Republic : book of abstracts. Institute of Microbiology. 1 p.

Velmala, Sannakajsa; Rajala, Tiina; Pennanen, Taina. 2015. Yhteyttä etsimässä: Sienijuurisymbioosin vaikutus kuusen kasvuun. In: VIII Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 67: p. 39-40.

Velmala, S. M.; Rajala, T.; Pennanen, T. 2015. Function by form - a tentative insight to the link between growth and the diversity of ectomycorrhizal fungi. In: 8th International conference on mycorrhizasAugust 3-72015Northern Arizona university : ICOM 8 paper and poster abstracts. Northern Arizona University. p. 191.

Haimi, J., Kataja-Aho, S., Fritze, H., Pennanen, T. & Smolander, A. 2013. Kantojen korjuun vaikutukset maaperän biologiaan ja kasvillisuuteen. Julkaisussa: Leppälammi-Kujansuu, J., Soinne, H., Merilä, P., Rankinen, K., Salo, T. & Hänninen, P. (toim.). Maankäytön kestävyys. VII Maaperätieteiden päivien abstraktit. Pro Terra 61: 14.

Vuorinen, I., Velmala, S., Rajala, T., Piri, T. & Pennanen, T. 2013. Symbionttiset juuristosienet ja kuusentaimien kasvu. Julkaisussa: Leppälammi-Kujansuu, J., Soinne, H., Merilä, P., Rankinen, K., Salo, T. & Hänninen, P. (toim.). Maankäytön kestävyys. VII Maaperätieteiden päivien abstraktit. Pro Terra 61: 66.

Vaario, L.-M., Kiikkilä, O., Hamberg, L. & Pennanen, T. 2012. Impacts of soil microbial community and litter layer on Tricholoma matsutake shiro formation. In: BIT's 2nd Annual World Congress of Microbes. 30th of July - 1st of August 2012, Guangzhou, China. Abstracts. p. 238.

Lu, J., Pennanen, T. & Vaario, L.-M. 2011. The fungal community structure in stone samples within Tricholoma matsutake shiro. In: Metsätieteen päivä 26.10.2011: Metsäsektorin laajenevat vastuut. Suomen Metsätieteellinen Seura, Helsinki. p. 33.

Rajala, T., Peltoniemi, M., Pennanen, T. & Mäkipää, R. 2011. Sienilajiston suhde lahoavan puun ominaisuuksiin. Julkaisussa: Metsätieteen päivä 26.10.2011: Metsäsektorin laajenevat vastuut. Suomen Metsätieteellinen Seura, Helsinki. s. 35.

Rajala, T., Peltoniemi, M., Pennanen, T. & Mäkipää, R. 2011. Sienilajiston sukkessio lahoavilla kuusirungoilla. Julkaisussa: Soinne, H., Kähkönen, M., Merilä, P., Rankinen, K., Salo, T. & Hänninen, P. (toim.). Mieli maassa - maa mielessä. VI Maaperätieteiden päivien abstraktit. Pro Terra 52: 48-49.

Valentin, L., Rajala, T., Pennanen, T. & Mäkipää, R. 2011. Fungal community composition affects the rate of decomposition in Picea abies woody substrate. Julkaisussa: Metsätieteen päivä 26.10.2011: Metsäsektorin laajenevat vastuut. Suomen Metsätieteellinen Seura, Helsinki. s. 34.

Vuorinen, I., Velmala, S., Rajala, T., Piri, T. & Pennanen, T. 2011. Symbionttiset juuristosienet kuusentaimien kasvun tukena. Julkaisussa: Metsätieteen päivä 26.10.2011: Metsäsektorin laajenevat vastuut. Suomen Metsätieteellinen Seura, Helsinki. s. 32.

Pennanen, T., Müller, M., Vaario, L.-M. & Timonen, S. 2010. Kuusen taimitarhataimien juuristosienien monimuotoisuus ja taimien kasvu istutuksen jälkeen. Julkaisussa: Luonnon monimuotoisuus ja metsien kestävä käyttö. Metsätieteen päivä, 4.11.2010, Helsinki. s. 13.

Vaario, L.-M., Fritze, H., Sarjala, T., Savonen, E. & Pennanen, T. 2010. Structure of fungal and actinobacterial communities in the soil dominated by Tricholoma matsutake. In: Abstracts of 13th International Symposium on Microbial Ecology, 22-27 August 2010, Seattle, WA, USA. p. PS.10.026.

Vaario, L.-M., Heinonsalo, J., Savonen, E.-M., Sarjala, T. & Pennanen, T. 2009. Evaluating the role of shiro formation of Tricholoma matsutake in situ. Identification of Matsutake shiro and its fungal community. In: Soinne, H., Helmisaari, H.-S., Hänninen, P., Kähkönen, M., Rankinen, K. & Esala, M. (eds.). Maaperä muuttuvassa maailmassa. V Maaperätieteiden päivät, Helsinki 8.-9.1.2009. Laajennetut abstraktit. Pro Terra 41: 34-35.

Hautamäki, N., Salemaa, M. & Pennanen, T. 2008. The ability of heather (Calluna vulgaris) to recolonize a heavy-metal polluted forest area. In: Kalogerakis, N., Fava, F. & Banwart, S.A. (eds.). 4th European BioRemediation Conference. Book of Abstracts. Technical University of Crete, p. 286.

Korkama, T., Fritze, H., Kiikkilä, O., Pakkanen, A. & Pennanen, T. 2005. Kuusen genotyyypin vaikutus ektomykorritsasieniyhteisöön ja maaperämikrobeihin. The impact of genotype of Norway spruce on ectomycorrhizal community and soil microbes. Julkaisussa: Siimes, K., Makkonen, K., Pietikäinen, J., Mattila, P., Penttinen, S. & Esala, M. (toim.). Maaperän vuorovaikutukset. III Maaperätieteiden päivien laajennetut abstraktit. Pro Terra 22: 55-56.

Potila, H., Pennanen, T., Fritze, H., Korkama, T., Hartman, M. & Sarjala, T. 2005. Onko lämpösummalla vaikutusta mikrobiyhteisön rakenteeseen ojitetulla turvemaalla? Does temperature sum affect microbial community on drained peatlands? Julkaisussa: Siimes, K., Makkonen, K., Pietikäinen, J., Mattila, P., Penttinen, S. & Esala, M. (toim.). Maaperän vuorovaikutukset. III Maaperätieteiden päivien laajennetut abstraktit. Pro Terra 22: 31-32.

Pennanen, T., Korkama, T. & Heiskanen, J. 2002. Ectomycorrhizal fungi of Norway spruce seedlings after planting to mounded clear-cut forest. Julkaisussa: Pietola, L. & Esala, M. (toim.). Maa, josta elämme. II. Maaperätieteiden päivät, Helsinki 19.-20.11.2002. Laajennetut abstraktit. Pro Terra 15: 42-43.

Pennanen, T., Caul, S., Daniell, T.J., Ritz, K. & Wheatley, R. 2001. Community-level responses of soil microbes to variations in quantity and quality of substrate inputs. In: Interactions in the Microbial World. 9th International Symposium on Microbial Ecology, ISME-9, 26-31 August 2001, Amsterdam, The Netherlands. Final programme and abstracts. 1 p.

Liiri, M., Setälä, H., Haimi, J., Pennanen, T. & Fritze, H. 2000. Onko biodiversiteetillä merkitystä maaperäekosysteemissä? Julkaisussa: Pietola, L. (toim.). Maaperätieteet ihmiskunnan palveluksessa. Maaperätieteiden päivien laajennetut abstraktit. Pro Terra 4/2000: 80.

Pennanen, T., Tuomainen, M., Fritze, H., Hantula, J., Haimi, J., Tikka, P. & Setälä, H. 2000. Structure od the soil bacterial and fungal communities in the presence or absence of Cognettia sphagnetorum (Enchytraeidae) and ash fertilization. In: EUROSOIL 2000, University of Reading, 4-6 September, 2000. British Society of Soil Science. 1 p.

Pennanen, T., Ohtonen, R., Markkola, A. & Fritze, H. 1999. Primary soil formation and succession of microbial and plant communities. In: Interfacial Processes from the Molecular to the Global State, XIV International Symposium on Environmental Biogeochemistry, September 26-30, 1999, Huntsville, Ontario, Canada. Abstracts. 1 p.

Pennanen, T., Tuomainen, M., Hantula, J., Fritze, H., Haimi, J., Tikka, P. & Setälä, H. 1999. Forest soil microbial community in the presence or absence of Cognettia sphagnetorum (Enchytraediae) and ash fertilization. In: 6th Bacterial Genetics and Ecology Symposium, 20-24 June 1999, Florence, Italy. Abstracts. 1 p.

Priha, O., Grayston, S.J., Pennanen, T. & Smolander, A. 1998. Microbial community structure in the rhizospheres of Pinus sylvestris, Picea abies and Betula pendula. In: New Frontiers. Eight International Symposium on Microbial Ecology (ISME-8), 9-14 August 1998, Halifax, Canada. Abstracts. p. 271.

Pennanen, T., Fritze, H., Vanhala, P., Neuvonen, S. & Bååth, E. 1997. Response of the microbial community to prolonged simulated acid rain in a subarctic ecosystem. In: XIII International Symposium on Environmental Biogeochemistry, Monopoli, Italy, September 21-26, 1997. Abstracts.

Fritze, H., Pennanen, T. & Vanhala, P. 1996. Impacts of fertilizers on the humus layer microbial community structure of Scots pine stands growing along a gradient of heavy metal pollution. In: Substrate Use for Characterization of Microbial Communities in Terrestrial Ecosystems (SUBMECO), Innsbruck, Austria, October 16-18, 1996. Abstracts.

Ohtonen, R., Pennanen, T. & Väre, H. 1996. Development of the microbial community at a glacier forefront. In: International Conference on Mycorrhizae (ICOM), USA, August 4-8, 1996. Abstracts.

Pennanen, T., Frostegård, Å., Fritze, H. & Bååth, E. 1995. Phospolipid fatty acid composition and heavy metal tolerance of soil microbial communities along two heavy metal polluted gradients in coniferous forests. In: Nerg, A. & Viskari, E-L. (toim.-eds.). VI Nuorten metsävauriotutkijoiden tapaaminen, Rautavaaran Metsäkartano 2.-3.10.1995. Abstraktikirja - Abstract book. Kuopion yliopiston ympäristötieteiden laitosten monistesarja 7/95.

Pennanen, T., Frostegård, Å., Fritze, H. & Bååth, E. 1995. The effect of heavy metal deposition on phospolipid fatty acid composition and heavy metal tolerance of coniferous forest humus microbial communities. In: Abstracts. Seventh International Symposium on Microbial Ecology (ISME-7), Santos - Sao Paulo, Brazil, 27 August - 01 September, 1995. p. 80.

Pietikäinen, J., Pennanen, T. & Fritze, H. 1995. Microbial biomass distribution and fungal/bacterial ratio in boreal coniferous forest soil. In: Abstracts. Seventh International Symposium on Microbial Ecology (ISME-7), Santos - Sao Paulo, Brazil, 27 August - 01 September, 1995. p. 112.

Pietikäinen, J., Pennanen, T. & Fritze, H. 1995. Microbial biomass distribution and fungal/bacterial ratio in boreal coniferous forest soil. Julkaisussa: Nerg, A. & Viskari, E-L. (toim.-eds.) (toim.). VI Nuorten metsävauriotutkijoiden tapaaminen, Rautavaaran Metsäkartano 2.-3.10.1995. Abstraktikirja - Abstract book. Kuopion yliopiston ympäristötieteiden laitosten monistesarja 7/95.