Luke Research / Asiantuntija

A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Fritze, Hannu; Peltoniemi, Krista; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Hultman, Jenni; Tarvainen, Oili; Karhu, Jouni; Laurila, Marika; Korpela, Leila; Kangas, Katja. 2025. The boreal soil microbiome of different urban green spaces - do city residents meet different microbes? Urban forestry and urban greening 111: 18 p.

Huynh, Ngan Bao; Schmidt, Axel; Pennanen, Taina; Gershenzon, Jonathan; Mageroy, Melissa H. 2025. Methyl jasmonate seed treatment enhances Norway spruce seedling resistance to Botrytis cinerea via a multitude of defense responses. Plant physiology and biochemistry 229: 14 p.

Kanari, Eva; Karhu, Kristiina; Salonen, Anna-Reetta; Lemola, Riitta; Soinne, Helena; Barré, Pierre; Baudin, François; Mizohata, Kenichiro; Oinonen, Markku; Gil, Jenie; Kohl, Lukas; Pennanen, Taina; Liang, Chao; Heinonsalo, Jussi. 2025. Sensitivity of soil organic carbon stabilization indicators to 24 years of land-use change across soil depth. Geoderma 463: 18 p.

Lladó, Salvador; Maskell, Lindsay; Jones, Laurence; Yacoub, Cristina; Sánchez-Cueto, Pablo; Bosch, Montse; Philippot, Laurent; Hartmann, Martin; Galindo-Castañeda, Tania; de Goede, Ron; Bongiorno, Giulia; Mörrien, Elly; de Vries, Franciska T.; Soliveres, Santiago; Sessitsch, Angela; Gorfer, Markus; Dehnhardt, Alexandra; Schmidt, Katja; Van de Sande, Tomas; Hestbjerg, Helle; Alsina, Ina; García-Orenes, Fuensanta; Mataix-Solera, Jorge; Olivares-Martínez, Luis Daniel; Toth, Zoltán; Pennanen, Taina; Brennan, Fiona; Finn, John A.; Sirimarco, Ximena; Barral, Maria Paula; Nguefack, Julienne; Tangkoonboribun, Rochana; Stathopoulos, Nikolaos; Zoka, Melpomeni; Zanis, Prodromos; Vlacheas, Panagiotis; Sagarna, Juan; Muñoz, Mercedes; Martin, Alberto; Griffiths, Robert; Robinson, David; Harrison, Paula A. 2025. Bridging soil biodiversity and human well-being : An actionable framework to measure links between the natural capital and plural value of soils. One earth 8 8: 101391.

Soinne, Helena; Fritze, Hannu; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Räty, Mari; Uusitalo, Risto. 2025. Structure Lime as a Soil Amendment: Impacts on Nutrient Loss Risk and Soil Health. European journal of soil science 76 5: 14 p.

van Galen, Laura G.; Smith, Gabriel Reuben; Margenot, Andrew J.; Waldrop, Mark P.; Crowther, Thomas W.; Peay, Kabir G.; Jackson, Robert B.; Yu, Kailiang; Abrahão, Anna; Ahmed, Talaat A.; Alatalo, Juha M.; Anslan, Sten; Anthony, Mark A.; Araujo, Ademir Sergio Ferreira; Ascher-Jenull, Judith; Bach, Elizabeth M.; Bahram, Mohammad; Baker, Christopher C. M.; Baldrian, Petr; Bardgett, Richard D.; Barrios-Garcia, M. Noelia; Bastida, Felipe; Beggi, Francesca; Benning, Liane G.; Bragazza, Luca; Broadbent, Arthur A. D.; Cano-Díaz, Concha; Cates, Anna M.; Cerri, Carlos E. P.; Cesarz, Simone; Chen, Baodong; Classen, Aimeé T.; Dahl, Mathilde Borg; Delgado-Baquerizo, Manuel; Eisenhauer, Nico; Evgrafova, Svetlana Yu.; Fanin, Nicolas; Fornasier, Flavio; Francisco, Romeu; Franco, André L. C.; Frey, Serita D.; Fritze, Hannu; García, Carlos; …, et al.; Muñoz-Rojas, Miriam; Murugan, Rajasekaran; Nottingham, Andrew T.; Ochoa, Victoria; Ochoa-Hueso, Raúl; Oja, Jane; Olsson, Pål Axel; Öpik, Maarja; Ostle, Nick; Peltoniemi, Krista; Pennanen, Taina; Pescador, David S.; Png, G. Kenny; Poll, Christian; Põlme, Sergei; Potapov, Anton M.; Priemé, Anders; Pritchard, William; Puissant, Jeremy; Rocha, Sandra Mara Barbosa; Rosinger, Christoph; Ruess, Liliane; Sayer, Emma J.; Scheu, Stefan; Sinsabaugh, Robert L.; Slaughter, Lindsey C.; Soudzilovskaia, Nadejda A.; Sousa, José Paulo; Stanish, Lee; Sugiyama, Shu-ichi; Tedersoo, Leho; Trivedi, Pankaj; Vahter, Tanel; Voriskova, Jana; Wagner, Dirk; Wang, Cong; Wardle, David A.; Whitaker, Jeanette; Yang, Yuanhe; Zhong, Zhiwei; Zhu, Kai; Ziolkowski, Lori A.; Zobel, Martin; van den Hoogen, Johan. 2025. A global database of soil microbial phospholipid fatty acids and enzyme activities. Scientific data 12 1:

Chowdhury, Shaswati; von Post, Maria; Vallejo, Roger Roca; Naciph Mora, Karen; Hultman, Jenni; Pennanen, Taina; Lindroos, Antti-Jussi; Helming, Katharina. 2024. Drivers of soil health across European Union : Data from the literature review. Data in brief 57: 16 p.

Hamberg, Leena; Vanhatalo, Jarno; Velmala, Sannakajsa; Taylor, Andy FS; MacKay, John; Caron, Sébastien; Asiegbu, Fred O; Sievänen, Risto; Raumonen, Pasi; Hytönen, Tuija; Pennanen, Taina. 2024. The community of root fungi is associated with the growth rate of Norway spruce (Picea abies). Environmental microbiology 26 6: 16 p.

Himanen, Katri; Nygren, Markku; Pennanen, Taina. 2024. Mycelial inoculation of containerized Norway spruce seedlings with ectomycorrhizal fungi. New forests 55: 47-61.

Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Lloret, Eva; Ollio, Irene; Hyvönen, Juha; Liski, Eero; Brandt, Kristian K.; Campillo-Cora, Claudia; Fritze, Hannu; Iivonen, Sari; Lassen, Simon B.; Loit, Kaire; Martínez-Martínez, Silvia; Pennanen, Taina; Põldmets, Marian; Schrader, Stefan; Shanskiy, Merrit; Zornoza, Raúl; Waeyenberge, Lieven; Calviño, David Fernández. 2024. Soil and climatic characteristics and farming system shape fungal communities in European wheat fields. Agriculture ecosystems and environment 370: 12 p.

Salmela, Matti J.; Velmala, Sannakajsa M.; Himanen, Katri; Ylioja, Tiina; Pennanen, Taina. 2024. Soil factors and genetic variation regulate intraspecific growth in Norway spruce (Picea abies). Forest ecology and management 558: 12 p.

Adamczyk, Sylwia; Latvala, Satu; Poimala, Anna; Adamczyk, Bartosz; Hytönen, Tuija; Pennanen, Taina. 2023. Diterpenes and triterpenes show potential as biocides against pathogenic fungi and oomycetes: a screening study. Biotechnology Letters:

Hagner, Marleena; Pohjanlehto, Ida; Nuutinen, Visa; Setälä, Heikki; Velmala, Sannakajsa; Vesterinen, Eero; Pennanen, Taina; Lemola, Riitta; Peltoniemi, Krista. 2023. Impacts of long-term organic production on soil fauna in boreal dairy and cereal farming. Applied Soil Ecology 189: 10 p.

Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Fritze, Hannu; Jyske, Tuula; Rasi, Saija; Pennanen, Taina. 2023. Impacts of coniferous bark-derived organic soil amendments on microbial communities in arable soil – a microcosm study. FEMS Microbiology Ecology 99 3: 1-14.

Velmala, Sannakajsa; Salmela, Matti; Chan, Tommy; Hölttä, Teemu; Hamberg, Leena; Sievänen, Risto; Pennanen, Taina. 2022. Genotypes exhibit no variation in precision foraging in mycorrhizal Norway spruce seedlings. Plant and soil:

Adamczyk, Bartosz; Adamczyk, Sylwia; Kitunen, Veikko; Hytönen, Tuija; Mäkipää, Raisa; Pennanen, Taina. 2021. Variation in the chemical quality of woody supplements for nursery growing media affects growth of tree seedlings. New forests:

Heikkinen, Jaakko; Ketoja, Elise; Seppänen, Leena; Luostarinen, Sari; Fritze, Hannu; Pennanen, Taina; Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Hanajik, Peter; Regina, Kristiina. 2021. Chemical composition controls the decomposition of organic amendments and influences the microbial community structure in agricultural soils. Carbon management 12 4: 359-376.

Peltoniemi, Krista; Adamczyk, Sylwia; Fritze, Hannu; Minkkinen, Kari; Pennanen, Taina; Penttilä, Timo; Sarjala, Tytti; Laiho, Raija. 2021. Site fertility and soil water‐table level affect fungal biomass production and community composition in boreal peatland forests. Environmental microbiology:

Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Fritze, Hannu; Lemola, Riitta; Pennanen, Taina. 2021. Long-term impacts of organic and conventional farming on the soil microbiome in boreal arable soil. European journal of soil biology 104: 103314.

Kiheri, Heikki; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Timonen, Sari; Sietiö, Outi-Maaria; Fritze, Hannu; Heinonsalo, Jussi; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Larmola, Tuula. 2020. Fungal colonization patterns and enzymatic activities of peatland ericaceous plants following long-term nutrient addition. Soil biology and biochemistry 147: 11 p.

Kosunen, Maiju; Peltoniemi, Krista; Pennanen, Taina; Lyytikäinen-Saarenmaa, Päivi; Adamczyk, Bartosz; Fritze, Hannu; Zhou, Xuan; Starr, Mike. 2020. Storm and Ips typographus disturbance effects on carbon stocks, humus layer carbon fractions and microbial community composition in boreal Picea abies stands. Soil biology and biochemistry 148: 10 p.

Rasa, Kimmo; Pennanen, Taina; Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Fritze, Hannu; Kaseva, Janne; Joona, Juuso; Uusitalo, Risto. 2020. Pulp and Paper Mill Sludges Decrease Soil Erodibility. Journal of environmental quality:

Salmela, Matti J.; Velmala, Sannakajsa M.; Pennanen, Taina. 2020. Seedling traits from root to shoot exhibit genetic diversity and distinct responses to environmental heterogeneity within a tree population. Oikos 129 4: 544-558.

Soinne, Helena; Keskinen, Riikka; Heikkinen, Jaakko; Hyväluoma, Jari; Uusitalo, Risto; Peltoniemi, Krista; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Fritze, Hannu; Kaseva, Janne; Hannula, Markus; Rasa, Kimmo. 2020. Are there environmental or agricultural benefits in using forest residue biochar in boreal agricultural clay soil? Science of the total environment 731: 12 p.

Tarvainen, Oili; Saravesi, Karita; Pennanen, Taina; Markkola, Anna-Mari; Suokas, Marko; Fritze, Hannu. 2020. Fungal communities in decomposing wood along an energy wood harvest gradient. Forest Ecology and Management 465: 10 p.

Pennanen, Taina; Fritze, Hannu; de Boer, Wietze; Baldrian, Petr. 2019. Editorial: special issue on the ecology of soil microorganisms. FEMS Microbiology Ecology 95 12:

Hamberg, Leena; Velmala, Sannakajsa M.; Sievänen, Risto; Kalliokoski, Tuomo; Pennanen, Taina. 2018. Early root growth and architecture of fast- and slow-growing Norway spruce (Picea abies) families differ—potential for functional adaptation. Tree Physiology 38 6: 853-864.

Poimala, A.; Werres, S.; Pennanen, T.; Hantula, J. 2018. First report of alder Phytophthora closely related to P. uniformis on Alnus glutinosa seedling in Finland. Plant Disease 102 2: 454.

Velmala, Sannakajsa; Vuorinen, I.; Uimari, Anne; Piri, Tuula; Pennanen, Taina. 2018. Ectomycorrhizal fungi increase the vitality of Norway spruce seedlings under the pressure of Heterobasidion root rot in vitro but may increase susceptibility to foliar necrotrophs. Fungal Biology 122 2-3: 101-109.

Badia-Fabregat, Marina; Lucas, Daniel; Tuomivirta, Tero; Fritze, Hannu; Pennanen, Taina; Rodriguez-Mozaz, Sara; Barcelo, Damia; Caminal, Gloria; Vicent, Teresa. 2017. Study of the effect of the bacterial and fungal communities present in real wastewater effluents on the performance of fungal treatments. Science of the Total Environment 579: 366-377.

Mäkipää, Raisa; Rajala, Tiina; Schigel, Dmitry; Rinne, Katja T.; Pennanen, Taina; Abrego, Nerea; Ovaskainen, Otso. 2017. Interactions between soil- and dead wood-inhabiting fungal communities during the decay of Norway spruce logs. The ISME Journal 11 9: 1964-1974.

Vainio, Eeva; Pennanen, Taina; Rajala, Tiina; Hantula, Jarkko. 2017. Occurrence of similar mycoviruses in pathogenic, saprotrophic and mycorrhizal fungi inhabiting the same forest stand. FEMS Microbiology Ecology 93 3: 11 p.

Badia-Fabregat, Marina; Lucas, Daniel; Alcina Pereira, Maria; Alves, Madalena; Pennanen, Taina; Fritze, Hannu; Rodriguez-Mozaz, Sara; Barcelo, Damia; Vicent, Teresa; Caminal, Gloria. 2016. Continuous fungal treatment of non-sterile veterinary hospital effluent: pharmaceuticals removal and microbial community assessment. Applied Microbiology and Biotechnology 100: 2401-2415.

Gaitnieks, Talis; Klavina, Darta; Muiznieks, Indrikis; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Vasaitis, Rimvydas; Menkis, Audrius. 2016. Impact of Heterobasidion root-rot on fine root morphology and associated fungi in Picea abies stands on peat soils. Mycorrhiza 26 5: 465-473.

Klavina, Darta; Menkis, Audrius; Gaitnieks, Talis; Pennanen, Taina; Lazdins, Andis; Velmala, Sannakajsa; Vasaitis, Rimvydas. 2016. Low impact of stump removal on mycorrhization and growth of replanted Picea abies: Data from three types of hemiboreal forest. Baltic Forestry 22 1: 16-24.

Klavina, Darta; Menkis, Audrius; Gaitnieks, Talis; Velmala, Sannakajsa; Lazdins, Andis; Rajala, Tiina; Pennanen, Taina. 2016. Analysis of Norway spruce dieback phenomenon in Latvia - a belowground perspective. Scandinavian Journal of Forest Research 31 2: 156-165.

Klavina, Darta; Pennanen, Taina; Gaitnieks, Talis; Velmala, Sannakajsa; Lazdins, Andis; Lazdina, Dagnija; Menkis, Audrius. 2016. The ectomycorrhizal community of conifer stands on peat soils 12 years after fertilization with wood ash. Mycorrhiza 26 2: 153-160.

Santalahti, Minna; Sun, Hui; Jumpponen, Ari; Pennanen, Taina; Heinonsalo, Jussi. 2016. Vertical and seasonal dynamics of fungal communities in boreal Scots pine forest soil. FEMS Microbiology Ecology 92 11:

Taylor, D. Lee; Walters, William A.; Lennon, Niall J.; Bochicchio, James; Krohn, Andrew; Caporaso, J. Gregory; Pennanen, Taina. 2016. Accurate estimation of fungal diversity and abundance through improved lineage-specific primers optimized for Illumina amplicon sequencing. Applied and Environmental Microbiology 82 24: 7217-7226.

Huusko, Karoliina; Tarvainen, Oili; Saravesi, Karita; Pennanen, Taina; Fritze, Hannu; Kubin, Eero; Markkola, Annamari. 2015. Short-term impacts of energy wood harvesting on ectomycorrhizal fungal communities of Norway spruce saplings. The ISME Journal 9 3: 581-591.

Klavina, Darta; Zaluma, Astra; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa M.; Gaitnieks, Talis; Gailis, Arnis; Menkis, Audrius. 2015. Seed provenance impacts growth and ectomycorrhizal colonisation of Picea abies seedlings. Baltic Forestry 21 2:

Llorens-Blanch, Guillem; Badia-Fabregat, Marina; Lucas, Daniel; Rodriguez-Mozaz, Sara; Barceló, Damiá; Pennanen, Taina; Caminal, Gloria; Blánquez, Paqui. 2015. Degradation of pharmaceuticals from membrane biological reactor sludge with Trametes versicolor. Environmental Science : Processes & Impacts 17: 429-440.

Peltoniemi, Krista; Laiho, Raija; Juottonen, Heli; Kiikkilä, Oili; Mäkiranta, Päivi; Minkkinen, Kari; Pennanen, Taina; Penttilä, Timo; Sarjala, Tytti; Tuittila, Eeva-Stiina; Tuomivirta, Tero; Fritze, Hannu. 2015. Microbial ecology in a future climate: effects of temperature and moisture on microbial communities of two boreal fens. FEMS Microbiology Ecology 91 7: Article number: fiv062.

Rajala, Tiina; Tuomivirta, Tero; Pennanen, Taina; Mäkipää, Raisa. 2015. Habitat models of wood-inhabiting fungi along a decay gradient of Norway spruce logs. Fungal ecology 18: 48-55.

Vaario Lu-Min; Pennanen Taina; Lu Jinrong; Palmén Jorma; Stenman Jarkko; Leveinen Jussi; Kilpeläinen Petri; Kitunen Veikko. 2015. Tricholoma matsutake can absorb and accumulate trace elements directly from rock fragments in the shiro. Mycorrhiza 25: 10 s.

Vuorinen, Irmeli; Hamberg, Leena; Müller, Michael; Seiskari, Pekka; Pennanen, Taina. 2015. Development of growth media for solid substrate propagation of ectomycorrhizal fungi for inoculation of Norway spruce (Picea abies) seedlings. Mycorrhiza 25 4: 311-324.

Rajala, T.; Velmala, S.M.; Vesala, R.; Smolander, A.; Pennanen, T. 2014. The community of needle endophytes reflects the current physiological state of Norway spruce. Fungal Biology 118: 309-315.

Valentín, L.; Rajala, T.; Peltoniemi, M.; Heinonsalo, J.; Pennanen, T.; Mäkipää, R. 2014. Loss of diversity in wood-inhabiting fungal communities affects decomposition activity in Norway spruce wood. Frontiers in Terrestrial Microbiology 5: 230.

Velmala, S.M.; Rajala, T.; Heinonsalo, J.; Taylor, A.F.S.; Pennanen, T. 2014. Profiling functions of ectomycorrhizal diversity and root structuring in seedlings of Norway spruce (Picea abies) with fast- and slow-growing phenotypes. New Phytologist 201: 610-622.

Velmala, SM; Rajala, T; Smolander, A; Petäistö, R-L; Lilja, A; Pennanen, T. 2014. Infection with foliar pathogenic fungi does not alter the receptivity of Norway spruce seedlings to ectomycorrhizal fungi. Plant and Soil 385 1-2: 329-342.

Hyder, R.; Pennanen, T.; Hamberg, L.; Vainio, Eeva; Piri, T.; Hantula, J. 2013. Two viruses of Heterobasidion confer beneficial, cryptic or detrimental effects to their hosts in different situations. Fungal Ecology 6 5: 387-396.

Lindahl, B.; Nilsson, R.H.; Tedersoo, L.; Abarenkov, K.; Bibartondo, M.; Carlsen, T.; Kjøller, R.; Kõljalg, U.; Pennanen, T.; Rosendahl, S.; Stenlid, J.; Kauserud, H. 2013. Fungal community analysis by high-throughput sequencing of amplified markers - a user's guide. New Phytologist 199: 288-299.

Rajala, T.; Velmala, S.M.; Tuomivirta, T.; Haapanen, M.; Müller, M.; Pennanen, T. 2013. Endophyte communities vary in the needles of Norway spruce clones. Fungal Biology 117 3: 182-190.

Velmala, S.M.; Rajala, T.; Haapanen, M.; Taylor, A.F.S.; Pennanen, T. 2013. Genetic host-tree effects on the ectomycorrhizal community and root characteristics of Norway spruce. Mycorrhiza 23 1: 21-33.

Kataja-Aho, S.; Pennanen, T.; Lensu, A.; Haimi, J. 2012. Does stump removal affect early growth and mycorrhizal infection of spruce (Picea abies) seedlings in clear-cuts? Scandinavian Journal of Forest Research 27: 746-753.

Kähkölä, A.-K.; Nygren, P.; Leblanch, H.A.; Pennanen, T. 2012. Leaf and root litter of a legume tree as nitrogen sources for cacaos with different root colonisation by arbuscular mycorrhizae. Nutrient Cycling in Agroecosystems 92: 51-65.

Peltoniemi, K.; Straková, P.; Fritze, H.; Iráizoz, P.A.; Pennanen, T.; Laiho, R. 2012. How water-level drawdown modifies litter decomposing fungal and actinobacterial communities in boreal peatlands. Soil Biology & Biochemistry 51: 20-34.

Rajala, T.; Peltoniemi, M.; Pennanen, T.; Mäkipää, R. 2012. Fungal community dynamics in relation to substrate quality of decaying Norway spruce (Picea abies [L.] Karst.) logs in boreal forests. FEMS Microbiology Ecology 81 2: 494-505.

Vaario, L.-M.; Heinonsalo, J.; Spetz, P.; Pennanen, T.; Heinonen, J.; Tervahauta, A.; Fritze, H. 2012. The ectomycorrhizal fungus Tricholoma matsutake is a facultative saprotroph in vitro. Mycorrhiza 22 6: 409-418.

Nieminen, M.; Laurén, A.; Hökkä, H.; Sarkkola, S.; Koivusalo, H.; Pennanen, T. 2011. Recycled iron phosphate as a fertilizer raw material for tree stands on drained boreal peatlands. Forest Ecology and Management 261: 105-110.

Rajala, T.; Peltoniemi, M.; Hantula, J.; Mäkipää, R.; Pennanen, T. 2011. RNA reveals a succession of active fungi during the decay of Norway spruce logs. Fungal Ecology 4 6: 437-448.

Vaario, L.-M.; Fritze, H.; Spetz, P.; Heinonsalo, J.; Hanajík, P.; Pennanen, T. 2011. Tricholoma matsutake dominates diverse microbial communities in different forest soils. Applied and Environmental Microbiology 77 24: 8523-8531.

Abarenkov, K.; Nilsson, R.H.; Larsson, K.-H.; Alexander, I.J.; Eberhardt, U.; Erland, S.; Høiland, K.; Kjøller, R.; Larsson, E.; Pennanen, T.; Sen, R.; Taylor, A.F.S.; Tedersoo, L.; Ursing, B.M.; Vrålstad, T.; Liimatainen, K.; Peintner, U.; Kõljalg, U. 2010. The UNITE database for molecular identification of fungi - recent updates and future perspectives. New Phytologist 186 2: 281-285.

Kalliokoski, T.; Pennanen, T.; Nygren, P.; Sievänen, R.; Helmisaari, H.-S. 2010. Belowground interspecific competition in mixed boreal forests: fine root and ectomycorrhiza characteristics along stand developmental stage and soil fertility gradients. Plant and Soil 330: 73-89.

Ovaskainen, O.; Nokso-Koivisto, J.; Hottola, J.; Rajala, T.; Pennanen, T.; Ali-Kovero, H.; Miettinen, O.; Oinonen, P.; Auvinen, P.; Paulin, L.; Larsson, K.-H.; Mäkipää, R. 2010. Identifying wood-inhabiting fungi with 454 sequencing - What is the probability that BLAST gives the correct species? Fungal Ecology 3: 274-283.

Rajala, T.; Peltoniemi, M.; Pennanen, T.; Mäkipää, R. 2010. Relationship between wood-inhabiting fungi determined by molecular analysis (denaturing gradient gel electrophoresis) and quality of decaying logs. Canadian Journal of Forest Research 40: 2384-2397.

Vaario, L.-M.; Pennanen, T.; Sarjala, T.; Savonen, E.-M.; Heinonsalo, J. 2010. Ectomycorrhization of Tricholoma matsutake and two major conifers in Finland - An assessment of in vitro mycorrhiza formation. Mycorrhiza 20: 511-518.

Vaario, L.-M.; Tervonen, A.; Haukioja, K.; Haukioja, M.; Pennanen, T.; Timonen, S. 2009. The effect of nursery substrate and fertilization on the growth and ectomycorrhizal status of containerized and outplanted seedlings of Picea abies. Canadian Journal of Forest Research 39 1: 64-75.

Bidartondo, M.I.; et al. 2008. Preserving accuracy in GenBank. Science 319: 1616.

Flykt, Enni; Timonen, Sari; Pennanen, Taina. 2008. Variation of ectomycorrhizal colonization of spruce seedlings in Finnish forest nurseries. Silva Fennica 42 4: 571-585.

Jaatinen, K.; Laiho, R.; del, Castillo, U.; Vuorenmaa, A.; Minkkinen, K.; Pennanen, T.; Penttilä, T.; Fritze, H. 2008. Responses of aerobic microbial communities and soil respiration to water-level drawdown in a northern boreal fen. Environmental Microbiology 10 2: 339-353.

Korkama-Rajala, T.; Müller, M.M.; Pennanen, T. 2008. Decomposition and fungi of needle litter from slow- and fast-growing Norway spruce (Picea abies) clones. Microbial Ecology 56: 76-89.

Rantalainen, M.-L.; Haimi, J.; Fritze, H.; Pennanen, T.; Setälä, H. 2008. Soil decomposer community as a model system in studying the effects of habitat fragmentation and habitat corridors. Soil Biology & Biochemistry 40 4: 853-863.

Korkama, T.; Fritze, H.; Kiikkilä, O.; Pennanen, T. 2007. Do same-aged but different height Norway spruce (Picea abies) clones affect soil microbial community? Soil Biology & Biochemistry 39 9: 2420-2423.

Korkama, T.; Fritze, H.; Pakkanen, A.; Pennanen, T. 2007. Interactions between extraradical ectomycorrhizal mycelia, microbes associated with the mycelia and growth rate of Norway spruce (Picea abies) clones. New Phytologist 173 4: 798-807.

Korkama, T.; Pakkanen, A.; Pennanen, T. 2006. Ectomycorrhizal community structure varies among Norway spruce (Picea abies) clones. New Phytologist 171 4: 815-824.

Kõljalg, U.; Larsson, K.-H.; Abarankov, K.; Nilsson, H.R.; Alexander, I.; Eberhardt, U.; Erland, S.; Hoiland, K.; Kjøller, R.; Larsson, E.; Pennanen, T.; Sen, R.; Taylor, A.F.S.; Tedersoo, L.; Vrålstad, T.; Ursing, B.M. 2005. UNITE - a database providing web-based methods for the molecular identification of ectomycorrhizal fungi. New Phytologist 166 3: 1063-1068.

Pennanen, T.; Heiskanen, J.; Korkama, T. 2005. Dynamics of ectomycorrhizal fungi and growth of Norway spruce seedlings after planting on a mounded forest clearcut. Forest Ecology and Management 213: 243-252.

Rantalainen, M.-L.; Fritze, H.; Haimi, J.; Pennanen, T.; Setälä, H. 2005. Colonisation of newly established habitats by soil decomposer organisms: the effect of habitat corridors in relation to colonisation distance and habitat size. Applied Soil Ecology 28: 67-77.

Rantalainen, M.-L.; Fritze, H.; Haimi, J.; Pennanen, T.; Setälä, H. 2005. Species richness and food web structure of soil decomposer community as affected by the scale of habitat fragmentation and habitat corridors. Global Change Biology (online) 11: 1614-1627.

Pennanen, T.; Caul, S.; Daniell, T.J.; Griffiths, B.S.; Ritz, K.; Wheatley, R.E. 2004. Community-level responses of metabolically-active soil microorganisms to the quantity and quality of substrate inputs. Soil Biology & Biochemistry 36 5: 841-848.

Rantalainen, M.-L.; Fritze, H.; Haimi, J.; Kiikkilä, O.; Pennanen, T.; Setälä, H. 2004. Do enchytraeid worms and habitat corridors facilitate the colonisation of habitat patches by soil microbes? Biology and Fertility of Soils 39: 200-208.

Kiikkilä, O.; Pennanen, T.; Perkiömäki, J.; Derome, J.; Fritze, H. 2002. Organic material as a copper immobilising agent: a microcosm study on bioremediation. Basic and Applied Ecology 3 3: 245-253.

Liiri, M.; Setälä, H.; Haimi, J.; Pennanen, T.; Fritze, H. 2002. Relationship between soil microarthropod species diversity and plant growth does not change when the system is disturbed. Oikos 96: 137-149.

Liiri, M.; Setälä, H.; Haimi, J.; Pennanen, T.; Fritze, H. 2002. Soil processes are not influenced by the functional complexity of soil decomposer food webs under disturbance. Soil Biology & Biochemistry 34 7: 1009-1020.

Fritze, H.; Perkiömäki, J.; Petänen, T.; Pennanen, T.; Romantschuck, M.; Karp, M.; Yrjälä, K. 2001. A microcosmos study on the effects of Cd-containing wood ash on the coniferous forest humus fungal community and Cd bioavailability. Journal of Soils and Sediments 1 3: 146-150.

Kiikkilä, O.; Perkiömäki, J.; Barnette, M.; Derome, J.; Pennanen, T.; Tulisalo, E.; Fritze, H. 2001. In situ bioremediation through mulching of soil polluted by a copper-nickel smelter. Journal of Environmental Quality 30: 1134-1143.

Liiri, M.; Setälä, H.; Haimi, J.; Pennanen, T.; Fritze, H. 2001. Influence of Cognettia spaghnetorum (Enchytraeidae) on birch growth and microbial activity, composition and biomass in soil with or without wood ash. Biology and Fertility of Soils 34: 185-195.

Pennanen, Taina. 2001. Microbial communities in boreal coniferous forest humus exposed to heavy metals and changes in soil pH - a summary of the use of phospholipid fatty acids, Biologâ and 3H-thymidine incorporation methods in field studies. Geoderma 100: 91-126.

Pennanen, T.; Paavolainen, L; Hantula, J. 2001. Rapid PCR-based method for the direct analysis of fungal communities in complex environmental samples. Soil Biology & Biochemistry 33: 697-699.

Pennanen, T.; Strömmer, R.; Markkola, A.; Fritze, H. 2001. Microbial and plant community structure across a primary succession gradient. Scandinavian Journal of Forest Research 16: 37-43.

Priha, O.; Grayston, S.J.; Hiukka, R.; Pennanen, T.; Smolander, A. 2001. Microbial community structure and characteristics of the organic matter in soils under Pinus sylvestris, Picea abies and Betula pendula at two forest sites. Biology and Fertility of Soils 33: 17-24.

Fritze, H.; Pietikäinen, J.; Pennanen, T. 2000. Distribution of microbial biomass and phospholipid fatty acids in Podzol profiles under coniferous forest. European Journal of Soil Science 51: 565-573.

Kiikkilä, O.; Pennanen, T.; Pietikäinen, J.; Fritze, H. 2000. Some observations on the copper tolerance of bacterial communities using the 3H-thymidine incorporation method in heavy metal polluted humus. Soil Biology & Biochemistry 32: 883-885.

Fritze, H.; Tikka, P.; Pennanen, T.; Saano, A.; Jurgens, A.; Nilsson, M.; Bergman, I.; Kitunen, V. 1999. Detection of Archaeal diether lipid by gas chromatography from humus and peat. Scandinavian Journal of Forest Research 14: 545-551.

Ohtonen, R.; Fritze, H.; Pennanen, T.; Jumpponen, A.; Trappe, T. 1999. Ecosystem properties and microbial community changes in primary succession on a glacier forefront. Oecologia 119 2: 239-246.

Pennanen, T.; Liski, J.; Bååth, E.; Kitunen, V.; Uotila, J.; Westman, C.-J.; Fritze, H. 1999. Structure of the microbial communities in coniferous forest soils in relation to site fertility and stand development stage. Microbial Ecology 38: 168-179.

Priha, O.; Grayston, S.J.; Pennanen, T.; Smolander, A. 1999. Microbial activities related to C and N cycling and microbial community structure in the rhizospheres of Pinus sylvestris, Picea abies and Betula pendula seedlings in an organic and mineral soil. FEMS Microbiology Ecology 30: 187-199.

Fritze, H.; Pennanen, T.; Kitunen, V. 1998. Characterization of dissolved organic carbon from burned humus and its effects on microbial activity and community structure. Soil Biology & Biochemistry 30 6: 687-693.

Pennanen, T.; Fritze, H.; Vanhala, P.; Kiikkilä, O.; Neuvonen, S.; Bååth, E. 1998. Structure of a microbial community in soil after prolonged addition of low levels of simulated acid rain. Applied and Environmental Microbiology 64 6: 2173-2180.

Pennanen, T.; Perkiömäki, J.; Kiikkilä, O.; Vanhala, P.; Neuvonen, S.; Fritze, H. 1998. Prolonged, simulated acid rain and heavy metal deposition: separated and combined effects on forest soil microbial community structure. FEMS Microbiology Ecology 27: 291-300.

Kortemaa, H.; Pennanen, T.; Smolander, A.; Haahtela, K. 1997. Distribution of antagonistic Streptomyces griseoviridis in rhizosphere and non-rhizosphere sand. Journal of Phytopathology 145: 137-143.

Pennanen, T.; Frostegård, Å.; Fritze, H.; Bååth, E. 1996. Phospolipid fatty acid composition and heavy metal tolerance of soil microbial communities along two heavy metal-polluted gradients in coniferous forests. Applied and Environmental Microbiology 62 2: 420-428.

Bååth, E.; Frostegård, Å.; Pennanen, T.; Fritze, H. 1995. Microbial community structure and pH response in relation to soil organic matter quality in wood-ash fertilized, clear-cut or burned coniferous forest soil. Soil Biology & Biochemistry 27 2: 229-240.

Rönkkö, R.; Pennanen, T.; Smolander, A.; Kitunen, V.; Kortemaa, H.; Haahtela, K. 1994. Quantification of Frankia strains and other root-associated bacteria in pure cultures and in the rhizosphere of axenic seedlings by high-performance liquid chromatography-based muramic acid assay. Applied and Environmental Microbiology 60 10: 3672-3678.

A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Hultman, Jenni; Soinne, Helena; Pennanen, Taina; Lindroos, Antti-Jussi; Guimarães, Helena; Nóvoa, Teresa. 2025. Outlook on the knowledge gaps to improve soil structure. Soils for Europe 1: 21 p.

Bakker, Mark R.; Brunner, Ivano; Ashwood, Francis; Bjarnadottir, Brynhildur; Bolger, Tom; Børja, Isabella; Carnol, Monique; Cudlin, Pavel; Dalsgaard, Lise; Erktan, Amandine; Godbold, Douglas; Kraigher, Hojka; Meier, Ina C.; Merino-Martín, Luis; Motiejūnaitė, Jurga; Mrak, Tanja; Oddsdóttir, Edda S.; Ostonen, Ivika; Pennanen, Taina L.; Püttsepp, Ülle; Suz, Laura M.; Vanguelova, Elena I.; Vesterdal, Lars; Soudzilovskaia, Nadejda A. 2019. Belowground Biodiversity Relates Positively to Ecosystem Services of European Forests. Frontiers in Forests and Global Change 2: 23 p.

Nilsson, R.H.; Tedersoo, L.; Lindahl, B.; Kjøller, R.; Carlsen, T.; Quince, C.; Abarenkov, K.; Pennanen, T.; Stenlid, J.; Bruns, T.; Larsson, K.-H.; Kõljalg, U.; Kauserud, H. 2011. Towards standardization of the description and publication of next-generation sequencing datasets of fungal communities. New Phytologist 191: 314-319.

A3 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa

Fritze, H.; Pennanen, T.; Vanhala, P. 1997. Impact of fertilizers on the humus layer microbial community of Scots pine stands growing along a gradient of heavy metal pollution. In: Microbial communities: Functional versus structural approaches / Ed. Insam, H. & Rangger, A. (eds.). Springer-Verlag. 68-83.

B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä (Unrefereed journal articles)

Baldrian, Petr; Pennanen, Taina; Kohout, Petr; Fritze, Hannu. 2024. Editorial: Theme issue on the ecology of soil microorganisms. Fems microbiology ecology 100 4: 3 p.

Rajala, Tiina; Peltoniemi, Mikko; Valentin-Carrera, Lara; Pennanen, Taina; Mäkipää, Raisa. 2012. Sienidiversiteetin merkitys puiden lahoamisprosessissa ja taimien kasvussa. Metsätieteen aikakauskirja 2: 142-146.

Pennanen, Taina; Müller, Michael. 2011. Kuusentaimien juuristosienet ja niiden merkitys taimien alkukehitykselle. Metsätieteen aikakauskirja 1: 60-62.

Timonen, Sari; Pennanen, Taina. 2008. Kuusentaimien sienijuurien määrä ja laatu suomalaisilla metsätaimitarhoilla. Metsätieteen aikakauskirja 4: 318.

B2 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa (Book section)

Pennanen, Taina. 2018. Pintasienijuuria muodostavat sienilajit Suomessa. In: Rihman kiertämät – Kasvien ja sienten erottamaton elämä / M. Vestberg, S. Timonen (toim.). MAKS Press. s. 51-59.

Fritze, H.; Pennanen, T.; Haimi, J.; Siira-Pietikäinen, A.; Vanhala, P. 2000. Effects of heavy metals on soil microflora. In: Forest condition in a changing environment - the Finnish case. Forestry Sciences, Vol. 65. Kluwer Academic Publishers / Ed. Mälkönen, E. 260-265.

Pennanen, T.; Vanhala, P.; Kiikkilä, O.; Fritze, H. 2000. Effects of acidic deposition on forest soil microbiology. In: Forest condition in a changing environment - the Finnish case. Forestry Sciences, Vol. 65. Kluwer Academic Publishers / Ed. Mälkönen, E. 200-202.

B3 Vertaisarvioimaton artikkeli konferenssijulkaisussa (Unrefereed conference proceedings)

Vaario, L.-M.; Heinonsalo, J.; Spetz, P.; Pennanen, T.; Fritze, H. 2011. Tricholoma matsutake - an ectomycorrhizal fungus, lives between symbiotic and saprophytic when need arises. In: Proceedings of the 7th International Conference on Mushroom Biology and Mushroom Products, 4-7 October, 2011, Arcachon, France. Vol. 1. 500-505.

D1 Artikkeli ammattilehdessä

"Fritze, Hannu; Peltoniemi, Krista; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Hultman, Jenni; Korpela, Leila; Tarvainen, Oili; Karhu, Jouni; Laurila, Marika; Kangas, Katja. 2024. Monipuolisia mikrobiyhteisöjä, ""vanhoja ystäviä"". Viherympäristö 5: s. 46-49. "

Pennanen, Taina. 2023. How changes in the soil microbiome can impact our climate, food chains and human health. Agro food industry hi-tech 34 2:

Suojala-Ahlfors, Terhi; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Latvala, Satu; Karisto, Petteri; Haapalainen, Minna; Kivijärvi, Pirjo. 2023. Goda eller skadliga mikrober i marken påverkar hållbarheten. Trädgårdsnytt 10/2023: 10-11.

Suojala-Ahlfors, Terhi; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Kivijärvi, Pirjo; Haapalainen, Minna. 2022. Monipuoliset mikrobiyhteisöt auttavat kasvitautien hallinnassa. Puutarha & kauppa 26 5: 22-23.

Suojala-Ahlfors, Terhi; Pennanen, Taina; Haapalainen, Minna; Hannukkala, Asko; Kivijärvi, Pirjo; Velmala, Sannakajsa. 2020. Mikrobiyhteisöt tarkasteluun porkkanapelloilla. Puutarha & kauppa 24 8/2020: s. 27.

Pennanen, Taina; Tahvonen, Raija. 2018. Korvaamattomat mikrobit. Pähkylä 2/2018:

Pennanen, Taina; Vainio, Eeva; Hyder, Rafiqul; Hamberg, Leena; Piri, Tuula; Hantula, Jarkko. 2014. Juurikäävän torjuntaan etsitään uusia menetelmiä. In: Taimiuutiset 2/2014. Taimiuutiset 17 2: 12-13.

Pennanen, T. 2010. Kuinka monta kilometriä sienirihmastoa on puissa? Metsäntutkimus 14 1: 31.

Timonen, S.; Pennanen, T. 2009. Viisas asiakas tarkastaa metsätaimen juuret. Metsälehti 3: 22.

Hantula, Jarkko; Pennanen, T. 2008. Mistä johtuu sienien erilaisuus? Metsäntutkimus 12 1: 26-27.

Pennanen, Taina; Müller, Michael; Timonen, Sari. 2008. Juuri/verso-suhde ja mykorritsoituminen vaikuttavat kuusentaimien kasvuun istutuksen jälkeen. In: Taimiuutiset 2/2008. Taimiuutiset 11 2: 9-10.

Timonen, S.; Pennanen, T. 2007. Sienet, metsien avohakkuut ja kannonnosto. Sienilehti 59 2: 54-58.

Pennanen, Taina; Müller, Michael. 2004. Mykorritsasienet metsätaimitarhoilla. In: Taimiuutiset 2/2004. Taimiuutiset 7 2: 4-6.

Pennanen, T.; Müller, M. 2002. Mykorritsasiirroksella elinvoimaa kuusentaimille? Inocula 1: 13-14.

Müller, Michael; Pennanen, Taina; Rikala, Risto. 2001. Metlassa käynnistetyn tutkimushankkeen tavoitteena mykorritsasiirros kuusentaimille. In: Taimiuutiset 3/2001. Taimiuutiset 4 3: 10-11.

Pennanen, T.; Fritze, H. 1998. Raskasmetallit vaurioittavat maaperän pieneliöstöä. Ilmansuojelu 2: 11-12.

Pennanen, Taina. 1994. Tymidiini-inkorporaatio maaperäbakteerien kasvunopeuden kuvaajana. Inocula 1: x.

D2 Artikkeli ammatillisessa käsi- tai opaskirjassa tai ammatillisessa tietojärjestelmässä, taikka oppikirja-aineisto

Muilu-Mäkelä, Riina; Martz, Francoise; Hagner, Marleena; Pennanen, Taina; Yli-Hemminki, Pirjo; Palojärvi, Ansa. 2024. Biostimulants and biopestisides from plant-based biomass. In: Valuable biochemicals of the future : The outlook for bio-based value-added chemicals and their growing markets. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 85/2024: s. 27-30.

Lehto, Tarja; Pennanen, Taina. 2023. 9. Sienisadot muuttuvassa maailmassa. In: Metsätuhot vuonna 2022. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 48/2023: s. 40-41.

Nissinen, Anne; Pennanen, Taina; Suojala-Ahlfors, Terhi. 2023. 4. Johtopäätökset: biologisten torjuntamenetelmien hyödyntämismahdollisuudet tulevaisuudessa. In: Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 111/2023: s. 40-41.

Suojala-Ahlfors, Terhi; Nissinen, Anne; Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Latvala, Satu; Karisto, Petteri; Kivijärvi, Pirjo; Haapalainen, Minna; Pirhonen, Minna. 2023. Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä - 1. Johdanto. In: Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 111/2023: s. 5-6.

Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Suojala-Ahlfors, Terhi; Latvala, Satu; Karisto, Petteri; Kivijärvi, Pirjo; Haapalainen, Minna; Pirhonen, Minna; Adamczyk, Sylwia; Jääskeläinen, Oona. 2023. 3. Porkkanan varastotautien hallinta mikrobien avulla. In: Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 111/2023: s. 16-39.

Keskitalo, Marjo; Känkänen, Hannu; Palojärvi, Ansa; Pennanen, Taina; Schulman, Alan; Tanhuanpää, Pirjo; Viitala, Sirja. 2022. 4. Biologiset prosessit kasvin typensaannin turvaajana. In: Maatalouden typpihaaste – vaihtoehtoja ja ratkaisuja : Synteesiraportti. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 53/2022: 34-45.

Pennanen, Taina; Timonen, Sari; Heinonsalo, Jussi. 2018. Pintasienijuuret ja metsätalous. In: Rihman kiertämät – Kasvien ja sienten erottamaton elämä / M. Vestberg, S. Timonen (toim.). MAKS Press. s. 217-229.

Pennanen, T.; Timonen, S. 2013. Sienten bakteerit. In: Sienten biologia / Ed. Timonen, S. & Valkonen, J. Gaudeamus. 321-329.

Derome, J.; Fritze, H.; Heiskanen, J.; Helmisaari, H.-S.; Levula, T.; Mälkönen, E.; Pennanen, T.; Saarsalmi, A.; Smolander, A.; Starr, M.; Tamminen, P. 1999. Vastanneet anonyymeina julkaisun 'Näytteenotto metsämaan ominaisuuksien määrittämistä varten' (Metsäntutkimuslaitoksen tiedonantoja 729, 54 s., toim. Tamminen P. & Mälkönen, E.) artikkeleiden kirjoittamisesta.0.

D4 Julkaistu kehittämis- tai tutkimusraportti taikka -selvitys

Leppälä, Johanna; Nurmi, Elina; Tähtikarhu, Mika (Eds.)2026. Synteesiraportti: Tavoitteena maan kasvukunnon parantaminen : Uudet tiedot ja menetelmät maatalouden ympäristövaikutusten hallintaan. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 4/2026: 66 s. Luonnonvarakeskus

Muilu-Mäkelä, Riina; Brännström, Hanna; Weckroth, Mikko; Kohl, Johanna; Da Silva Viana, Gabriel; Diaz, Martin; Ghalibaf, Maryam; Hagner, Marleena; Hiidenhovi, Jaakko; Ilvesniemi, Jaakko; Jyske, Tuula; Järvenpää, Eila; Katajajuuri, Juha-Matti; Kilpeläinen, Petri; Korpinen, Risto; Kumar, Anuj; Kunnas, Susan; Linnakoski, Riikka; Marnila, Pertti; Martz, Francoise; Mäkinen, Sari; Möttönen, Veikko; Ollikainen, Jyrki; Palojärvi, Ansa; Pap, Nora; Pennanen, Taina; Pihlanto, Anne; Rinne, Marketta; Routa, Johanna; Ruuttunen, Kyösti; Saarikko, Janne; Saranpää, Pekka; Tienaho, Jenni; Viitala, Esa-Jussi; Weckroth, Mikko; Yli-Hemminki, Pirjo. 2024. Valuable biochemicals of the future : The outlook for bio-based value-added chemicals and their growing markets. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 85/2024: 85 p.

Haavisto, Teija (Eds.)2023. Suomen maaperän seuranta, tila ja käytön ohjauskeinot. Ympäristöministeriön julkaisuja 2023 33: 255 s. Ympäristöministeriö

Suojala-Ahlfors, Terhi (Eds.)2023. Porkkanakempin ja porkkanan varastotautien hallinta uusilla biologisilla menetelmillä. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 111/2023: 45 s. Luonnonvarakeskus

Sutela, Suvi; Kykkänen, Sanna; Semberg, Sanni; Pennanen, Taina; Terhonen, Eeva. 2023. Hankkeen A78729 TP1 raportti: Tummaväliseinäisten sienien hyötykäyttömahdollisuudet kasvien terveyden edistämisessä ja hiilensidonnassa.12 s. Luonnonvarakeskus

Terhonen, Eeva; Melin, Markus (Eds.)2023. Metsätuhot vuonna 2022. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 48/2023: 98 s. Luonnonvarakeskus

Vainio, Eeva; Merilä, Päivi; Ilvesniemi, Hannu; Kekkonen, Hanna; Mäkipää, Raisa; Nieminen, Tiina M.; Pennanen, Taina; Tolvanen, Anne. 2023. Three key messages concerning the proposal for EU Soil Monitoring Law. Luke Position paper: 4 p.

Vainio, Eeva (Eds.)2022. Maatalouden typpihaaste – vaihtoehtoja ja ratkaisuja : Synteesiraportti. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 53/2022: 68 s. Luonnonvarakeskus (Luke)

Norros, Veera; Laamanen, Tiina; Meissner, Kristian; Iso-Touru, Terhi; Kahilainen, Aapo; Lehtinen, Sirpa; Lohtander-Buckbee, Katileena; Nygård, Henrik; Pennanen, Taina; Ruohonen-Lehto, Marja; Sirkiä, Päivi; Suikkanen, Sanna; Tolkkinen, Mikko; Vainio, Eeva; Velmala, Sannakajsa; Vuorio, Kristiina; Vihervaara, Petteri. 2022. Roadmap for implementing environmental DNA (eDNA) and other molecular monitoring methods in Finland–Vision and action plan for 2022–2025. Reports of the Finnish Environment Institute 20/2022: 74 p.

D6 Toimitettu ammatillinen teos

Leppälammi-Kujansuu, Jaana; Pennanen, Taina; Rankinen, Katri; Salo, Tapio; Soinne, Helena; Hänninen, Pekka (Eds.)2017. Maaperä kiertotalouden perustana : IX Maaperätieteiden päivien abstraktit. Pro Terra 71: 102 p. Suomen Maaperätieteiden Seura

Leppälammi-Kujansuu, Jaana; Pennanen, Taina; Rankinen, Katri; Salo, Tapio; Soinne, Helena; Hänninen, Pekka (Eds.)2015. VIII Maaperätieteiden päivien abstraktit. Pro Terra 67: 108 p. Suomen Maaperätieteiden Seura, Helsingin yliopisto, Elintarvike- ja ympäristötieteiden laitos

E1 Yleistajuinen artikkeli, sanomalehtiartikkeli

Pennanen, T.; Timonen, S. 2003. Yksinäinen taimi etsii luotettavaa mikrobiseuraa (vierasyliö). Maaseudun Tulevaisuus 20.1.: 0.

G5 Artikkeliväitöskirja

Pennanen, Taina. 1998. Structure of the microbial communities in boreal coniferous forest humus exposed to heavy metals and changes in soil pH. Helsingin yliopisto, biotieteiden laitos. Väitöskirja.49 s. + 6 osajulk.

M1 Tutkimuksesta kertovat esitykset

Pennanen, Taina; Fritze, Hannu. 2015. Kuinka tutkia maaperän mikrobiston monimuotoisuutta? Luonnonvarakeskus

M2 Konferenssiabstraktit

Kiheri, Heikki; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Timonen, Sari; Sietiö, Outi-Maaria; Heinonsalo, Jussi; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Fritze, Hannu; Larmola, Tuula. 2018. Effects of 15 Years of Nutrient Addition on Ericoid Mycorrhizal Colonization at Whim Bog. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 133.

Kiheri, Heikki; Velmala, Sannakajsa; Pennanen, Taina; Timonen, Sari; Sietiö, Outi-Maaria; Heinonsalo, Jussi; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Fritze, Hannu; Larmola, Tuula. 2018. Pitkäaikaisen typpilannoituksen vaikutukset varpujen sienijuuriin karulla Whim-suolla. In: Suopäivä 2018 : abstraktikirja. Suoseura. p. 48.

Larmola, Tuula; Kiheri, Heikki; Bubier, Jill L.; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Hobbie, Erik A.; Moore, Tim R.; Pennanen, Taina; Timonen, Sari. 2018. Do foliar 15N patterns indicate shifts in mycorrhizal abundance and function under nutrient load? In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 139.

Larmola, Tuula; Kiheri, Heikki; Bubier, Jill L.; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Hobbie, Erik A.; Moore, Tim R.; Pennanen, Taina; Timonen, Sari. 2018. Do foliar δ15N patterns indicate shifts in the mycorrhizal abundance and function under nutrient load? Geophysical Research Abstracts 20: 1 p.

Peltoniemi, Krista; Fritze, Hannu; Pennanen, Taina; Penttilä, Timo; Sarjala, Tytti; Adamczyk, Sylwia; Laiho, Raija. 2018. Fungal biomass and species composition in boreal peatland forests estimated by in-growth mesh bag method. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 163.

Pennanen, Taina; Hamberg, Leena; Salmela, Matti; Sievänen, Risto; Velmala, Sannakajsa. 2018. The mycorrhiza-root interphase of spruce is under genetic control of the host and adaptive to soil characteristics. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 53.

Vainio, Eeva; Piri, Tuula; Hyder, Rafiqul; Pennanen, Taina; Hantula, Jarkko. 2018. Virus communities of forest fungi inhabiting decomposing wood and tree roots. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 66.

Velmala, Sannakajsa; Salmela, Matti; Hamberg, Leena; Hölttä, Teemu; Chan, Tommy; Pennanen, Taina. 2018. Fine root foraging strategies of Norway spruce seedlings with contrasting future phenotypes in response to nutrient-rich patches. In: 3rd Conference on Ecology of Soil Microorganisms / eds. Krista Kettunen & Oili Kiikkilä. Natural resources and bioeconomy studies 29/2018: p. 51.

Larmola, Tuula; Kiheri, Heikki; Fritze, Hannu; Laiho, Raija; Pennanen, Taina; Hobbie, Erik A.; Bubier, Jill L.; van Dijk, Netty; Dise, Nancy; Moore, Tim R.; Nilsson, Mats B.; Talbot, Julie. 2017. Typpilaskeuman vaikutus soiden hiilen sidontaan ja ravinnekiertoon: varpu-sieni vuorovaikutuksen merkitys. In: Maaperä kiertotalouden perustana : IX Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 71: p. 57.

Mäkipää, Raisa; Pennanen, Taina; Rajala, Tiina; Schigel, Dmitry; Rinne, Katja T.; Ovaskainen, Otso. 2017. Interaction between soil- and dead wood-inhabiting fungi of an unmanaged Norway spruce stand. In: Maaperä kiertotalouden perustana : IX Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 71: p. 58.

Velmala, Sannakajsa; Hamberg, Leena; Sievänen, Risto; Kalliokoski, Tuomo; Pennanen, Taina. 2017. Early root growth and architecture of seedlings of fast- and slow-growing Norway spruce families. In: Maaperä kiertotalouden perustana : IX Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 71: p. 17.

Pennanen, Taina; Velmala, Sannakajsa; Rajala, Tiina; Vuorinen, Irmeli; Vaario, Lu-Min. 2015. Symbionttiset pintajuurisienet ja kuusentaimien kasvu. In: VIII Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 67: p. 84-85.

Pennanen, T.; Velmala, S. M.; Rajala, T. 2015. Atheliaceae fungi are potential keystone species building up the belowground growth of Norway spruce. In: 8th International conference on mycorrhizas, August 3-7, 2015, Northern Arizona university : ICOM 8 paper and poster abstracts. Northern Arizona University. p. 138.

Rajala, Tiina; Tuomivirta, Tero; Schiegel, Dmitry; Pennanen, Taina; Ovaskainen, Otso; Mäkipää, Raisa. 2015. Decaying wood harbors high fungal diversity in boreal forests. In: Towards a new era of forest science in the boreal region : abstracts of the 17th IBFRA conference May 24–29, 2015, Rovaniemi, Finland / Raisa Mäkipää and Tuire Kilponen (eds.). Natural resources and bioeconomy studies 29/2015: p. 110.

Vainio, Eeva; Pennanen, Taina; Rajala, Tiina; Hantula, Jarkko. 2015. Common viruses in pathogenic, mycorrhizal and saprotrophic fungal species in a boreal forest. In: Ecology of soil microorganisms 2015, November 29 - December 3, 2015, Prague, Czech Republic : book of abstracts. Institute of Microbiology. 1 p.

Velmala, Sannakajsa; Rajala, Tiina; Pennanen, Taina. 2015. Yhteyttä etsimässä: Sienijuurisymbioosin vaikutus kuusen kasvuun. In: VIII Maaperätieteiden päivien abstraktit / Toim. J. Leppälammi-Kujansuu, T. Pennanen, K. Rankinen, T. Salo, H. Soinne ja P. Hänninen. Pro Terra 67: p. 39-40.

Velmala, S. M.; Rajala, T.; Pennanen, T. 2015. Function by form - a tentative insight to the link between growth and the diversity of ectomycorrhizal fungi. In: 8th International conference on mycorrhizas, August 3-7, 2015, Northern Arizona university : ICOM 8 paper and poster abstracts. Northern Arizona University. p. 191.

Haimi, J.; Kataja-Aho, S.; Fritze, H.; Pennanen, T.; Smolander, A. 2013. Kantojen korjuun vaikutukset maaperän biologiaan ja kasvillisuuteen. In: Maankäytön kestävyys. VII Maaperätieteiden päivien abstraktit / Ed. Leppälammi-Kujansuu, J., Soinne, H., Merilä, P., Rankinen, K., Salo, T. & Hänninen, P. Pro Terra 61: 14.

Vuorinen, I.; Velmala, S.; Rajala, T.; Piri, T.; Pennanen, T. 2013. Symbionttiset juuristosienet ja kuusentaimien kasvu. In: Maankäytön kestävyys. VII Maaperätieteiden päivien abstraktit / Ed. Leppälammi-Kujansuu, J., Soinne, H., Merilä, P., Rankinen, K., Salo, T. & Hänninen, P. Pro Terra 61: 66.

Vaario, L.-M.; Kiikkilä, O.; Hamberg, L.; Pennanen, T. 2012. Impacts of soil microbial community and litter layer on Tricholoma matsutake shiro formation. In: BIT's 2nd Annual World Congress of Microbes. 30th of July - 1st of August 2012, Guangzhou, China. Abstracts. 238.

Lu, J.; Pennanen, T.; Vaario, L.-M. 2011. The fungal community structure in stone samples within Tricholoma matsutake shiro. In: Metsätieteen päivä 26.10.2011: Metsäsektorin laajenevat vastuut. Suomen Metsätieteellinen Seura. 33.

Rajala, T.; Peltoniemi, M.; Pennanen, T.; Mäkipää, R. 2011. Sienilajiston suhde lahoavan puun ominaisuuksiin. In: Metsätieteen päivä 26.10.2011: Metsäsektorin laajenevat vastuut. Suomen Metsätieteellinen Seura. 35.

Rajala, T.; Peltoniemi, M.; Pennanen, T.; Mäkipää, R. 2011. Sienilajiston sukkessio lahoavilla kuusirungoilla. In: Mieli maassa - maa mielessä. VI Maaperätieteiden päivien abstraktit / Ed. Soinne, H., Kähkönen, M., Merilä, P., Rankinen, K., Salo, T. & Hänninen, P. Pro Terra 52: 48-49.

Valentin, L.; Rajala, T.; Pennanen, T.; Mäkipää, R. 2011. Fungal community composition affects the rate of decomposition in Picea abies woody substrate. In: Metsätieteen päivä 26.10.2011: Metsäsektorin laajenevat vastuut. Suomen Metsätieteellinen Seura. 34.

Vuorinen, I.; Velmala, S.; Rajala, T.; Piri, T.; Pennanen, T. 2011. Symbionttiset juuristosienet kuusentaimien kasvun tukena. In: Metsätieteen päivä 26.10.2011: Metsäsektorin laajenevat vastuut. Suomen Metsätieteellinen Seura. 32.

Pennanen, T.; Müller, M.; Vaario, L.-M.; Timonen, S. 2010. Kuusen taimitarhataimien juuristosienien monimuotoisuus ja taimien kasvu istutuksen jälkeen. Julkaisussa: Luonnon monimuotoisuus ja metsien kestävä käyttö. Metsätieteen päivä, 4.11.2010, Helsinki.s. 13.

Vaario, L.-M.; Fritze, H.; Sarjala, T.; Savonen, E.; Pennanen, T. 2010. Structure of fungal and actinobacterial communities in the soil dominated by Tricholoma matsutake. In: Abstracts of 13th International Symposium on Microbial Ecology, 22-27 August 2010, Seattle, WA, USA. PS.10.026.

Vaario, L.-M.; Heinonsalo, J.; Savonen, E.-M.; Sarjala, T.; Pennanen, T. 2009. Evaluating the role of shiro formation of Tricholoma matsutake in situ. Identification of Matsutake shiro and its fungal community. In: Maaperä muuttuvassa maailmassa. V Maaperätieteiden päivät, Helsinki 8.-9.1.2009. Laajennetut abstraktit / Ed. Soinne, H., Helmisaari, H.-S., Hänninen, P., Kähkönen, M., Rankinen, K. & Esala, M. Pro Terra 41: 34-35.

Hautamäki, N.; Salemaa, M.; Pennanen, T. 2008. The ability of heather (Calluna vulgaris) to recolonize a heavy-metal polluted forest area. In: 4th European BioRemediation Conference. Book of Abstracts / Ed. Kalogerakis, N., Fava, F. & Banwart, S.A. Technical University of Crete. p. 286.

Korkama, T.; Fritze, H.; Kiikkilä, O.; Pakkanen, A.; Pennanen, T. 2005. Kuusen genotyyypin vaikutus ektomykorritsasieniyhteisöön ja maaperämikrobeihin. In: Maaperän vuorovaikutukset. III Maaperätieteiden päivien laajennetut abstraktit / Ed. Siimes, K., Makkonen, K., Pietikäinen, J., Mattila, P., Penttinen, S. & Esala, M. Pro Terra 22: 55-56.

Potila, H.; Pennanen, T.; Fritze, H.; Korkama, T.; Hartman, M.; Sarjala, T. 2005. Onko lämpösummalla vaikutusta mikrobiyhteisön rakenteeseen ojitetulla turvemaalla? In: Maaperän vuorovaikutukset. III Maaperätieteiden päivien laajennetut abstraktit / Ed. Siimes, K., Makkonen, K., Pietikäinen, J., Mattila, P., Penttinen, S. & Esala, M. Pro Terra 22: 31-32.

Pennanen, T.; Korkama, T.; Heiskanen, J. 2002. Ectomycorrhizal fungi of Norway spruce seedlings after planting to mounded clear-cut forest. In: Maa, josta elämme. II. Maaperätieteiden päivät, Helsinki 19.-20.11.2002. Laajennetut abstraktit / Ed. Pietola, L. & Esala, M. Pro Terra 15: 42-43.

Pennanen, T.; Caul, S.; Daniell, T.J.; Ritz, K.; Wheatley, R. 2001. Community-level responses of soil microbes to variations in quantity and quality of substrate inputs. In: Interactions in the Microbial World. 9th International Symposium on Microbial Ecology, ISME-9, 26-31 August 2001, Amsterdam, The Netherlands. Final programme and abstracts. 1 p.

Liiri, M.; Setälä, H.; Haimi, J.; Pennanen, T.; Fritze, H. 2000. Onko biodiversiteetillä merkitystä maaperäekosysteemissä? In: Maaperätieteet ihmiskunnan palveluksessa. Maaperätieteiden päivien laajennetut abstraktit / Ed. Pietola, L. Pro Terra 4/2000: 80.

Pennanen, T.; Tuomainen, M.; Fritze, H.; Hantula, J.; Haimi, J.; Tikka, P.; Setälä, H. 2000. Structure od the soil bacterial and fungal communities in the presence or absence of Cognettia sphagnetorum (Enchytraeidae) and ash fertilization. In: EUROSOIL 2000, University of Reading, 4-6 September, 2000. British Society of Soil Science. 1 p.

Pennanen, T.; Ohtonen, R.; Markkola, A.; Fritze, H. 1999. Primary soil formation and succession of microbial and plant communities. In: Interfacial Processes from the Molecular to the Global State, XIV International Symposium on Environmental Biogeochemistry, September 26-30, 1999, Huntsville, Ontario, Canada. Abstracts. 1 p.

Pennanen, T.; Tuomainen, M.; Hantula, J.; Fritze, H.; Haimi, J.; Tikka, P.; Setälä, H. 1999. Forest soil microbial community in the presence or absence of Cognettia sphagnetorum (Enchytraediae) and ash fertilization. In: 6th Bacterial Genetics and Ecology Symposium, 20-24 June 1999, Florence, Italy. Abstracts. 1 p.

Priha, O.; Grayston, S.J.; Pennanen, T.; Smolander, A. 1998. Microbial community structure in the rhizospheres of Pinus sylvestris, Picea abies and Betula pendula. In: New Frontiers. Eight International Symposium on Microbial Ecology (ISME-8), 9-14 August 1998, Halifax, Canada. Abstracts. 271.

Pennanen, T.; Fritze, H.; Vanhala, P.; Neuvonen, S.; Bååth, E. 1997. Response of the microbial community to prolonged simulated acid rain in a subarctic ecosystem. In: XIII International Symposium on Environmental Biogeochemistry, Monopoli, Italy, September 21-26, 1997. Abstracts. x.

Fritze, H.; Pennanen, T.; Vanhala, P. 1996. Impacts of fertilizers on the humus layer microbial community structure of Scots pine stands growing along a gradient of heavy metal pollution. In: Substrate Use for Characterization of Microbial Communities in Terrestrial Ecosystems (SUBMECO), Innsbruck, Austria, October 16-18, 1996. Abstracts. x.

Ohtonen, R.; Pennanen, T.; Väre, H. 1996. Development of the microbial community at a glacier forefront. In: International Conference on Mycorrhizae (ICOM), USA, August 4-8, 1996. Abstracts. x.

Pennanen, T.; Frostegård, Å.; Fritze, H.; Bååth, E. 1995. Phospolipid fatty acid composition and heavy metal tolerance of soil microbial communities along two heavy metal polluted gradients in coniferous forests. In: VI Nuorten metsävauriotutkijoiden tapaaminen, Rautavaaran Metsäkartano 2.-3.10.1995. Abstraktikirja - Abstract book / Ed. Nerg, A. & Viskari, E-L. (toim.-eds.). Kuopion yliopiston ympäristötieteiden laitosten monistesarja 7/95: x.

Pennanen, T.; Frostegård, Å.; Fritze, H.; Bååth, E. 1995. The effect of heavy metal deposition on phospolipid fatty acid composition and heavy metal tolerance of coniferous forest humus microbial communities. In: Abstracts. Seventh International Symposium on Microbial Ecology (ISME-7), Santos - Sao Paulo, Brazil, 27 August - 01 September, 1995. 80.

Pietikäinen, J.; Pennanen, T.; Fritze, H. 1995. Microbial biomass distribution and fungal/bacterial ratio in boreal coniferous forest soil. In: Abstracts. Seventh International Symposium on Microbial Ecology (ISME-7), Santos - Sao Paulo, Brazil, 27 August - 01 September, 1995. 112.

Pietikäinen, J.; Pennanen, T.; Fritze, H. 1995. Microbial biomass distribution and fungal/bacterial ratio in boreal coniferous forest soil. In: VI Nuorten metsävauriotutkijoiden tapaaminen, Rautavaaran Metsäkartano 2.-3.10.1995. Abstraktikirja - Abstract book / Ed. Nerg, A. & Viskari, E-L. (toim.-eds.). Kuopion yliopiston ympäristötieteiden laitosten monistesarja 7/95: x.