Luke Research / Expert - Mäntysaari Esa

A1 Journal article (refereed)

Vargas Jurado, Napoleon; Kärkkäinen, Hanni; Fischer, Daniel; Bitz, Oliver; Manninen, O.; Pärssinen, P.; Isolahti, Mika; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2025. Genetic architecture and genomic prediction for yield, winter damage, and digestibility traits in timothy (Phleum pratense L.) using genotyping-by-sequencing data. Theoretical and applied genetics 138 4: 17 s.

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin H.; Thompson, Robin; Gao, Hongding. 2024. A computationally efficient algorithm to leverage average information REML for (co)variance component estimation in the genomic era. Genetics Selection Evolution 56 1: 10 p.

Gao, Hongding; Kudinov, Andrei A.; Taskinen, Matti; Pitkänen, Timo J.; Lidauer, Martin H.; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2023. A computationally efficient method for approximating reliabilities in large-scale single-step genomic prediction. Genetics Selection Evolution 55 1: 14 p.

Lidauer, M.H.; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa A.; Mäntysaari, Päivi; Kajava, Sari; Kokkonen, Tuomo; Chegini, A.; Mehtiö, Terhi. 2023. Estimating breeding values for feed efficiency in dairy cattle by regression on expected feed intake. animal 17 9: 10 p.

Vandenplas, Jeremie; ten Napel, Jan; Darbaghshahi, Saeid Naderi; Evans, Ross; Calus, Mario P. L.; Veerkamp, Roel; Cromie, Andrew; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2023. Efficient large-scale single-step evaluations and indirect genomic prediction of genotyped selection candidates. Genetics Selection Evolution 55 1: 17 p.

Ben Zaabza, Hafedh; Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa A.; Pitkänen, Timo; Aamand, Gert Pedersen; Strandén, Ismo. 2022. Breeding value reliabilities for multiple-trait single-step genomic best linear unbiased predictor. Journal of Dairy Science 105 6: 5221-5237.

Eiríksson, Jón H.; Strandén, Ismo; Su, Guosheng; Mäntysaari, Esa A.; Christensen, Ole F. 2022. Local breed proportions and local breed heterozygosity in genomic predictions for crossbred dairy cows. Journal of Dairy Science 105 12: 9822-9836.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2022. Accounting for Missing Pedigree Information with Single-Step Random Regression Test-Day Models. Agriculture 12 3: 10 p.

Kudinov, Andrei A.; Koivula, Minna; Aamand, Gert P.; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2022. Single-step genomic BLUP with many metafounders. Frontiers in Genetics 13: 13 p.

Mäntysaari, P.; Juga, J.; Lidauer, M.H.; Häggman, J.; Mehtiö, T.; Christensen, J.M.; Mäntysaari, E.A. 2022. The relationships between early lactation energy status indicators and endocrine fertility traits in dairy cows. Journal of Dairy Science 105 8: 6833-6844.

Strandén, Ismo; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2022. Single-step genomic BLUP with genetic groups and automatic adjustment for allele coding. Genetics Selection Evolution 54 1: 12 p.

Ben Zaabza, H.; Mäntysaari, E.A.; Strandén, I. 2021. Estimation of individual animal SNP-BLUP reliability using full Monte Carlo sampling. JDS Communications 2 3: 137-141.

Koivula, M.; Strandén, I.; Aamand, G.P.; Mäntysaari, E.A. 2021. Practical implementation of genetic groups in single-step genomic evaluations with Woodbury matrix identity–based genomic relationship inverse. Journal of dairy science:

Kudinov, Andrei A.; Mäntysaari, Esa A.; Pitkänen, Timo J.; Saksa, Ekaterina I.; Aamand, Gert P.; Uimari, Pekka; Strandén, Ismo. 2021. Single‐step genomic evaluation of Russian dairy cattle using internal and external information. Journal of animal breeding and genetics:

Mehtiö, T.; Pitkänen, T.; Leino, A.-M.; Mäntysaari, E.A.; Kempe, R.; Negussie, E.; Lidauer, M.H. 2021. Genetic analyses of metabolic body weight, carcass weight and body conformation traits in Nordic dairy cattle. Animal 15 12: 7 p.

Ben Zaabza, Hafedh; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2020. Snp_blup_rel: software for calculating individual animal SNP-BLUP model reliabilities. Agricultural and food science 29 4: 297-306.

Ben Zaabza, H.; Mäntysaari, E.A.; Strandén, I. 2020. Using Monte Carlo method to include polygenic effects in calculation of SNP-BLUP model reliability. Journal of Dairy Science 103 6: 5170-5182.

Haikka, Hanna; Knürr, Timo; Manninen, Outi; Pietilä, Leena; Isolahti, Mika; Teperi, Esa; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2020. Genomic prediction of grain yield in commercial Finnish oat (Avena sativa) and barley (Hordeum vulgare) breeding programmes. Plant Breeding:

Kudinov, A.A.; Mäntysaari, E.A.; Aamand, G.P.; Uimari, P.; Strandén, Ismo. 2020. Metafounder approach for single-step genomic evaluations of Red Dairy cattle. Journal of dairy science 103 7: 6299-6310.

Mehtiö, T.; Mäntysaari, P.; Negussie, E.; Leino, A.-M.; Pösö, J.; Mäntysaari, E. A.; Lidauer, M. H. 2020. Genetic correlations between energy status indicator traits and female fertility in primiparous Nordic Red Dairy cattle. Animal 14 8: 1588-1597.

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2020. Bpop: an efficient program for estimating base population allele frequencies in single and multiple group structured populations. Agricultural and food science 29 3: 166-176.

Hickey, John; Hill, William G.; Blasco, Agustin; Cameron, Neil; Cullis, Brian; McGuirk, Brian; Mäntysaari, Esa; Ruane, John; Simm, Geoff; Veerkamp, Roel; Visscher, Peter M.; Wray, Naomi R. 2019. Students’, colleagues’ and research partners’ experience about work and accomplishments from collaborating with Robin Thompson. Journal of Animal Breeding and Genetics 136 4: 301-309.

Häggman, J.; Christensen, J. M.; Mäntysaari, E. A.; Juga, J. 2019. Genetic parameters for endocrine and traditional fertility traits, hyperketonemia and milk yield in dairy cattle. animal 13 2: 248-255.

Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2019. Efficient Monte Carlo algorithm for restricted maximum likelihood estimation of genetic parameters. Journal of Animal Breeding and Genetics 136 4: 252-261.

Mehtiö, Terhi; Mäntysaari, Päivi; Kokkonen, Tuomo; Kajava, Sari; Prestløkken, Egil; Kidane, Alemayehu; Wallén, Sini; Nyholm, Laura; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin H. 2019. Genetic parameters for cow-specific digestibility predicted by near infrared reflectance spectroscopy. Livestock Science 226: 1-6.

Muuttoranta, Kirsi; Tyrisevä, Anna-Maria; Mäntysaari, Esa A.; Pösö, Jukka; Pedersen Aamand, Gert; Lidauer, Martin H. 2019. Genetic parameters for female fertility in Nordic Holstein and Red Cattle dairy breeds. Journal of Dairy Science 102 9: 8184-8196.

Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa A.; Kokkonen, Tuomo; Mehtiö, Terhi; Kajava, Sari; Grelet, Clement; Lidauer, Paula; Lidauer, Martin H. 2019. Body and milk traits as indicators of dairy cow energy status in early lactation. Journal of Dairy Science 102 9: 7904-7916.

Negussie, Enyew; Mehtiö, Terhi; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2019. Reliability of breeding values for feed intake and feed efficiency traits in dairy cattle: When dry matter intake recordings are sparse under different scenarios. Journal of Dairy Science: 15 p.

Ahvenjärvi, Seppo; Nyholm, L.; Nousiainen, J.; Mäntysaari, E. A.; Lidauer, Martin. 2018. Polyethylene glycol as an indigestible marker to estimate fecal output in dairy cows. Journal of Dairy Science 101 5: 4245–4258.

Gao, Hongding; Koivula, Minna; Jensen, Just; Strandén, Ismo; Madsen, Per; Pitkänen, Timo; Aamand, Gert Pedersen; Mäntysaari, Esa A. 2018. Short communication: Genomic prediction using different single-step methods in the Finnish red dairy cattle population. Journal of Dairy Science 101 11: 10082-10088.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2018. Reducing bias in the dairy cattle single‐step genomic evaluation by ignoring bulls without progeny. Journal of Animal Breeding and Genetics 135 2: 107-115.

Kudinov, Andrei Andreevich; Juga, Jarmo; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo; Saksa, Ekaterina I.; Smaragdov, Michael G.; Uimari, Pekka. 2018. Developing a genetic evaluation system for milk traits in Russian black and white dairy cattle. Agricultural and Food Science 27 2: 85-95.

Matilainen, Kaarina; Strandén, Ismo; Pedersen Aamand, Gert; Mäntysaari, Esa A. 2018. Single step genomic evaluation for female fertility in Nordic Red dairy cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics 135 5: 337-348.

Mehtiö, Terhi; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2018. Genetic background in partitioning of metabolizable energy efficiency in dairy cows. Journal of Dairy Science 101 5: 4268-4278.

Pitkänen, T.J.; Mäntysaari, E.A.; Nielsen, U.S.; Aamand, G.P.; Madsen, P.; Eriksson, J.-Å.; Lidauer, M.H. 2018. Incorporation of observations with different residual error variances into existing complex test-day models. Acta Agriculturae Scandinavica, Section A — Animal Science 68 1: 11-24.

Tyrisevä, Anna-Maria; Fikse, Freddy W.; Mäntysaari, Esa; Jakobsen, Jette; Aamand, Gert P.; Dürr, João; Lidauer, Martin H. 2018. Validation of consistency of Mendelian sampling variance. Journal of Dairy Science 101 3: 2187–2198.

Tyrisevä, Anna-Maria; Mäntysaari, Esa A.; Jakobsen, J.; Aamand, G. P.; Dürr, J.; Fikse, W.F.; Lidauer, Martin H. 2018. Detection of evaluation bias caused by genomic preselection. Journal of Dairy Science 101 4:

Coyne, J.M.; Berry, D.P.; Matilainen, Kaarina; Sevon-Aimonen, M-L.; Mäntysaari, Esa; Juga, J.; Serenius, T.; McHugh, N. 2017. Genetic co-variance functions for live weight, feed intake, and efficiency measures in growing pigs. Journal of Animal Science 95 9: 3822-3832.

Coyne, J. M.; Matilainen, Kaarina; Berry, D. P.; Sevon-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa; Juga, J.; Serenius, T.; McHugh, N. 2017. Estimation of genetic (co)variances of Gompertz growth function parameters in pigs. Journal of Animal Breeding and Genetics 134 2: 136-143.

Mäntysaari, Esa A.; Evans, R. D.; Strandén, Ismo. 2017. Efficient single-step genomic evaluation for a multibreed beef cattle population having many genotyped animals. Journal of Animal Science 95 11: 4728-4737.

Negussie, Enyew; Lehtinen, J.; Mäntysaari, Päivi; Bayat, Ali R.; Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2017. Non-invasive individual methane measurement in dairy cows. Animal 11 5: 890-899.

Strandén, Ismo; Matilainen, Kaarina; Aamand, G. P.; Mäntysaari, Esa. 2017. Solving efﬁciently large single-step genomic best linear unbiased prediction models. Journal of Animal Breeding and Genetics 134 3: 264-274.

Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2017. Single-step SNP-BLUP with on-the-fly imputed genotypes and residual polygenic effects. Genetics Selection Evolution 49: 15 p.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, Gert Pedersen; Mäntysaari, Esa Antero. 2016. Effect of cow reference group on validation reliability of genomic evaluation. Animal 10 6: 1061-1066.

Mehtiö, T.; Rinne, M.; Nyholm, L.; Mäntysaari, P.; Sairanen, A.; Mäntysaari, E. A.; Pitkänen, T.; Lidauer, M. H. 2016. Cow-specific diet digestibility predictions based on near-infrared reflectance spectroscopy scans of faecal samples. Journal of Animal Breeding and Genetics 133 2: 115-125.

Coyne, J. M.; Berry, D. P.; Mäntysaari, E. A.; Juga, J.; McHugh, N. 2015. Comparison of fixed effects and mixed model growth functions in modelling and predicting live weight in pigs. Livestock Science 177: 8-14.

Koivula, M.; Strandén, I.; Pösö, J.; Aamand, G. P.; Mäntysaari, E. A. 2015. Single-step genomic evaluation using multitrait random regression model and test-day data. Journal of Dairy Science 98 4: 2775-2784.

Lidauer, Martin H.; Pösö, Jukka; Pedersen, Jørn; Lassen, Jan; Madsen, Per; Mäntysaari, Esa A.; Nielsen, Ulrik S.; Eriksson, Jan-Åke; Johansson, Kjell; Pitkänen, Timo; Strandén, Ismo; Aamand, Gert P. 2015. Across-country test-day model evaluations for Holstein, Nordic Red Cattle, and Jersey. Journal of Dairy Science 98 2: 1296-1309.

Liinamo, A.-E.; Mäntysaari, P.; Lidauer, M. H.; Mäntysaari, E. A. 2015. Genetic parameters for residual energy intake and energy conversion efficiency in Nordic Red dairy cattle. Acta Agriculturae Scandinavica, Section A - Animal Science 65 2: 63-72.

Mäntysaari, P.; Mäntysaari, E. A. 2015. Modeling of daily body weights and body weight changes of Nordic Red Cows. Journal of Dairy Science 98: 6992-7002.

Makgahlela, Mahlako; Strandén, Ismo; Nielsen, U. S.; Sillanpää, M. J.; Mäntysaari, Esa. 2014. Using the unified relationship matrix adjusted by breed-wise allele frequencies in genomic evaluation of a multibreed population. Journal of Dairy Science 97 2: 1117-1127.

Márkus, Sz.; Mäntysaari, E.A.; Strandén, I.; Eriksson, J-Å.; Lidauer, M.H. 2014. Comparison of multiplicative heterogeneous variance adjustment models for genetic evaluations. Journal of animal breeding and genetics 131 3: 237-246.

Janhunen, Matti; Kause, Antti; Mäntysaari, Esa; Vehviläinen, Harri; Kettunen Præbel, Anne; Järvisalo, Otso; Paananen, Tuija; Koskinen, Heikki. 2013. A novel breeding design to produce genetically protected homogenous fish populations for on-growing. Aquaculture Research 44 12: 1847-1859.

Makgahlela, Mahlako Linah; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo; Koivula, Minna; Nielsen, U. S.; Sillanpää, M. J.; Juga, J. 2013. Across breed multi-trait random regression genomic predictions in the Nordic Red dairy cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics 130 1: 10-19.

Makgahlela, M. L.; Strandén, Ismo; Nielsen, U. S.; Sillanpää, M. J.; Mäntysaari, Esa. 2013. The estimation of genomic relationships using breedwise allele frequncies among animals in multibreed populations. Journal of Dairy Science 96 8: 5364-5375.

Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin H.; Strandén, Ismo; Thompson, Robin. 2013. Employing a Monte Carlo algorithm in Newton-type methods for restricted maximum likelihood estimation of genetic parameters. PLoS ONE 8 12: 7 p.

Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2013. Genetic associations of test-day fat : protein ratio with milk yield, fertility, and udder health traits in Nordic Red cattle. Journal of Dairy Science 96 2: 1237-1250.

Peura, J.; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2013. Profitable blue fox production : Economic values for Finnish blue fox. Acta Agriculturae Scandinavica, Section A - Animal Science 63 1: 2-9.

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2013. Use of random regression model as an alternative for multibreed relationship matrix. Journal of Animal Breeding and Genetics 130 1: 4-9.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Su, G.; Mäntysaari, Esa A. 2012. Different methods to calculate genomic predictions : comparisons of BLUP at the single nucleotide polymorphism level (SNP-BLUP), BLUP at the individual level (G-BLUP), and the one-step approach (H-BLUP). Journal of Dairy Science 95 7: 4065-4073.

Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa. 2012. Short communication: Genetic parameters for feed intake, production, and extent of negative energy balance in Nordic Red dairy cattle. Journal of dairy science 95 11: 6788-6794.

Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin H.; Strandén, Ismo; Thompson, R. 2012. Employing a Monte Carlo algorithm in expectation maximization restricted maximum likelihood estimation of the linear mixed model. Journal of Animal Breeding and Genetics 129 6: 457-468.

Mäntysaari, Päivi; Liinamo, A.-E.; Mäntysaari, Esa. 2012. Energy efficiency and its relationship with milk, body, and intake traits and energy status among primiparous Nordic Red Dairy Cattle. Journal of dairy science 95 6: 3200-3211.

Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Tsuruta, S.; Mäntysaari, Esa A. 2012. Longitudinal threshold model analysis of clinical mastitis using linear splines. Livestock Science 149 1-2: 173-179.

Su, Guosheng; Madsen, P.; Nielsen, U. S.; Mäntysaari, Esa A.; Aamand, G. P.; Christensen, O. F.; Lund, M. S. 2012. Genomic prediction for Nordic Red Cattle using one-step and selection index blending. Journal of Dairy Science 95 2: 909-917.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2011. New breeding value evaluation of fertility traits in Finnish mink. Acta Agriculturae Scandinavica. Section A. Animal Science 61 1: 1-6.

Tyrisevä, Anna-Maria; Meyer, Karin; Fikse, W Freddy; Ducrocq, Vincent; Jakobsen, Jette; Lidauer, Martin H; Mäntysaari, Esa A. 2011. Principal component approach in variance component estimation for international sire evaluation. Genetics Selection Evolution 43: 13 p.

Tyrisevä, Anna-Maria; Meyer, Karin; Fikse, W. Freddy; Ducrocq, Vincent; Jakobsen, Jette; Lidauer, Martin H.; Mäntysaari, Esa A. 2011. Principal component and factor analytic models in international sire evaluation. Genetics Selection Evolution 43 33: 10 p.

Kempe, Riitta; Koskinen, Nita; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2010. The genetics of body condition and leg weakness in the blue fox (Alopex lagopus). Acta Agriculturae Scandinavica, Section A - Animal Science 60 3: 141-150.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2010. Genetic and phenotypic parameters of age at first mating, litter size and animal size in Finnish mink. Animal 4 2: 183-188.

Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa A. 2010. Predicting early lactation energy balance in primiparous Red Dairy Cattle using milk and body traits. Acta agriculturae Scandinavica Section A 60 2: 79-87.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2009. New fertility traits in breeding value evaluation of Finnish blue fox. Acta Agriculturae Scandinavica. Section A Animal Science 59 3: 131-136.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2009. Direct and maternal genetic effects on first litter size, maturation age, and animal size in Finnish minks. Journal of Animal Science 87 10: 3083-3088.

Matilainen, Kaarina; Mrode, Raphael; Strandén, Ismo; Thompson, Robin; Mäntysaari, Esa A. 2009. Linear threshold animal model for birth weight, gestation length and calving ease in United Kingdom Limousin beef cattle data. Livestock Science 122 2-3: 143-148.

Kempe, Riitta; Strandén, Ismo; Koivula, Minna; Rekilä, Teppo; Koskinen, Nita; Mäntysaari, Esa. 2008. Genetic parameters of feed efficiency and its relationships with feed intake, daily gain and aminal size traits in Finnish blue fox (Alopex lagopus). Scientifur 32 4: 47-52.

Koivula, Minna; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Strandén, Ismo; Matilainen, Kaarina; Serenius, Timo; Stalder, K. J.; Mäntysaari, Esa A. 2008. Genetic (co)variances and breeding value estimation of Gompertz growth curve parameters in Finnish Yorkshire boars, gilts and barrows. Journal of animal breeding and genetics 125 3: 168-175.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2008. Genetic parameters for litter size and grading traits in Finnish mink population. Scientifur 32 4: 53-58.

Lidauer, Martin H.; Emmerling, R.; Mäntysaari, Esa A. 2008. Multiplicative random regression model for heterogeneous variance adjustment in genetic evaluation for milk yield in Simmental. Journal of animal breeding and genetics 125 3: 147-159.

Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa A. 2008. Relationship of body measurements and body condition score to body weight in modern Finnish Ayrshire cows. Acta agriculturae Scandinavica. Section A Animal Science 58 4: 170-178.

Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2008. Genetic analysis of liability to clinical mastitis, with somatic cell score and production traits using bivariate threshold-linear and linear-linear models. Livestock Science 117 1: 52-59.

Kause, Antti; Tobin, Declan; Mäntysaari, Esa; Martin, Samuel; Houlihan, Dominic; Kiessling, Anders; Rungruangsak-Torrisen, Krisna; Ritola, Ossi; Ruohonen, Kari. 2007. Genetic potential for simultaneous selection of growth and body composition in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) depends on the dietary protein and lipid content : phenotypic and genetic correlations on two diets. Aquaculture 271 1-4: 162-172.

Koivula, Minna; Nousiainen, Jouni I; Nousiainen, Juha; Mäntysaari, Esa A. 2007. Use of herd solutions from a random regression test-day model for diagnostic dairy herd management. Journal of dairy science 90 5: 2563-2568.

Koivula, Minna; Pitkälä, Anna; Pyörälä, Satu; Mäntysaari, Esa. 2007. Distribution of bacteria and seasonal and regional effects in a new database for mastitis pathogens in Finland. Acta Agriculturae Scandinavica, Section A - Animal Science 57 2: 89-96.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa A. 2007. Bias in genetic evaluation using random regression test-day model. Agricultural and Food Science 16 2: 103-114.

Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2007. Genetic analysis of clinical mastitis during different risk periods in Finnish Ayrshire. Agricultural and Food Science 16 2: 115-123.

Peura, Jussi; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2007. Genetic parameters for Finnish blue fox population: litter size, age at first insemination and pelt size. Agricultural and Food Science 16 2: 136-146.

Kause, Antti; Tobin, Declan; Dobly, Alexandre; Houlihan, Dominic; Martin, Sam; Mäntysaari, Esa A.; Ritola, Ossi; Ruohonen, Kari. 2006. Recording strategies and selection potential of feed intake measured using the X-ray method in rainbow trout. Genetics selection evolution 38 4: 389-410.

Kause, Antti; Tobin, D.; Houlihan, D.F.; Martin, S.A.M.; Mäntysaari, Esa; Ritola, O.; Ruohonen, K. 2006. Feed efficiency of rainbow trout can be improved through selection : different genetic potential on alternative diets. Journal of animal science 84 4: 807-817.

Martinez, Victor; Kause, Antti; Mäntysaari, Esa A; Mäki-Tanila, Asko. 2006. The use of alternative breeding schemes to enhance genetic improvement in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) : I. one-stage selection. Aquaculture 254 1-4: 182-194.

Martinez, Victor; Kause, Antti; Mäntysaari, Esa; Mäki-Tanila, Asko. 2006. The use of alternative breeding schemes to enhance genetic improvement in rainbow trout : II. two-stage selection. Aquaculture 254 1-4: 195-202.

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2006. Genetic parameters and single versus multi-trait evaluation of udder health traits. Acta agriculturae Scandinavica. Section A Animal Science 56 2: 73-82.

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2006. Genetic evaluation of somatic cell score in dairy cattle considering first and later lactations as two different but correlated traits. Journal of animal breeding and genetics 123 4: 224-238.

Tobin Declan; Kause, Antti; Mäntysaari, Esa A.; Martin, Samuel A.M.; Houlihan, Dominic F.; Dobly, Alexandre; Kiessling, Anders; Rungruangsak-Torrissen, Krisna; Ritola, Ossi; Ruohonen, Kari. 2006. Fat of lean? : the quantitative genetic basis for selection strategies of muscle and body composition traits in breeding schemes of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Aquaculture 261 2: 510-521.

Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa. 2006. Estimation of non-linear growth models by linearization : a simulation study using a Gompertz function. Genetics, selection, evolution 38 4: 343-358.

Kause, Antti; Ritola, O.; Paananen, T.; Wahlroos, Heli; Mäntysaari, Esa. 2005. Genetic trends in growth, sexual maturity and skeletal deformations, and rate of inbreeding in a breeding programme for rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Aquaculture 247 1-4: 177-187.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa; Negussie, Enyew; Serenius, Timo. 2005. Genetic and phenotypic relationships among milk yield and somatic cell count before and after clinical mastitis. Journal of dairy science 88: 827-833.

Peura, Jussi; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2005. Genetic parameters in Finnish blue fox population : pelt character and live animal grading traits. Acta agriculturae Scandinavica. Section A Animal Science 55 4: 137-144.

Koivula, Minna; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa. 2004. Genetic parameters for test-day somatic cell count at different lactation stages of Finnish dairy cattle. Livestock production science 90 2-3: 145-157.

Serenius, Timo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Kause, Antti; Mäntysaari, Esa; Mäki-Tanila, Asko. 2004. Genetic associations of prolificacy with performance, carcass, meat quality, and leg conformation traits in the Finnish Landrace and Large White pig populations. Journal of animal science 82 8: 2301-2306.

Serenius, Timo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Kause, Antti; Mäntysaari, Esa; Mäki-Tanila, Asko. 2004. Selection potential of different prolificacy traits in the Finnish Landrace and Large White populations. Acta agriculturae Scandinavica. Section A Animal science 54 1: 36-43.

Thompson, Robin; Mäntysaari, Esa. 2004. Prospects for statistical methods in animal breeding. Journal of the Indian Society of Agricultural Statistics 57: 15-25.

Vahlsten, Terhi; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2004. Coefficients of relationship and inbreeding among Finnish Ayrshire and Holstein-Friesian. Agricultural and Food Science 13 4: 338-347.

Kause, Antti; Ritola, O.; Paananen, T.; Eskelinen, U.; Mäntysaari, Esa. 2003. Big and beautiful? : quantitative genetic parameters for appearance of large rainbow trout. Journal of fish biology 62: 610-622.

Kause, Antti; Ritola, Ossi; Paananen, Tuija; Mäntysaari, Esa; Eskelinen, Unto. 2003. Selection against early maturity in large rainbow trout Oncorhynchus mykiss : the quantitative genetics of sexual dimorphism and genotype-by-environment interactions. Aquaculture 228: 53-68.

Korpiaho, Päivi; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2003. Bull selection across age classes and variable female reproductive rates in an open nucleus breeding scheme for dairy cattle. Acta Agriculturae Scandinavica. Section A Animal Science 53 2: 74-82.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2003. Comparison of test-day models for genetic evaluation of production traits in dairy cattle. Livestock production science 79 1: 73-86.

Serenius, Timo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa. 2003. Effect of service sire and validity of repeatability model in litter size and farrowing interval of Finnish Landrace and Large White populations. Livestock production science 81 2-3: 213-222.

Kause, Antti; Ritola, Ossi; Paananen, Tuija; Mäntysaari, Esa; Eskelinen, Unto. 2002. Coupling body weight and its composiotion: a quantitative genetic analysis in rainbow trout. Aquaculture 211: 65-70.

Mäntysaari, Päivi; Ojala, Matti; Mäntysaari, Esa A. 2002. Measures of before and after breeding daily gains of dairy replacement heifers and their relationship with first lactation milk production traits. Livestock production science 75 3: 313-322.

Serenius, Timo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa. 2001. The genetics of leg weakness in Finnish Large White and Landrace populations. Livestock production science 69 2: 101-111.

Strandén, Ismo; Korpiaho, Päivi; Pakula, Maria; Mäntysaari, Esa. 2001. Bull selection in MOET nucleus breeding schemes with limited testing capacity. Acta agriculturae Scandinavica. Section A Animal Science 51 4: 235-245.

Kettunen, Anne; Mäntysaari, Esa; Pösö, Jukka. 2000. Estimation of genetic parameters for daily milk yield of primiparous Ayrshire cows by random regression test-day models. Livestock production science 66 3: 251-261.

Misztal, I.; Strabel, T.; Jamrozik, J.; Mäntysaari, Esa; Meuwissen, T. H. E. 2000. Strategies for estimating the parameters needed for different test-day models. Journal of dairy science 83 5: 1125-1134.

Lidauer, Martin; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa; Pösö, Jukka; Kettunen, Anne. 1999. Solving large test-day models by iteration on data and preconditioned conjugate gradient. Journal of dairy science 82: 2788-2796.

Thuneberg-Selonen, Terhi; Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa; Ojala, Matti. 1999. Use of individual race results in the estimation of genetic parameters of trotting performance for Finnhorse and Standardbred trotters. Agricultural and Food Science in Finland 8 4-5: 353-363.

Kaustell, K.; Mäntysaari, Esa; Huhtanen, Pekka. 1998. Concentrate feeding and milk yield based on the field data of milk recorded herds. Agricultural and Food Science in Finland 7 4: 423-436.

Jensen, Just; Mäntysaari, Esa A.; Madsen, Per; Thompson, Robin. 1997. Residual maximum likelihood estimation of (co)variance components in multivariate mixed linear models using average information. Journal of the Indian society of agricultural statistics 49: 215-236.

Kettunen, Anne; Mäntysaari, Esa A. 1996. Estimation of genetic parameters for test-day milk production at different stages of lactation of Finnish Ayrshire heifers. Agricultural and Food Science in Finland 5 2: 185-192.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 1996. Detection of bias in animal model pedigree indices of heifers. Agricultural and Food Science in Finland 5 4: 387-397.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 1996. Genetic constitution of the Finnish Black and White cattle population and the influence of Holsteinization on protein yield, days open and somatic cell count. Acta agriculturae Scandinavica. Section A Animal Science 46: 193-200.

Mäki-Tanila, Asko; Mäntysaari, Esa A. 1996. Embryo transfer technology and its use in enhancing dairy cattle breeding : foreword. Agricultural and Food Science in Finland 5 5: 487-490.

"Mäntysaari, Esa A.; Thuneberg-Selonen, Terhi; Hyppänen, Kaija; Juga, Jarmo. 1996. Finnish embryo transfer breeding program ""ASMO"": description of the goals and a summary of the results of initial selection. Agricultural and Food Science in Finland 5 5: 491-501. "

Uimari, Pekka; Mäntysaari, Esa A. 1995. Relationship between bull dam herd characteristics and bias in estimated breeding value of bull. Agricultural Science in Finland 4 5-6: 463-472.

Woolliams, John; Mäntysaari, Esa. 1995. Genetic contribution of Finnish Ayrshire bulls over four generations. Animal Production 61 2: 177-187.

Schulman, Nina; Tuiskula-Haavisto, Maria; Siitonen, Liisa; Mäntysaari, Esa. 1994. Genetic variation of residual feed consumption in a selected Finnish egglayer population. Poultry Science 73 10: 1479-1484.

Mäntysaari, Esa; Bonn, Marianne; Strandén, Ismo. 1993. Optimal relaxation factors in solving mixed model equations by successive overrelaxation. Journal of Animal Science 71 Suppl. 1: 103.

Mäntysaari, Esa; Gröhn, Yrjö; Quaas, R. L. 1993. Repeatability and heritability of lactational occurrence of reproductive disorders in dairy cows. Preventive Veterinary Medicine 17: 111-125.

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa; Mäki-Tanila, Asko. 1993. Change in genetic correlation due to selection using animal model evaluation. Journal of Animal Breeding and Genetics 110: 412-422.

Uimari, Pekka; Mäntysaari, Esa. 1993. Rebeatability and bias of estimated breeding values for dairy bulls and bull dams calculated from animal model evaluations. Animal Production 57: 175-182.

Velmala, Riikka; Mäntysaari, Esa A.; Mäki-Tanila, Asko. 1993. Molecular genetic polymorphism at the k-casein and ß-lactoglobulin loci in Finnish dairy bulls. Agricultural Science in Finland 2 5: 431-435.

Strandén, Ismo; Mäntysaari Esa. 1992. Animal model evaluation in Finland: Experience with two algorithms. Journal of Dairy Science 75: 2017-2022.

Mäntysaari, Esa; Gröhn, Y.T.; Quaas. 1991. Clinical Ketosis: Phenotypic and genetic correlations between occurrences and with milk yield. Journal of Dairy Science 74 11: 3985-3993.

Mäntysaari, Esa; Quaas, R.L.; Gröhn, Y.T. 1991. Simulation Study on Covariance Component Estimation for Two Binary Traits in an Underlying Continuous Scale. Journal of dairy science 74: 580-591.

A2 Review article in a scientific journal (refereed)

Ben Zaabza, Hafedh; Van Tassell, Curtis P.; Vandenplas, Jeremie; VanRaden, Paul; Liu, Zengting; Eding, Herwin; McKay, Stephanie; Haugaard, Katrine; Lidauer, Martin H.; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2023. Invited review: Reliability computation from the animal model era to the single-step genomic model era. Journal of Dairy Science 106 3: 1518-1532.

Mäntysaari, E.A.; Koivula, M.; Strandén, I. 2020. Symposium review: Single-step genomic evaluations in dairy cattle. Journal of dairy science 103 6: 5314-5326.

A4 Article in a conference publication (refereed)

Taskinen, Matti; Leino, Anna-Maria; Pitkänen, Timo J.; Mäntysaari, Esa A. 2022. Estimating metafounder relations for Finnish multibreed beef population.1339-1342. Wageningen Academic Publishers

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2018. Comparison of ssGBLUP and ssGTBLUP using Nordic Holstein TD data. In: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. 6.

Lidauer, Martin H.; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Päivi; Mehtiö, Terhi; Negussie, Enyew. 2018. Improving feed efficiency and net merit by including maintenance requirement in selection of dairy cattle. Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production Biology - Feed Intake and Efficiency 1: 5 p.

Matilainen, Kaarina; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2018. Genomic evaluation for male fertility in Nordic Red dairy cattle. In: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. 6 p.

Mehtiö, Terhi; Mäntysaari, Päivi; Kokkonen, T.; Kajava, S.; Latomäki, T.; Nyholm, L.; Grelet, C.; Pitkänen, Timo; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin H. 2018. Developing an indicator for body fat mobilisation using mid-infrared spectrometry of milk samples in dairy cows. Kongressijulkaisu WCGALP 2018: p. 815.

Strandén, Ismo; Taskinen, Matti; Matilainen, Kaarina; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa A. 2018. Efficient single-step BLUP computations with MiX99 software. In: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. 7 p.

Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2018. Numerically efficient fully orthogonalized Single-step SNP-BLUP. In: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. 5 p.

Coyne, J. M.; Sevon-Aimonen, Marja-Liisa; Berry, D. P.; Mäntysaari, Esa; Juga, J.; McHugh, N. 2014. Estimation of Genetic (Co)variances of von Bertalanffy and Gompertz Growth Function Parameters in Pigs. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [3 p.].

Knürr, Timo; Strandén, Ismo; Koivula, Minna; Aamand, G. P.; Mäntysaari, Esa. 2014. Haplotype-assisted genomic evaluations in Nordic Red dairy cattle. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [4 p.].

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, G. P.; Mäntysaari, Esa. 2014. Effect of cow reference group on validation accuracy of genomic evaluation. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [3 p.].

Matilainen, K.; Strandén, I.; Mäntysaari, E. A. 2014. Approximation of standard errors of estimates as a by-product for MC EM REML analysis. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [3 p.].

Mehtiö, Terhi; Rinne, Marketta; Nyholm, L.; Sairanen, Auvo; Pitkänen, Timo; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2014. Variability of cow-specific organic matter digestibility within lactation and across cows based on NIRS scans from fecal samples. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [3 p.].

Mäntysaari, Esa. 2014. Challenges in Industry Application of Genomic Prediction Experiences from Dairy Cattle. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [6 p.].

Negussie, Enyew; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2014. Animal wise variation in enteric methane output traits and its relationships with feed efficiency in dairy cattle : a longitudinal model analysis. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [3 p.].

Pitkänen, Timo; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2014. Application for herd total production forecast based on the solutions from the national test day evaluations. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [3 p.].

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2014. Comparison of Some Equivalent Equations to Solve Single-Step GBLUP. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [3 p.].

Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa; Aamand, G. P.; Strandén, Ismo. 2014. Comparison of breeding values from single-step and bivariate blending methods. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [3 p.].

Tyrisevä, Anna-Maria; Lidauer, Martin; Aamand, G. P.; Mäntysaari, Esa. 2014. New simulation method to create data sets with a desired genetic trend. In: Proceedings, 10th world congress of genetics applied to livestock production. [3 p.].

Strandén, Ismo; Lidauer, Martin; Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa. 2004. Joint genetic evaluation of Nordic dairy cattle. In: Proceedings of the XXI Genetic Days, 1-3 September 2004, Wroclaw, Poland. Animal science papers and reports 22 Suppl. 2: 143-149.

B1 Article in a scientific magazine (non-refereed)

Koivula, Minna; Nielsen, Ulrik; Strandén, Ismo; Aamand, Gert; Mäntysaari, Esa. 2022. Nordic Holstein single-step test day model using left truncated genomic data. Interbull Bulletin 57: 37-41.

Kudinov, Andrei; Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, Gert; Mäntysaari, Esa. 2021. Single-step genomic predictions of a minor breed, concurrently with the national genomic evaluations of main breeds. Interbull bulletin 52: 174-179.

Kärkkäinen, Hanni; Ducrocq, Vincent; Borchersen, Søren; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2019. Multitrait Across Country Genomic Evaluations for EuroGenomics Countries ─ Daughter Information Approximation Method. Interbull Bulletin 55: 88-93.

Kärkkäinen, Hanni; Ducrocq, Vincent; Borchersen, Søren; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2019. Multitrait Across Country Genomic Evaluations for Eurogenomics Countries ─ Research Plan and First Results. Interbull Bulletin 54: 4 p.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, Gert Pedersen; Mäntysaari, Esa. 2017. Validation of genomic and genetic evaluations in 305d production traits of Nordic Holstein cattle. Interbull bulletin 51:

Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2016. Genomic data and breeding value estimation in dairy cattle: theory, practice, problems. Journal of Animal Breeding and Genetics 133 3: 165-166.

Mäntysaari, Esa; Liu, Zengting; VanRaden, Paul. 2010. Interbull validation test for genomic evaluations. Interbull Bulletin 41, 2010: 5 p.

Toivakka, Minna; Mäntysaari, Esa. 2006. Sonnien kestävyysindeksien ennustaminen tuotanto- hedelmällisyys-, terveys- ja rakenneominaisuuksien jalostusarvoilla. In: Kestävä lehmä : lypsylehmien poiston syyt ja kestävyyden taloudellinen merkitys, MTT:n selvityksiä 112 / Anna-Maija Heikkilä (toim.). MTT:n selvityksiä 112: s. 75-82.

Juga, Jarmo; Mäntysaari, Esa A.; Pösö, Jukka. 1999. Economic response to total merit selection in Finnish Ayrshire breeding. Bulletin : International Bull Evaluation Service 23: 79-87.

Mäntysaari, Esa; Huhtanen, Pekka; Kaustell, Kaisa; Kettunen, Anne; Lidauer, Martin; Pösö, Jukka; Strandén, Ismo. 1999. Karjantarkkailun koelypsykohtaisten mittausten käyttäminen eläinarvostelussa ja tuotannon ohjauksessa. In: Maidon uudet sovellukset : tutkimusohjelman loppuraportti / Hannu Korhonen ja Pirjo Rantamäki (toim.). Maatalouden tutkimuskeskuksen julkaisuja. Sarja A 55: p. 37-46.

Kaustell, Kaisa; Mäntysaari, Esa; Huhtanen, Pekka. 1996. Tuotostason ja maidon koostumuksen väliset yhteydet tila-aineistossa. In: Kotieläintieteen päivät 1996 : Kotieläintiede 90 vuotta -juhlaseminaari. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 905: p. 131-135.

Mäntysaari Esa. 1992. Eläinmalliin perustuvat jalostusarvon ennusteet. Suomen Maataloustieteellisen seuran tiedote 16: 158-164.

B2 Part of a book or another research book (non-refereed)

Juga, Jarmo; Sillanpää, Mikko J.; Mäntysaari, Esa. 2012. Lypsykarjan genominen valinta. In: Maailma muuttuu : muuttuuko maatalous? / Mervi Seppänen (toim.). p. 165-172.

Juga, Jarmo; Sillanpää, Mikko; Mäntysaari, Esa. 2012. Genomisk selektion av mjölkboskap. In: Världen förändras : förändras jordbruket? / Mervi Seppänen (red.). p. 165-172.

Mäntysaari, Esa; Korpiaho, Päivi; Strandén, Ismo. 2001. ASMO-ydinkarjajalostusohjelma ja jalostusohjelmaoptimointi. In: Uuden alkioteknologian soveltaminen ASMO-ohjelman perustamisessa : loppuraportti / Asko Mäki-Tanila (toim.). p. 7-15.

B3 Non-refereed article in conference proceedings

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2023. Pre-selection approaches or some models with Mendelian sampling terms. In: Interbull Bulletin. Interbull Bulletin 58: 37-40.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, G. P.; Mäntysaari, Esa. 2021. Meta-model for genomic relationships of metafounders applied on large scale single-step random regression test-day model. Interbull Bulletin 56: 76-81.

Sullivan, Peter G.; Mäntysaari, Esa; DeJong, Gerben; Benhajali, Haifa. 2019. Modifying MACE to accommodate genomic preselection effects. In: Proceedings of the 2019 Interbull Meeting. Interbull Bulletin 55 55: 77-80.

Ahvenjärvi, Seppo; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin; Nousiainen, Juha; Nyholm, Laura. 2018. Chitin as an indigestible marker could be used to measure fecal output in dairy cows by NIRS. In: Proceedings of the 10th International Symposium on the Nutrition of Herbivores / René Baumont, Mathieu Silberberg, Isabelle Cassar-Malek (eds.). Advances in Animal Biosciences 9 Special issue 3: 500 p.

Kokkonen, Tuomo; Mäntysaari, Päivi; Kajava, Sari; Mehtiö, Terhi; Latomäki, Timo; Nyholm, Laura; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2018. Prediction of plasma non-esterified fatty acid concentration of dairy cows using milk fatty acids and mid-infrared spectroscopy. In: Proceedings of the 10th International Symposium on the Nutrition of Herbivores. Advances in Animal Biosciences 9 S3:

Pitkänen, Timo J.; Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2018. Integration of external information into the national multitrait evaluation model. In: Book of Abstracts of the 69th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science. Dubrovnik, Croatia, 27-31 August 2018 / Scientific Committee (ed.). EAAP Book of Abstracts Volume 24: p. 122.

Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2018. Solving single-step GBLUP MME by extended KKT equations and Block Anti-Triangular factorization. In: Book of Abstracts of the 69th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science. EAAP Book of Abstracts 24: p. 611.

Kudinov, A.; Juga, J.; Uimari, P.; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Plemyashov, K.V.; Saksa, E.I.; Smaragdov, M.G. 2017. Upgrading Dairy Cattle Evaluation System in Russian Federation. In: Proceedings of the 2017 Interbull Meeting, Tallinn, Estonia, August 25 - 28, 2017. Interbull bulletin 51: 67-74.

Tyrisevä, Anna-Maria; Muuttoranta, Kirsi; Pösö, J.; Nielsen, U. S.; Eriksson, J.-Å.; Aamand, G. P.; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin H. 2017. Evaluation of Conception Rate in Nordic Dairy Cattle. In: Proceedings of the 2017 Interbull Meeting, Tallinn, Estonia, August 25 - 28 2017. Interbull Bulletin 51: 57-62.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2016. Genomisessa eläinmallissa käytetään sekä genotyypitettyjen että genotyypittämättömien eläinten tietoja. In: Proceedings, Maataloustieteen Päivät 2016. Suomen Maataloustieteellinen Seura. [5 p.].

Matilainen, Kaarina; Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa. 2016. Managing genetic groups in single-step genomic evaluations applied on female fertility traits in Nordic Red Dairy cattle. Interbull Bulletin 50: 71-75.

Matilainen, Kaarina; Strandén, Ismo; Tyrisevä, Anna-Maria; Mäntysaari, Esa. 2016. Pohjoismaisten punaisten rotujen hedelmällisyysarvostelu genomisella eläinmallilla. In: Proceedings, Maataloustieteen Päivät 2016. Suomen Maataloustieteellinen Seura. [6 p.].

Mehtiö, Terhi; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2016. Lypsylehmien muuntokelpoisen energian saannin mallinnus rehuhyötysuhdeominaisuuksien kehittämistä varten. In: Proceedings, Maataloustieteen Päivät 2016. Suomen Maataloustieteellinen Seura. [7 p.].

Mäntysaari, Päivi; Kokkonen, Tuomo; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2016. Elopaino, kuntoluokka ja maidon pitoisuudet lehmän energiataseen kuvaajana. In: Proceedings, Maataloustieteen Päivät 2016. Suomen Maataloustieteellinen Seura. [7 p.].

Muuttoranta, K.; Tyrisevä, A.-M.; Mäntysaari, E. A.; Pösö, J.; Aamand, G. P.; Eriksson, J.-Å.; Nielsen, U. S.; Lidauer, M. H. 2015. Genetic parameters for female fertility in Nordic dairy cattle. Interbull Bulletin 49: 32-35.

Knürr, Timo; Strandén, Ismo; Koivula, Minna; Aamand, Gert Pedersen; Mäntysaari, Esa A. 2014. Haplotype-assisted genomic evaluations in Nordic Red Dairy Cattle. In: Maataloustieteen Päivät 2014, 8.-9.1.2014 Viikki, Helsinki : esitelmät ja posterit / Toim. Mikko Hakojärvi ja Nina Schulman. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 30: [6 p.].

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2014. Jalostusarvojen laskenta genomisella eläinmallilla. In: Maataloustieteen Päivät 2014, 8.-9.1.2014 Viikki, Helsinki : esitelmät ja posterit / Toim. Mikko Hakojärvi ja Nina Schulman. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 30: [6 p.].

Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa. 2014. Lehmien elopainon ja painonmuutosten mallintaminen päivittäisten punnitusten avulla. In: Maataloustieteen Päivät 2014, 8.-9.1.2014 Viikki, Helsinki : esitelmät ja posterit / Toim. Mikko Hakojärvi ja Nina Schulman. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 30: [7 p.].

Makgahlela, Mahlako; Knürr, Timo; Aamand, G.P.; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa, A. 2013. Single step evaluations using haplotype segments. In: Proceedings of the 2013 Interbull meeting, Nantes, France, August 23-25 2013. Interbull Bulletin 47: 217-221.

Pitkänen, Timo; Mäntysaari, Esa A.; Nielsen, U.S.; Aamand, G.P.; Madsen, P.; Lidauer, Martin. 2013. Simulation study on heterogeneous variance adjustment for observations with different measurement error variance. In: Proceedings of the 2013 Interbull meeting, August 23-25, Nantes, France, 2013. Interbull Bulletin 47: 182-186.

Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin; Knürr, Timo; Pösö, J.; Su, G.; Aamand, G.P.; Strandén, Ismo. 2013. Comparison of model reliabilities from single-step and bivariate blending methods. In: Proceedings of the 2013 Interbull meeting, August 23-25, Nantes, France, 2013. Interbull Bulletin 47: 246-251.

Tyrisevä, Anna-Maria; Mäntysaari, Esa; Jakobsen, J.; Aamand, G.P.; Dürr, J.; Fikse, W.F.; Lidauer, Martin. 2013. Detection of genomic pre-selection with Mendelian sampling variance test. In: Proceedings of the 2013 Interbull meeting, Nantes, France, August 23-25 2013. Interbull Bulletin 47: 197-202.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2012. SNP-BLUP, G-BLUP ja H-BLUP : johdanto genomisiin arvosteluihin. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmät, posterit / Toim. Nina Schulman ja Heini Kauppinen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 28: 5 p.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Pösö, Jukka; Pedersen Aamand, Gert; Mäntysaari, Esa A. 2012. Single step genomic evaluations for the Nordic Red Dairy Cattle test day data. In: Proceedings of the 2012 Interbull meeting, Cork, Ireland, May 28-31, 2012. Interbull Bulletin 46: 115-120.

Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa. 2012. Lypsylehmien energiatehokkuuden perinnölliset tunnusluvut ja yhteydet maidontuotantoon, kuiva-aineen syöntiin, elopainoon ja kuntoluokkaan. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmät, posterit / Toim. Nina Schulman ja Heini Kauppinen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 28: 6 p.

Makgahlela, Mahlako Linah; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo; Koivula, Minna; Nielsen, U. S.; Sillanpää, M. J.; Juga, J. 2012. Investigation of reliability of genomic predictions in the admixed Nordic Red dairy cattle. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmät, posterit / Toim. Nina Schulman ja Heini Kauppinen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 28: 5 p.

Makgahlela, Mahlako Linah; Strandén, Ismo; Nielsen, Ulrik S.; Sillanpää, Mikko J.; Juga, Jarmo; Mäntysaari, Esa A. 2012. Comparative assessment of methods for estimating genomic relationships and their use in predictions in an admixed population. In: Proceedings of the 2012 Interbull meeting, Cork, Ireland, May 28-31, 2012. Interbull Bulletin 46: 92-96.

Mäntysaari, Esa A.; Koivula, Minna. 2012. GEBV validation test revisited. In: Proceedings of the 2012 Interbull technical workshop, Verona, Italy, February 2-3, 2012. Interbull Bulletin 45: 5 p.

Mäntysaari, Päivi; Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Esa. 2012. Eläinten välinen vaihtelu rehun hyväksikäytössä ayrshire ensikoilla. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmät, posterit / Toim. Nina Schulman ja Heini Kauppinen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 28: 7 p.

Negussie, Enyew; Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin. 2012. Genetic tools to mitigate the environmental impact of milk production systems : experience with a multi-point individual cow methane measurement system. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmät, posterit / Toim. Nina Schulman ja Heini Kauppinen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 28: 7 p.

Pitkänen, Timo; Mäntysaari, Esa A.; Nielsen, Ulrik S.; Aamand, G. P.; Madsen, P.; Lidauer, Martin H. 2012. Measurement error variance of test-day observations from automatic milking systems. In: Proceedings of the 2012 Interbull meeting, Cork, Ireland, May 28-31, 2012. Interbull Bulletin 46: 103-108.

Tyrisevä, Anna-Maria; Mäntysaari, Esa A.; Jakobsen, J.; Aamand, G. P.; Dürr, J.; Fikse, W. F.; Lidauer, Martin H. 2012. Validation of consistency of Mendelian sampling variance in national evaluation models. In: Proceedings of the 2012 Interbull meeting, Cork, Ireland, May 28 - 31, 2012. Interbull Bulletin 46: 97-102.

Makgahlela, Mahlako L.; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo; Koivula, Minna; Sillanpää, M. J.; Nielsen, U. S.; Juga, J. 2011. Across breed multi-trait random regression genomic predictions in the Nordic Red dairy cattle. Interbull Bulletin 44: 42-46.

Mäntysaari, Esa A.; Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Pösö, Jukka; Aamand, Gert P. 2011. Estimation of GEBVs using deregressed individual cow breeding values. Interbull Bulletin 44: 19-24.

Pitkänen, Timo; Mäntysaari, Esa A.; Rinne, Marketta; Lidauer, Martin. 2011. Animal wise prediction of milk, protein and fat yield using solutions from the Nordic test day model. In: Book of abstracts of the 62nd annual meeting of the European Federation of Animal Science, Stavanger, Norway 29 August - 2 September 2011. EAAP book of abstracts 17: p. 224.

Tyrisevä, Anna-Maria; Mäntysaari, Esa A.; Fikse, F.; Lidauer, Martin H. 2011. Simulation study on Mendelian sampling variance tests. In: Proceedings of the 2011 Interbull meeting, Stavanger, Norway, August 27-29 2011. Interbull Bulletin 44: 57-61.

Kettunen Praebel, Anne; Koljonen, M.-L.; Kiuru, T.; Koskinen, H.; Vehviläinen, Harri; Mäntysaari, Esa A. 2010. Empirical evaluation of the potential of walk-back selection in breeding programme for European whitefish (Coregonus lavaretus L.). In: Proceedings of the 9th world congress on genetics applied to livestock production : August 1-6, 2010 Leipzig, Germany. [4 p.].

Lidauer, Martin H.; Mäntysaari, Esa A.; Pösö, J.; Eriksson, J.-Å.; Nielsen, U. S.; Aamand, G. P. 2010. Heterogeneous variance adjustment in across-country genetic evaluation with country-specific heritabilities. In: Proceedings of the 9th world congress on genetics applied to livestock production : August 1-6, 2010 Leipzig, Germany. [4 p.].

Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa A. 2010. Genetic parameters for feed intake, production and extent of negative energy balance in Nordic Red dairy cattle. In: Proceedings of the 9th world congress on genetics applied to livestock production : August 1-6, 2010 Leipzig, Germany. [4 p.].

Mäntysaari, Esa A. 2010. Use of bivariate EBV-DGV model to combine national breeding value evaluations and genomic evaluations. In: Proceedings of the 9th world congress on genetics applied to livestock production : August 1-6, 2010 Leipzig, Germany : CD-ROM. 5 p.

Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo. 2010. Use of bivariate EBV-DGV model to combine genomic and conventional breeding value evaluations. In: Proceedings of the 9th world congress on genetics applied to livestock production : August 1-6, 2010 Leipzig, Germany. [4 p.].

Negussie, Enyew; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo; Pösö, J.; Nielsen, U. S.; Johansson, K.; Eriksson, J.-Å.; Aamand, G. P. 2010. Combining test day SCS with clinical mastitis and udder type traits : a random regression model for joint genetic evaluation of udder health in Denmark, Finland and Sweden. In: 37th ICAR session and Interbull open meeting: 31st May - 4th June, 2010, Riga, Latvia. Interbull Centre. 8 p.

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2010. A recipe for multiple trait deregression. In: 2010 Interbull meeting : Riga, Latvia, May 31 to June 4, 2010. Interbull Cente. 4 p.

Tyrisevä, Anna-Maria; Meyer, K.; Fikse, F.; Ducrocq, V.; Jakobsen, J.; Lidauer, Martin H.; Mäntysaari, Esa A. 2010. Recommendations for estimation of variance components for international sire evaluation. In: 37th ICAR session and Interbull open meeting : 31st May - 4th June, 2010, Riga, Latvia. Interbull Centre. 7 p.

Tyrisevä, Anna-Maria; Meyer, K.; Fikse, W. F.; Ducrocq, V.; Jakobsen, J.; Lidauer, Martin H.; Mäntysaari, Esa A. 2010. Principal component and factor analytic models in international sire evaluation. In: Proceedings of the 9th world congress on genetics applied to livestock production : August 1-6, 2010 Leipzig, Germany. [4 p.].

Banos, G.; Calus, M.; Ducrocq, V.; Dürr, J.; Jorjani, H.; Liu, Z.; Mäntysaari, Esa; Sullivan, P.; VanRaden, P. 2009. Preliminary report from interbull task force on the role of genomic information in genetic evaluations. In: Proceedings of the interbull international workshop - genomic information in genetic evaluations, Uppsala, Sweden, January 26-29, 2009. Interbull Bulletin 39: 61-65.

Kempe, Riitta; Strandén, Ismo; Rekilä, Teppo; Koskinen, Nita; Mäntysaari, Esa. 2008. Siniketun rehuhyötysuhteen perinnölliset tunnusluvut. In: Maataloustieteen Päivät 2008, 10.-11.1.2008 [:esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 23: 7 p.

Kempe, Riitta; Strandén, Ismo; Rekilä, Teppo; Koskinen, Nita; Mäntysaari, Esa. 2008. Siniketun rehuhyötysuhteen perinnölliset tunnusluvut. In: Maataloustieteen Päivät 2008, 10.-11.1.2008, Viikki, Helsinki : esitelmäja posteritiivistelmät / Toim. Leena Rantamäki-Lahtinen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 24: p. 127.

Madsen, P.; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa A. 2008. Strategy for estimation of variance components for the joint Nordic yield evaluation. In: Proceedings of the Interbull meeting, Niagara Falls USA, June 16-19, 2008. Interbull Bulletin 38: 36-39.

Mäntysaari, Päivi; Huhtanen, Pekka; Nousiainen, Juha; Mäntysaari, Esa. 2008. Kuntoluokan ja elopainon muutoksen sekä maidon rasva-valkuaissuhteen yhteys laskennalliseen energiataseeseen. In: Maataloustieteen Päivät 2008, 10.-11.1.2008 [: esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 23: 6 p.

Mäntysaari, Päivi; Huhtanen, Pekka; Nousiainen, Juha; Mäntysaari, Esa. 2008. Kuntoluokan ja elopainon muutoksen sekä maidon rasva-valkuaissuhteen yhteys laskennalliseen energiataseeseen. In: Maataloustieteen Päivät 2008, 10.-11.1.2008, Viikki, Helsinki : esitelmäja posteritiivistelmät / Toim. Leena Rantamäki-Lahtinen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 24: p. 174.

Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2008. Genetic association between test-day milk fat to protein ratio and fertility traits in dairy cows: A random regression model analysis. In: Maataloustieteen Päivät 2008, 10.-11.1.2008, Viikki, Helsinki : esitelmäja posteritiivistelmät / Toim. Leena Rantamäki-Lahtinen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 24: p. 125.

Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2008. Genetic association between test-day milk fat to protein ratio and fertility traits in dairy cows: A random regression model analysis. In: Maataloustieteen Päivät 2008, 10.-11.1.2008 [: esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 23: 7 p.

Negussie, Enyew; Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2008. New test-day model for the genetic evaluation of mastitis in dairy cattle. In: Maataloustieteen Päivät 2008, 10.-11.1.2008 [: esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 23: 6 p.

Negussie, Enyew; Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2008. New test-day model for the genetic evaluation of mastitis in dairy cattle. In: Maataloustieteen Päivät 2008, 10.-11.1.2008, Viikki, Helsinki : esitelmäja posteritiivistelmät / Toim. Leena Rantamäki-Lahtinen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 24: p. 175.

Tyrisevä, Anna-Maria; Lidauer, Martin H.; Ducrocq, V.; Back, Pia; Fikse, F.; Mäntysaari, Esa A. 2008. Principal component approach in describing the across country genetic correlations. In: Proceedings of the Interbull meeting Niagara Falls, USA June 16-19, 2008. Interbull Bulletin 38: 142-145.

Lidauer, Martin; Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2007. Experiences with Interbull test IV : estimation of genetic variance. In: Proceedings of the Interbull meeting, August 23-26, 2007, Dublin, Ireland. Bulletin : International Bull Evaluation Service 37: 69-72.

Negussie, Enyew; Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2007. Test day model for the genetic analysis of udder health traits : somatic cell score and clinical mastitis. In: Proceedings of the Interbull meeting Dublin, Ireland August 23-26, 2007. International Bull Evaluation Service, Bulletin 37: 198-202.

Kause, Antti; Tobin, Declan; Dobly, Alexandre; Houlihan, Dominic; Martin, Solan; Mäntysaari, Esa A.; Ritola, Ossi; Ruohonen, Kari. 2006. Recording long-term feed intake using the x-ray method in rainbow trout. In: Proceedings of the 8th World Congress on Gentics Applied to Livestock Production, August 13-18, 2006, Belo Horizonte, MG, Brasil. 4 p.

Kause, Antti; Tobin, Declan; Houlihan, Dominic; Martin, Sam; Mäntysaari, Esa A.; Ritola, Ossi; Ruohonen, Kari. 2006. Viljellyn kirjolohen rehutehoa voi parantaa valintajalostuksella. In: Maataloustieteen Päivät 2006, 11.-12.1.2006 Viikki, Helsinki [esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 21: 5 p.

Kause, Antti; Tobin, Declan; Houlihan, Dominic; Martin, Sam; Mäntysaari, Esa A; Ritola, Ossi; Ruohonen, Kari. 2006. Viljellyn kirjolohen rehutehoa voi parantaa valintajalostuksella. In: Maataloustieteen Päivät 2006 11.-12.1.2006 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posterilyhennelmät / Toim. Leena Rantamäki-Lahtinen ja Kirsi Partanen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 22: p. 82.

Koivula, Minna; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Strandén, Ismo; Vuori, Kaarina; Mäntysaari, Esa. 2006. Genetic (co)variances and breeding value estimation for pigs gompertz growth curve parameters. In: Proceedings of the 8th World Congress on Gentics Applied to Livestock Production, August 13-18, 2006, Belo Horizonte, MG, Brasil. 4 p.

Koivula, Minna; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Strandén, Ismo; Vuori, Kaarina; Mäntysaari, Esa. 2006. Sian kasvukäyrän geneettiset parametrit. In: Maataloustieteen Päivät 2006 11.-12.1.2006, Viikki, Helsinki : Esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Leena Rantamäki-Lahtinen ja Kirsi Partanen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 21: 5 p.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Pösö, Jukka; Pedersen, J.; Nielsen, U; Johansson, Karin; Eriksson, Jan-Åke; Madsen, Peder; Aamand, G. 2006. Random heterosis and recombination loss effects in a multibreed evaluation for nordic red dairy cattle. In: Proceedings of the 8th World Congress on Gentics Applied to Livestock Production, August 13-18, 2006, Belo Horizonte, MG, Brasil. 4 p.

Lidauer, Martin; Pedersen, J; Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Madsen, Peder; Nielsen, U; Eriksson, Jan-Åke; Johansson, Karin; Aamand, G. 2006. Joint nordic test day model : evaluation model. In: Proceedings of the 2006 interbull meeting, Kuopio, Finland, June 4-6, 2006. Bulletin : International Bull Evaluation Service 35: 103-107.

Mäntysaari, Esa. 2006. Meta-model combines traits with different genetic models and data structures. In: Proceedings of the 8th world congress on gentics applied to livestock production, August 13-18, 2006, Belo Horizonte, MG, Brasil. 7 p.

Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin; Pösö, Jukka; Strandén, Ismo; Madsen, Peder; Pedersen, J; Nielsen, U; Johansson, Karin; Eriksson, Jan-Åke; Aamand, G. 2006. Joint nordic test day model : variance components. In: Proceedings of the 2006 interbull meeting, Kuopio, Finland, June 4-6, 2006. Bulletin : International Bull Evaluation Service 35: 97-102.

Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2006. Genetic analysis of clinical mastitits in different risk periods by linear and thershold models. In: Maataloustieteen Päivät 2006, 11.-12.1.2006 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posterilyhennelmät / Toim. Leena Rantamäki-Lahtinen ja Kirsi Partanen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 22: p. 85.

Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2006. Genetic analysis of clinical mastitits in different risk periods by linear and thershold models. In: Maataloustieteen Päivät 2006, 11.-12.1.2006 Viikki, Helsinki [:esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 21: 7 p.

Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2006. Genetic parameters for clinical mastitis in Finnish ayshire: a longituinal threshold model analyses. In: Proceedings of the 8th World Congress on Gentics Applied to Livestock Production, August 13-18, 2006, Belo Horizonte, MG, Brasil. 4 p.

Nousiainen, Jouni; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2006. The use of monthly herd-test-day solutions of test-day model in dairy herd management web-tool, 'Maitoisa'. In: ICAR 2006, 35th ICAL session and interbull meeting, Kuopio, Finland, 6.-10. June. p. 41-42.

Pösö, Jukka; Pedersen, J.; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Madsen, Peder; Nielsen, U; Eriksson, Jan-Åke; Johansson, Karin; Aamand, G. 2006. Joint nordic test day model : experiences with the new model. In: Proceedings of the 2006 interbull meeting, Kuopio, Finland, June 4-6, 2006. Bulletin : International Bull Evaluation Service 35: 108-111.

Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2006. MiX99 - Effective solver for large and complex linear mixed models. In: 8th world congress on gentics applied to livestock production, August 13-18, 2006, Belo Horizonte, MG, Brasil. 2 p.

Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2006. Solving large scale nonlinear mixed models. In: 8th world congress on genetics applied to livestock production, August 13-18, 2006, Belo Horizonte, MG, Brasil. 4 p.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa A.; Pedersen J.; Strandén, Ismo. 2005. Model validation using individual daughter deviations - statistical power. In: Proceedings of the 2005 Interbull Meeting, Uppsala, Sweden June 2-4, 2005. Bulletin : International Bull Evaluation Service 33: 195-199.

Kause, Antti; Ritola, Ossi; Paananen, Tuija; Wahlroos, Heli; Mäntysaari, Esa. 2004. Geneettinen edistyminen kirjolohen jalostusohjelmassa. In: Maataloustieteen Päivät 2004 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posterilyhennelmät / Toim. Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 20: p. 90.

Kause, Antti; Ritola, Ossi; Paananen, Tuija; Wahlroos, Heli; Mäntysaari, Esa. 2004. Geneettinen edistyminen kirjolohen jalostusohjelmassa. In: Maataloustieteen Päivät 2004, 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki [: esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen ja Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 19: 4 p.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa; Negussie, Enyew. 2004. Utaretulehdusbakteerit tietokantaan ja apuvälineeksi utareterveyden jalostuksessa. In: Maataloustieteen Päivät 2004, 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki [: esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen ja Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 19: 3 p.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa; Negussie, Enyew. 2004. Utaretulehdusbakteerit tietokantaan ja apuvälineiksi utareterveyden jalostuksessa. In: Maataloustieteen Päivät 2004 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posterilyhennelmät / Toim. Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 20: p. 94.

Koivula, Minna; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa. 2004. Soluluvun jalostusarvosteluissa käytetään nyt koelypsymallia. In: Maataloustieteen Päivät 2004 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posterilyhennelmät / Toim. Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 20: p. 46.

Koivula, Minna; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa. 2004. Soluluvun jalostusarvosteluissa käytetään nyt koelypsymallia. In: Maataloustieteen Päivät 2004, 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki [: esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen ja Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 19: 4 p.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2004. Validation of genetic trend estimates from test-day model using individual daughter deviations. In: Proceedings of the 2004 Interbull Meeting Sousse, Tunisia : Maj 29-31, 2004. Bulletin : International Bull Evaluation Service 32: 142-145.

Mäntysaari, Esa. 2004. Multiple-trait across-country evaluations using singular (co) variance matrix and random regression model. In: Proceedings of the 2004 Interbull Meeting Sousse, Tunisia : Maj 29-31, 2004. Bulletin: International Bull Evaluation Service 32: 70-73.

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2004. Multitrait-multiparity model for joint genetic evaluation of Nordic bulls for udder health traits. In: Maataloustieteen Päivät 2004 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posterilyhennelmät / Toim. Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 20: p. 32.

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2004. Multitrait-multiparity model for joint genetic evaluation of Nordic bulls for udder health traits. In: Maataloustieteen Päivät 2004, 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki [: esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen ja Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 19: 4 p.

Pedersen, Jorn; Nielsen, Ulrik S.; Aamand, Gert P.; Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin; Strandén, Ismo; Madsen, Per; Johansson, Kjell; Eriksson, Jan-Åke; Juga, Jarmo. 2004. Joint nordic test day model for milk production traits. In: Proceedings of the 2004 Interbull Meeting Sousse, Tunisia : Maj 29-31, 2004. Bulletin : International Bull Evaluation Service 32: 8-12.

Strandén, Ismo; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2004. Pohjoismainen eläinmalli maito-ominaisuuksien arvostelemiseksi. In: Maataloustieteen Päivät 2004 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posterilyhennelmät / Toim. Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 20: p. 30.

Strandén, Ismo; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2004. Pohjoismainen eläinmalli maito-ominaisuuksien arvostelemiseksi. In: Maataloustieteen Päivät 2004, 12.-13.1.2004 Viikki, Helsinki [: esitelmät ja posterit] / Toim. Anneli Hopponen ja Marketta Rinne. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 19: 4 p.

Koivula, Minna; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa. 2003. Use of somatic cell count and clinical mastitis to improve udder health. In: Proceedings of the NJFŽs 22nd congress ŽNordic Agriculture in Global PerspectiveŽ, July 1-4, 2003, Turku, Finland. MTT Agrifood Research Finland, NJF. [p. 6].

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2003. A joint bivariate sire model for the genetic evaluation of Finnish and Swedish bulls for udder health traits. In: Proceedings of the NJFŽs 22nd congress ŽNordic Agriculture in Global PerspectiveŽ, July 1-4, 2003, Turku, Finland / Oiva Niemeläinen and Mari Topi-Hulmi (eds.). MTT Agrifood Research Finland, NJF. [p. 17].

Strandén, Ismo; Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa. 2003. Joint Nordic evaluation of production traits in Ayrshire cattle. In: Proceedings of the NJFŽs 22nd congress ŽNordic Agriculture in Global PerspectiveŽ, July 1-4, 2003, Turku, Finland / Oiva Niemeläinen and Mari Topi-Hulmi (eds.). MTT Agrifood Research Finland, NJF. [p. 18].

Emmerling, Reiner; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2002. Multiple lactation random regression test-day model for Simmental and Brown Swiss in Germany and Austria. In: Proceedings of The 2002 Interbull Meeting : Interlaaken, Switzerland May 26-27, 2002. Bulletin : International Bull Evaluation Service 29: p. 111-117.

Emmerling, Reiner; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2002. Reduced rank covariance functions for multi-lactation test-day model. In: Proceedings of the 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Montpellier, August 19-23, 2002. Organising committee: 7th World Congrees on Genetics Applied to Livestock Production. p. 223-226.

Kause, Antti; Ritola, O.; Paananen, T.; Eskelinen, U.; Mäntysaari, Esa. 2002. Quantitative genetic parameters for appearance of rainbow trout. In: Proceedings of the 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Montpellier, August 19-23, 2002. Organising committee: 7th World Congrees on Genetics Applied to Livestock Production. p. 473-476.

Koivula, Minna; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa. 2002. Genetic parameters for test-day somatic cell count at different stages of lactation in finnish ayrshire cattle. In: Proceedings of the 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Montpellier, August 19-23, 2002. Organising committee: 7th World Congrees on Genetics Applied to Livestock Production. p. 87-90.

Korpiaho, Päivi; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2002. Mating strategies in a small nucleus scheme. In: Proceedings of the 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Montpellier, August 19-23, 2002. Organising committee: 7th World Congrees on Genetics Applied to Livestock Production. p. 187-190.

Lidauer, Martin; Emmerling, Reiner; Mäntysaari, Esa. 2002. Accounting for heterogeneous variance in a test-day model for joint genetic evaluation of austrian and german simmental cattle. In: Proceedings of the 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Montpellier, August 19-23, 2002. Organising committee: 7th World Congrees on Genetics Applied to Livestock Production. p. 529-532.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2002. Karjojensisäisen vaihtelun huomioonottaminen koelypsymallissa. In: Maataloustieteen Päivät 2002 : Kotieläintiede, 9.-10.1.2002 Viikki, Helsinki / toim. Marketta Rinne. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 977: 55-57.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa; Emmerling, Reiner; Strandén, Ismo. 2002. Effect of heterogeneous variance adjustment in an across country evaluation of Brown Swiss. In: Proceedings of the 2002 Interbull Meeting, Interlaaken, Switzerland May 26-27, 2002. Bulletin : International Bull Evaluation Service 29: p. 84-87.

Mäntysaari, Esa. 2002. Combining test day and full lactation records in prediction of breeding values. In: Proceedings of the 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Montpellier, August 19-23, 2002. Organising committee: 7th World Congrees on Genetics Applied to Livestock Production. p. 35-50.

Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa. 2002. 'Unified trait approach' in combining individual test day and lactation records of ayrshire cows form Nordic countries. In: Proceedings of the 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Montpellier, August 19-23, 2002. Organising committee: 7th World Congrees on Genetics Applied to Livestock Production. p. 99-106.

Serenius, Timo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa. 2002. Hedelmällisyysominaisuuksien perinnölliset tunnusluvut Suomen sikapopulaatioissa. In: Maataloustieteen Päivät 2002 : Kotieläintiede, 9.-10.1.2002 Viikki, Helsinki / toim. Marketta Rinne. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 977: 44-47.

Serenius, Timo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa. 2002. Modeling crossbred information in genetic evaluation of litter size in finnish pig populations. In: Proceedings of the 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Montpellier, August 19-23, 2002. Organising committee: 7th World Congrees on Genetics Applied to Livestock Production. p. 83-86.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2001. A multiplicative random regression model for test-day data with heterogeneous variance. In: Bulletin : Proceedings of The 2001 Interbull Meeting Budapest, Hungary, August 30-31, 2001. Bulletin : International Bull Evaluation Service 27: 167-171.

Kettunen, Anne; Martinez, Victor; Mäntysaari, Esa; Mäki-Tanila, Asko. 2000. Kirjolohen valintaohjelman resurssointi. In: Maataloustieteen päivät 2000 : kotieläintiede / toim. Marketta Rinne. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 952: p. 32-34.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2000. Lehmien arvostelu koelypsymallin avulla. In: Maataloustieteen päivät 2000 : kotieläntiede / toim. Marketta Rinne. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 952: p. 219-222.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Pösö, Jukka. 2000. Multiple-trait random regression test-day model for all lactations. In: Proceedings of the 2000 Interbull Meeting : Bled, Slovenia, May 14-15, 2000. Bulletin : International Bull Evaluation Service 25: 81-84.

Parkkonen, Päivi; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2000. Perinnöllinen edistyminen ydinkarjaohjelmassa - simulaatiotutkimus. In: Maataloustieteen päivät 2000 : kotieläintiede / toim. Marketta Rinne. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 952: p. 215-218.

Parkkonen, Päivi; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2000. Simulation results on MOET schemes. In: Future breeding schemes for Nordic Red Dairy Cattle breeds : seminar. p. 1-6.

Kettunen, Anne; Siitonen, Liisa; Mäntysaari, Esa. 1999. Genetic parameters for live weight of rainbow trout in Finnish breeding population. In: Towards predictable quality : Abstracts of contributions presented at the International Conference Aquaculture Europe 99 : Trondheim, Norway, August 7-10,1999. European Aquaculture Society : Special Publication No. 27: p. 114-115.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 1999. Multiple trait reduced rank random regression test-day model for production traits. Bulletin : International Bull Evaluation Service 22: 74-80.

Kettunen, Anne; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin; Pösö, Jukka; Strandén, Ismo. 1998. Lehmien lypsykäyrän muodon jalostusarvostelu. In: Kotieläintieteen päivät 1998. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 924: p. 43-47.

Kettunen, Anne; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Pösö, Jukka; Lidauer, Martin. 1998. Estimation of genetic parameters for first lactation test day milk production using random regression models. In: Proceedings of the 6th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Volume 23 : Armidale, NSW, Australia January 11-16, 1998 : Opening; Plenary; Technology Transfer; Beef Cattle; Dairy Cattle; Pigs. p. 307-310.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Kettunen, Anne; Pösö, Jukka. 1998. DMUIOD: a multitrait blup program suitable for random regression test day models. In: Proceedings of the 6th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Volume 27 : Armidale, NSW, Australia January 11-16, 1998 : Reproduction; Fish breeding Genetics and the Environment; Genetics in Aricultural Systems; Disease Resistance; Animal Welfare; Computing and Information technology; Tree Breeding. p. 463-464.

Mäntysaari, Esa. 1998. Karjantarkkailun koelypsykohtaisten mittausten käyttö eläinten jalostusarvostelussa. In: Kotieläintieteen päivät 1998. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 924: p. 29-34.

Mäntysaari, Esa. 1998. Keinosiemennysjalostuksen ja alkionsiirtoydinkarjan järkiavioliitto. In: Hedelmällisyys - karjankasvattajan murhe ja mahdollisuus : Nautaseminaari 21.3.1998 : Karjatila 98, Pirkkahalli, Tampere. p. 15-19.

Mäntysaari, Esa. 1998. Kestävät tavoitteet lypsykarjan jalostuksessa. In: Sata vuotta maataloustutkimusta - mihin tutkimus ohjaa tuotantoa? : Maatalouden tutkimus- ja tuotantopäivät : Jokioinen 12.-13.8.1998 : Esitelmät : Hundred years of agricultural research - Where does research lead production? : Symposium on agricultural production and research / Riitta Salo (toim.). Maatalouden tutkimuskeskuksen julkaisuja. Sarja A 38: p. 7-15.

Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin; Strandén, Ismo; Kettunen, Anne. 1998. Empirical bias in the pedigree indices of heifers evaluated using test day models. In: Proceedings of the 6th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : Volume 23 : Opening; Plenary; Technology Transfer; Beef Cattle; Dairy Cattle; Pigs : Armidale, NSW, Australia January 11-16, 1998. p. 339-342.

Kettunen, Anne; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 1997. Analysis of first lactation test day milk yields by random regression model. In: Proceedings of the 1997 Interbull Meeting : Vienna, Austria : August 28-29, 1997. Bulletin 16: 39-41.

Mäntysaari, Esa; Kaustell, Kaisa; Kettunen, Anne; Lidauer, Martin; Pösö, Jukka; Strandén, Ismo. 1997. Karjantarkkailun koelypsykohtaisten mittausten käyttäminen eläinarvosteluissa ja karjan tuotannonohjauksessa. In: Maidon uudet sovellukset MAIUS-seminaari 1997: 23.5.1997. [3 p.].

Mäntysaari, Esa; Pösö, Jukka; Kettunen, Anne; Lidauer, Martin. 1997. Koelypsymallin käyttö lehmäkohtaisen lypsykäyrän ennustamisessa. In: Kotieläintieteen päivät 1997. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 914: 47-50.

Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa. 1997. Lypsykarjan luonteen ja terveysominaisuuksien jalostus. In: Kotieläintieteen päivät 1997. Maaseutukeskusten Liiton julkaisuja 914: 123-125.

Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa A.; Kettunen, Anne. 1997. Estimates of genetic parameters for test day and lactation average SCS of Finnish Ayshire. In: Proceedings International Workshop on Genetic Improvement of Functional Traits in Cattle; Health : Uppsala, Sweden : June, 1997. Bulletin 15: 50-52.

Mäntysaari, Esa. 1996. Incorporation of milk content traits into a breeding program. Stocarstvo 50 2: 107-115.

Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa; Kettunen, Anne. 1996. Estimation of genetic parameters of test day production in Finnish Ayrshire cows. In: Proceedings of the open session of the INTERBULL annual meeting : Veldhoven, the Netherlands June 23-24,1996. Interbull Bulletin 14: 45-48.

Mäntysaari, Esa; Hyppänen, Kaija; Juga, Jarmo; Mäki-Tanila, Asko. 1995. Open nucleus MOET program for altering milk protein content. In: Milk in nutrition : effects of production and processing factors : proceedings of NJF/NMR-seminar no. 252, Turku, Finland 13.15.1.1995, NJF-report 102 / Edited by Säde Mantere-Alhonen and Kalle Maijala. Scandinavian Association of Agricultural Scientists (NJF). p. 39-45.

Hyppänen, Kaija; Juga, Jarmo; Mäntysaari, Esa. 1994. Realized selection response in decentralized MOET breeding program to increase protein to fat ratio. In: Volume 19 Selection and quantitative genetics; growth; reproduction; lactation; fish; fiber; meat : Proceedings of the 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : August 7-12, 1994 University of Guelph, Guelph, Ontario, Canada. Organizing Committee; 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. p. 9-12.

Mäntysaari, Esa; Haltia, Soili; Aakula, Kari. 1994. Multitrait animal model evaluation for station tested pigs. In: Volume 17 Genetics and breeding of dairy and beef cattle, swine and horses : Proceedings of the 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : August 7-12, 1994 University of Guelph, Guelph, Ontario, Canada. Organizing Committee; 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. p. 406-408.

Velmala, Riikka; Elo, Kari; Vilkki, Johanna; Mäntysaari, Esa; Mäki-Tanila, Asko. 1994. Casein haplotypes in Finnish Ayrshire and their association with milk production traits. In: Volume 21 Gene mapping; polymorphisms; disease genetic markers; marker assisted selection; gene expression; transgenes; non-conventional animal products; conservation genetics; conservation of domestic animal genetic resources : Proceedings of the 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production : August 7-12, 1994 University of Guelph, Guelph, Ontario, Canada. Organizing Committee, 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. p. 348-350.

D1 Article in a trade journal

Kudinov, Andrei; Mäntysaari, Esa. 2021. Suomenkarja saa pian genomisen jalostusarvostelun. Nauta 3/2021: 6-9.

Mäntysaari, Esa; Koivula, Minna. 2015. Kilpaa kohti genomista eläinmallia. Nauta 45 1: 8-10.

Knürr, Timo; Mäntysaari, Esa. 2014. Genominen data tuo hyviä ja huonoja uutisia. Nauta 44 5: 12-13.

Negussie, Enyew; Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Päivi; Bayat, Alireza. 2014. Voiko metaanipäästöjä vähentää? Nauta 44 1: 26-27.

Negussie, Enyew; Shingfield, Kevin; Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Päivi; Bayat, Alireza; Tapio, Ilma; Kahala, Minna; Blasco, Lucia; Vilkki, Johanna; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2012. Lehmien metaanituotannossa on suuria eroja. Maaseudun Tiede 69 4(22.10.2012): 17.

Mäntysaari, Esa. 2010. Genomitestaus tutuksi : jalostusarvoja lastuista. Nauta 40 5/2010: 18-19.

Mäntysaari, Esa. 2010. Yhteistyöllä paremmat genomiset indeksit. Nauta 40 4/2010: 24-25.

Juga, Jarmo; Mäntysaari, Esa. 2009. Sonninemät nuortuvat. Nauta 39 3/2009: 16-17.

Kempe, Riitta; Strandén, Ismo; Koivula, Minna; Rekilä, Teppo; Koskinen, Nita; Mäntysaari, Esa. 2009. Rehusyöpöt siniketut kuriin jalostuksella. Maaseudun Tiede 66 2(1.6.2009): 11.

Mäntysaari, Esa; Juga, Jarmo. 2009. Sukupolviväli lyhyemmäksi : genominen arvostelu johtaa uudenlaiseen jalostusohjelmaan. Nauta 39 2/2009: 15-17.

Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2009. DNA-genotyyppi mukaan jalostusarvosteluihin - luotettavampia indeksejä. Nauta 1: 24-25.

Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2009. Genomiikka saapuu navettaan. Nauta 39 1: 26-27.

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2009. Genominen arvostelu mullistaa lypsykarjan jalostuksen. Maaseudun Tiede 66 1(9.3.2009): 16.

Mäntysaari, Esa. 2008. Lehmän ekologinen sorkanjälki puhuttaa. Rehumakasiini 4: 18-19.

Mäntysaari, Esa. 2008. Suomalainen sianjalostus palvelee sikataloutta. Sika 3: 23-24.

Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2008. Pitoisuuksien suhde ilmentää energiavajetta. Nauta 5/08: 10-11.

Aro, Johanna; Mäntysaari, Esa; Peippo, Jaana. 2007. ASMO-ydinkarja - jalostuksen huipulla 10 vuotta. Maaseudun Tiede 64 1(18.6.2007): 3.

Kiuru, Tapio; Kause, Antti; Mäntysaari, Esa; Ritola, Ossi; Paananen, Tuija; Ruohonen, Kari. 2006. Produktionseffektivitet och miljövanlighet genom urvalsförädling. Altaan reunalla: 29.

Kiuru, Tapio; Kause, Antti; Mäntysaari, Esa; Ritola, Ossi; Paananen, Tuija; Ruohonen, Kari. 2006. Valintajalostuksella tuotantotehoa ja ympäristöystävällisyyttä. Altaan reunalla: 27-28.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2006. MAITOISAn uudet kasvot. Nauta 1/06: 26-27.

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2006. Noggrannare juverhälsoindex. Nauta 1/06: 78-79.

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2006. Tarkempi utareterveysindeksi. Nauta 1/06: 24-25.

Mäntysaari, Esa. 2005. Framtidens ko? Nauta 5/05: 81.

Mäntysaari, Esa. 2005. Tulevaisuuden Lehmä? Nauta 5/05: 30-32.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2004. Maitoisa tunnistaa ongelmakohdat. Maito ja me 6: 23.

Mäntysaari, Esa. 2004. Fertilitet och hälsa förutspår hållbarhet. Nauta 34 3/2003: 122-123.

Mäntysaari, Esa. 2004. Hyvä hedelmällisyys ja terveys ennustavat kestävyyttä. Nauta 34 3/2004: 13-15.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2003. Förädling av juverhälsa. Nauta 33 3/2003: 112-113.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2003. Lypsylehmien terveys- ja kestävyysominaisuuksien jalostusarvostelun tavoitteet. Nauta 33 3/2003: 42-43.

Mäntysaari, Esa; Toivonen, Minna. 2003. Jalostus pureutuu käyttöiän pidentämiseen. Nauta 33 4/2003: 37.

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2003. Solulukujen jalostusarvostelu nyt koelypsymallilla. Nauta 33 5/2003: 37-39.

Vahlsten, Terhi; Mäntysaari, Esa. 2003. Sukulaisuus ja sukusiitos -Ayrshiresonnien sukulaisuutta on syytä tarkkailla. Nauta 33 3/2003: 36-38.

Vahlsten, Terhi; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2003. Ayrshiresonnien sukulaisuusaste on noussut. Koetoiminta ja käytäntö 60 3(20.10.2003): 6.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2002. Utaretulehdustutkimuksen tavoitteena terveet lehmät. Maito ja me 3: 46.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa; Kulkas, Laura. 2002. Tutkimusyhteistyöhön naudan utaretulehdustutkimuksessa. Suomen Eläinlääkärilehti 108 3: 153-155.

Mäntysaari, Esa. 2001. Ayrshirellä sukusiitosaste vielä alhainen. Nauta 31 5/2001: 80-82.

Mäntysaari, Esa; Korpiaho, Päivi. 2001. Ydinkarjajalostusohjelma toteutettiin tietokoneella. Nauta 31 3/2001: 26-29.

Mäntysaari, Esa. 2000. Koelypsymallissa käytäntö ja teoria kohtaavat. Nauta 30 4/2000: 46-49.

Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2000. Jalostusarvostelut nyt koelypsymallilla. Nauta 3/2000: 4-6.

Parkkonen, Päivi; Mäntysaari, Esa. 1999. Alkioteknologia jalostuksen vauhdittajana : Faster genetic improvement using embryo technology. Suomen eläinlääkärilehti 105 9/1999: 441-445.

Mäntysaari, Esa. 1998. Ekologia, etiikka ja ekonomia lypsykarjan jalostuksessa. Nauta 4/98: 25-26.

Mäntysaari, Esa. 1998. Rehtiä jalostusta alkionsiirrolla. Koetoiminta ja käytäntö 55 1: p. 4.

Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 1997. Suomalainen friisiläinen amerikkalaistuu nopeasti. Nauta 27 5/97: 18-20.

Juga, Jarmo; Mäntysaari, Esa. 1996. Alkioista tehdään ydinkarja. In: Iso Kalenteri 1997. Pellervo: p. 110.

Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa. 1996. Terveyden ja tuotantokyvyn samanaikainen jalostaminen on mahdollista. Nauta 26 1: 10-12.

Mäntysaari, Esa. 1995. Asmo loppui - Alkionsiirtojalostus jatkuu. Nauta 25 2: 18-20.

Mäntysaari, Esa. 1995. Jalostusarvo päivittäiselle tuotokselle? Nauta 25 3: 10-11.

Juga, Jarmo; Mäntysaari, Esa. 1994. Eurooppalaiset pohtivat mitä lypsykarjan ominaisuuksia jalostetaan. Nautakarja 24 2: 8-9.

Mäntysaari, Esa. 1994. Neljä vuotta alkionsiirtojalostusta. Nautakarja 24 2: 22-23.

Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa. 1994. Sonnien terveysarvostelu on nyt BLUP. Nautakarja 24 4: 22-23.

Haltia, Soili; Mäntysaari, Esa. 1993. Eläinmalli on tulossa kantakoeindeksien laskentaan. Sika 23 4: 4-6.

Mäntysaari, Esa. 1993. Utareterveyden jalostus parantaa vastustuskykyä. Nautakarja 23 1: 17-19.

Mäntysaari, Esa; Sillanpää, Mikko. 1993. Muutoksia eläinmalliarvosteluihin. Nautakarja 23 5: 39-41.

Mäntysaari Esa. 1992. BLUP-arvostelu hedelmällisyysvalintaan. Sika 22 2: 52-54.

Mäntysaari, Esa. 1992. Sikojen kasvun ja selkäsilavan paksuuden jalostusarvostelu. Koetoiminta ja käytäntö 49 25.2.1992: p. 4.

Nylander, Anne; Mäntysaari, Esa. 1992. Sikojen hedelmällisyysarvostelu. Koetoiminta ja käytäntö 49 25.2.1992: p. 3.

Mäntysaari, Esa. 1991. Porsastuotannon jalostusarvostelu. Sika 21 2: 4-5.

Mäntysaari, Esa. 1991. Uudet sonnien hedelmällisyys-ja solulukuarvostelut. Nautakarja 21 3: 11-13.

Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 1991. Lypsykarjan jalostusarvostelu eläinmallilla. Koetoiminta ja käytäntö 48 19.2.1991: p. 9,10.

Mäntysaari, Esa; Uimari, Pekka. 1991. Biotekniikalla maitovalkuaista. Koetoiminta ja käytäntö 48 19.2.1991: p. 8.

Nylander, Anne; Mäntysaari,Esa. 1991. Valtakunnalliset arvostelut eläinmallilla. Sika 21 2: 8-10.

Mäntysaari, Esa. 1990. Jalostus johtaa sukusiitokseen. Nautakarja 4: 6-7.

Mäntysaari, Esa. 1990. Perinnöllinen edistyminen lypsykarjalla. Nautakarja 20 5: 16-17.

Mäntysaari, Esa; Juga, Jarmo. 1990. Valkuaisjalostus vauhdittuu alkionsiirroilla. Maito ja Me 2 6: 6-7.

Mäntysaari, Esa; Mäntysaari, Päivi. 1990. Tavoitteena valkuaistuotos. Maito ja Me 2 7: 14-15.

Mäntysaari, Esa. 1989. Alkionsiirto maidon valkuaispitoisuuden kohottamisessa : Alkuvalinta. Koetoiminta ja käytäntö 46 28.11.1989: p. 71.

Mäntysaari, Esa. 1988. Lypsykarjan hedelmällisyysominaisuuksien jalostaminen. Koetoiminta ja käytäntö 45 29.11.1988: p. 62.

D2 Article in professional manuals or guides or professional information systems or text book material

Järvinen, Mikko; Keto, Liisa; Mäntysaari, Esa; Niemi, Jarkko; Rinne, Marketta; Tupasela, Tuomo; Viitala, Sirja; Virkajärvi, Perttu; Pastell, Matti. 2021. 3. Kotieläintuotanto. In: Innovatiivinen ruokajärjestelmä : Tutkimusohjelman loppuraportti. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 25/2021: 12-19.

Juga, Jarmo; Kokkonen, Tuomo; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2019. Tuottavalla eläinaineksella kannattava ja ilmastoviisas kotieläintuotanto. In: Ilmastoviisas maatilayritys. Tieto tuottamaan 145: 59-61.

Mäntysaari, Esa. 1999. Jalostusarvojen ennustaminen. In: Kotieläinjalostus / Jarmo Juga et al. Suomen Kotieläinjalostusosuuskunta. p. 164-208.

Mäntysaari, Esa. 1999. Matriisilaskennan perusteita. In: Kotieläinjalostus / Jarmo Juga et al. Suomen Kotieläinjalostusosuuskunta. p. 267-274.

D3 Professional conference proceedings

Kempe, Riitta; Mehtiö, Terhi; Leino, Anna-Maria; Koivula, Minna; Pitkänen, Timo; Stephansen, Rasmus; Mäntysaari, Esa; Negussie, Enyew; Pösö, Jukka; Nielsen, Ulrik; Fikse, Freddy; Aamand, Gert; Lidauer, Martin. 2022. Single-step genomic prediction for metabolic body weight of Nordic Red dairy cattle. In: WCGALP 2022 Programme book. WCGALP. 4 p.

Pitkänen, Timo J.; Hongding, Gao; Kudinov, Andrei; Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa A.; Liduer, Martin H.; Strandén, Ismo. 2022. From data to genomic breeding values with the MiX99 software suite. In: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. WCGALP.

Strandén, I.; ten Napel, J.; Veerkamp, R.F.; Evans, R.; Naderi, S.; Mäntysaari, E.A.; Vandenplas, J. 2022. Indirect genomic prediction reduces computational costs in large-scale single-step evaluations.4 p. Wageningen University & Research

Pitkänen, Timo; Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa; Leino, Maria. 2021. Towards genomics in Finnish beef cattle. Interbull Bulletin 56: 188-191.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2019. Improved ssGTBLUP for single-step genomic evaluations. In: Book of Abstracts of the 70th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science / Scientific Committee (ed.). EAAP Book of Abstracts 25: p. 127.

Matilainen, Kaarina; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa A. 2019. Modelling fertility trait as censored observations in Finnish Ayrshire data. In: Book of Abstracts of the 70th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science / Scientific Committee (ed.). EAAP Book of Abstracts 25: p. 450.

D4 Published development or research report or study

Leino, Anna-Maria; Pitkänen, Timo Juhani; Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa; Hietala, Sanna. 2023. Beefgeno 2019-2022. Naudanlihantuotannon omavaraisuuden ja tehokkuuden parantaminen genomivalinnalla. Loppuraportti.35 s. Luonnonvarakeskus (Luke)

Mehtiö, Terhi; Luostarinen, Sari; Leskinen, Heidi; Rinne, Marketta; Huuskonen, Arto; Järvenranta, Kirsi; Virkajärvi, Perttu; Huhtanen, Pekka; Perttilä, Sini; Keto, Liisa; Setälä, Jari; Vielma, Jouni; Niemi, Jarkko; Mäntysaari, Esa; Kause, Antti; Leino, Anna-Maria; Pastell, Matti; Tapio, Miika; Mononen, Jaakko; Sévon-Aimonen, Marja-Liisa; Saastamoinen, Markku; Schulman, Nina; Raussi, Satu; Kuha, Rauno; Vehviläinen, Harri; Karikallio, Hanna-Maija; Kaukovirta, Anu; Vilkki, Johanna. 2023. Luken visio suomalaisesta eläintuotannosta ja sen tutkimuksesta vuoteen 2040. Luonnonvara- ja biotalouden tutkimus 8/2023: 52 s.

Lidauer, Martin; Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa; Pitkänen, Timo; Taskinen, Matti; Strandén, Ismo. 2019. MiX99 : Technical reference guide for MiX99 pre-processor. Release XI/2019.91 p. Natural Resources Institute Finland (Luke)

Lidauer, Martin; Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa; Pitkänen, Timo; Taskinen, Matti; Strandén, Ismo. 2019. MiX99 : Technical reference guide for MiX99 solver. Release XI/2019.92 p. Natural Resources Institute Finland (Luke)

Lidauer, Martin; Rinne, Marketta; Mäntysaari, Päivi; Negussie, Enyew; Mehtiö, Terhi; Ahvenjärvi, Seppo; Kajava, Sari; Palmio, Annu; Sairanen, Auvo; Liinamo, Anna-Elisa; Pitkänen, Timo; Muuttoranta, Kirsi; Shingfield, Kevin; Mäntysaari, Esa; Talvisilta, Mari; Lidauer, Paula; Kemppainen, Anne-Maria; Tuomola, Jani; Huittinen, Maiju; Miettinen, Tuuli; Stefanska, Janina; Saarela, Liisa; Riekko, Aino; Pajunen, Elisa; Jalava, Taina; Aalto, Minna; Virta, Anneli; Hakala, Tuija; Virta, Tarja; Wesin, Pia; Widen, Juha; Luukkonen, Tytti; Ruohonen, Ville; Viljanen, Tuula; Ala-Kleme, Teemu; Harju, Heli; Karesma, Outi; Muotila, Anne; Kirvelä, Aune; Juga, Jarmo; Kokkonen, Tuomo; Sipiläinen, Timo; Kokko (os. Hietala), Pauliina; Akkanen, Päivi; Nyholm, Laura; Nousiainen, Juha. 2018. Towards genetic improvement of feed efficiency in dairy cattle.82 p. Finnish feed efficiency project

Lidauer, Martin; Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa; Pitkänen, Timo; Taskinen, Matti; Strandén, Ismo. 2017. MiX99 : Technical reference guide for MiX99 pre-processor.82 p. Natural Resources Institute Finland, Luke

Lidauer, Martin; Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa; Pitkänen, Timo; Taskinen, Matti; Strandén, Ismo. 2017. MiX99 : Technical reference guide for MiX99 solver.76 p. Natural Resources Institute Finland, Luke

Lidauer, Martin; Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa; Pitkänen, Timo; Taskinen, Matti; Strandén, Ismo. 2015. MiX99 : Technical reference guide for MiX99 pre-processor.75 p. Natural Resources Institute Finland

Lidauer, Martin; Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa; Pitkänen, Timo; Taskinen, Matti; Strandén, Ismo. 2015. MiX99 : Technical reference guide for MiX99 solver.74 p. Natural Resources Institute Finland

Mäntysaari, Esa; Vilkki, Johanna; Koivula, Minna; Knürr, Timo; Strandén, Ismo. 2014. Teräväpiirto genomitiedon hyödyntäminen jalostusarvosteluissa : HD genomiikka.22 p.

Negussie, Enyew; Liinamo, Anna-Elisa; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa; Shingfield, Kevin; Mäntysaari, Päivi; Rinne, Marketta; Stefanski, Tomasz; Bayat, Alireza. 2014. Developing genetic and nutritional tools to mitigate the environmental impact of milk production.[55 p.].

Mäntysaari, Päivi; Liinamo, Anna-Elisa; Negussie, Enyew; Nyholm, Laura; Nousiainen, Juha; Ahvenjärvi, Seppo; Mikkola, Marja; Huhtanen, Pekka; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2010. Lehmien energiatasapainon ja rehunkäyttökyvyn mittaaminen: lehmän rehunkäyttökyky 1.1.2006 - 31.3.2010.35 p.

Lidauer, Martin; Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2007. MiX99 : mixed model equations solver : general BLUP-program for solving large mixed model equations with preconditioned conjugate gradient method.79 p.

Mäntysaari, Esa; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Vuori, Kaarina; Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Siljander-Rasi, Hilkka; Valaja, Jarmo; Niemi, Jarkko; Pietola, Kyösti. 2006. Parempi taloudellinen tulos eläinkohtaiseen kasvumalliin perustuvalla sikojen ruokintastrategialla : derivation of economically optimal geeding strategies and nutritional requirements of slaughter pigs using growth component mocels on individual animal level.20 p.

Kause, Antti; Kettunen, Anne; Mäntysaari, Esa; Paananen, Tuija; Eskelinen, Unto; Ritola, Ossi. 2001. Kirjolohen tie fileeksi: geneettiset tunnusluvut. Kala- ja riistaraportteja 212: 19 p.

Mäntysaari, Esa. 1984. Valintaindeksi jälkeläisarvosteltujen keinosiemennyssonnien kokonaisjalostusarvon kuvaajana. Kotieläinjalostuksen tiedote 62: 86 p.

E1 Popularised article, newspaper article

Mäntysaari, Esa. 2009. Genominen valinta on pohjoismaisen jalostuksen uusi valtti. Pistoletti 2/09: 12-13.

Kause, Antti; Mäntysaari, Esa. 2006. Suomalainen eläinten jalostus on kansainvälisesti tunnustettua. Helsingin sanomat 28.7.2006: A2.

Juga, Jarmo; Mäntysaari, Esa. 1990. Mindre mjölkfett, mera protein genom Asmo. Embryoöverföringsprojekt påskyndar en förändring av mjölkens sammansättning. LOA : Tidskrift för Lantmän och Andelsfolk 71 10: 372-373.

E3 Edited popular book

Mäki-Tanila, Asko; Syväjärvi, Jouko; Ikonen, Tiina; Aro, Johanna; Juga, Jarmo; Myllymäki, Hannu; Mäntysaari, Esa; Niskanen, Seppo; Strandén, Ismo; Säynäjärvi, Mikko; Taurén, Pirkko; Vilkki, Johanna; Mitikka, Tiina; Niemi, Anne-Mari; Kajostila, Katri. 2023. Kantakirjasta genomiaikaan - Suomalainen lypsykarjanjalostus 125 vuotta.384 s. Faba osk

M1 Texts about research activities

Muuttoranta, K.; Tyrisevä, A.-M.; Mäntysaari, E. A.; Pösö, J.; Aamand, G. P.; Eriksson, J.-Å.; Nielsen, U. S.; Lidauer, M. 2015. Genetic parameters for female fertility in Nordic dairy cattle. In: 2015 Interbull annual meeting in Orlando-Florida. Interbull Centre, Swedish University of Agricultural Sciences.

Mäntysaari, Esa; Koivula, Minna; Knürr, Timo; Strandén, Ismo. 2014. Effect of size of reference group : effect of adding females to the reference population.39 p.

Mäntysaari, Esa; Nilforooshan, Mohammad. 2014. Effect of the size of the reference population on the validation reliability of national genomic evaluations.[42 p.].

Lidauer, Martin; Koivula, Minna; Nousiainen, Juha; Mäntysaari, Esa. 2007. Use of herd solutions from a random regression test-day model for diagnostic dairy herd management. In: Congress on nutrition and management of dairy cattle 2007, Ragusa, Italy, 5.-8. June 2007.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 1995. Suomen friisiläiskarjan geneettinen rakenne ja holstein-rodun vaikutus valkuaistuotokseen, tyhjäkauteen ja somaattiseen solulukuun. In: Agro-Food '95 : tieto turvaa tulevaisuuden : Tampere 13.-15.11.1995, Tampere-talo. Agro-Food ry. p. B26.

Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa; Haltia. 1995. Periytymisasteiden arviointi sikojen täyssisarryhmäaineistosta. In: Agro-Food '95 : tieto turvaa tulevaisuuden : Tampere 13.-15.11.1995, Tampere-talo. Agro-Food ry. p. B25.

Haltia, Soili; Mäntysaari, Esa. 1993. Eläinmalli-BLUP -menetelmän käyttömahdollisuudet sikojen kantakoearvostelussa. In: Agro-Food : suomalaisen elintarviketuotannon kilpailukyky : Tampere 16.-18.11.1993, Tampere-talo. Agro-Food ry. p. B26.

Sillanpää, Mikko; Mäntysaari, Esa. 1993. Eläinmallissa käytetyn karjavuosimääritelmän vaikutus sonnien valkuaistuotosarvostelujen pysyvyyteen. In: Agro-Food : suomalaisen elintarviketuotannon kilpailukyky : Tampere 16.-18.11.1993, Tampere-talo. Agro-Food ry. p. B37.

M2 Presentation or poster

Kokkonen, Tuomo; Mäntysaari, Päivi; Kajava, Sari; Mehtiö, Terhi; Latomäki, Timo; Nyholm, Laura; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2018. Lehmän veren rasvahappopitoisuuden ennustaminen maidon rasvahappopitoisuuksien avulla. In: Maataloustieteen Päivät 2018 10.-11.1.2018 Viikki, Helsinki : Esitelmä- ja posteritiivistelmät / toim. Tuula Puhakainen ja Mikko Hakojärvi. Suomen Maataloustieteellisen Seuran tiedote 34: s. 139.

Lidauer, Martin; Rinne, Marketta; Mäntysaari, Päivi; Negussie, Enyew; Mehtiö, Terhi; Ahvenjärvi, Seppo; Kajava, Sari; Palmio, Annu; Sairanen, Auvo; Mäntysaari, Esa; Juga, Jarmo; Kokkonen, Tuomo; Sipiläinen, Timo; Koko, Pauliina; Akkanen, Päivi; Nyholm, Laura. 2018. Lypsylehmien rehuhyötysuhde paremmaksi eläinjalostuksella – kuinka pitkällä olemme? In: Maataloustieteen Päivät 2018 10.-11.1.2018 Viikki, Helsinki : Esitelmä- ja posteritiivistelmät / toim. Tuula Puhakainen ja Mikko Hakojärvi. Suomen Maataloustieteellisen Seuran tiedote 34: s. 136.

Mehtiö, Terhi; Mäntysaari, Päivi; Kajava, Sari; Kokkonen, Tuomo; Latomäki, Timo; Nyholm, Laura; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2018. Indikaattorin kehittäminen lypsylehmien energiataseen arviointiin. In: Maataloustieteen Päivät 2018 10.-11.1.2018 Viikki, Helsinki : Esitelmä- ja posteritiivistelmät / toim. Tuula Puhakainen ja Mikko Hakojärvi. Suomen Maataloustieteellisen Seuran tiedote 34: s. 137.

Mehtiö, Terhi; Mäntysaari, Päivi; Kokkonen, Tuomo; Kajava, Sari; Prestløkken, Egil; Kidane, Alemayehu; Wallén, Sini; Nyholm, Laura; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin H. 2018. Genetic analyses of cow-specific diet digestibility based on spectral analysis of faecal samples. In: Book of Abstracts of the 69th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science / ed. Scientific Committee. EAAP Book of Abstracts 24: 186.

Mäntysaari, Esa A.; Aamand, Gert P.; Strandén, Ismo; Koivula, Minna. 2018. Solutions for the fixed effects, yield deviations and daughter yield deviations from a data subject to genomic selection.21 p. Luonnonvarakeskus

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, G. P.; Mäntysaari, Esa A. 2017. Validation of genomic and genetic evaluations: Nordic Red Dairy cattle 305 d production traits. In: Book of Abstracts of the 68th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Tallinn, Estonia, 28 August - 1 September 2017 / ed. EAAP scientific committee. EAAP Book of Abstracts 23: 233.

Lidauer, Martin; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa. 2017. Addressing feed effciency traits in the absence of feed intake measurements. In: Book of Abstracts of the 68th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Tallinn, Estonia, 28 August - 1 September 2017. Wageningen Academic Publishers.

Mäntysaari, Esa A.; Evans, Ross; Meuwissen, Theo H. E.; Strandén, Ismo. 2017. Increasing computational efficiency in ssGTBLUP by eigendecomposition. In: Book of Abstracts of the 68th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Tallinn, Estonia, 28 August - 1 September 2017 / ed. EAAP scientific committee. EAAP Book of Abstracts 23: Abstract 228.

Mäntysaari, Päivi; Kokkonen, Tuomo; Grelet, Clement; Mäntysaari, Esa Antero; Lidauer, Martin Henrik. 2017. Body and milk traits as cow’s energy status indicator. In: Book of Abstracts of the 68th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Tallinn, Estonia, 28 August - 1 September 2017. Wageningen Academic Publishers. 512.

Strandén, Ismo; Evans, Ross; Mäntysaari, Esa A. 2017. Efficient single-step computations using equivalent ssGTBLUP approach. In: Book of Abstracts of the 68th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Tallinn, Estonia, 28 August - 1 September 2017 / ed. EAAP scientific committee. EAAP Book of Abstracts 23: Abstract 229.

Coyne, J. M.; Matilainen, Kaarina; Berry, D. P.; Sevon-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa; Juga, J.; Serenius, T.; McHugh, N. 2016. Longitudinal analysis of pig growth using Legendre polynomial equations. In: Book of abstracts of the 67th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Belfast, UK, 29 August - 2 September 2016. Wageningen Academic Publishers. p. 612.

Knürr, Timo; Isolahti, Mika; Manninen, Outi; Strandén, Ismo; Teperi, Esa; Veteläinen, Merja; Mäntysaari, Esa A. 2016. Genomic prediction in a Finnish breeding programme of six-row barley. In: 20th EUCARPIA general congress, 29 Aug - 1 Sep 2016, ETH Zürich, Switzerland : Abstracts / Eds. Roland Kölliker and Beat Boller. Agroscope, Institute for Sustainability Sciences. p. 206.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Aamand, G. P.; Mäntysaari, Esa. 2016. Test-Day single-step genomic evaluation using APY algorithm. In: Book of abstracts of the 67th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Belfast, UK, 29 August - 2 September 2016. Wageningen Academic Publishers. p. 337.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2016. Genomisessa eläinmallissa käytetään sekä genotyypitettyjen että genotyypittämättömien eläinten tietoja. In: Maataloustieteen Päivät 2016, 12.-13.1.2016 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Laura Alakukku, Nina Schulman ja Tuula Puhakainen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 32: p. 136.

Kudinov, A. A.; Juga, J.; Uimari, P.; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Plemyashov, K. V.; Saksa, E. I.; Smaragdov, M. G. 2016. Implementation of BLUP for breeding value estimation in Russian Federation. In: Book of abstracts of the 67th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Belfast, UK, 29 August - 2 September 2016. Wageningen Academic Publishers.

Matilainen, Kaarina; Mäntysaari, Esa; Tyrisevä, Anna-Maria; Strandén, Ismo. 2016. Pohjoismaisten punaisten rotujen hedelmällisyysarvostelu genomisella eläinmallilla. In: Maataloustieteen Päivät 2016, 12.-13.1.2016 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Laura Alakukku, Nina Schulman ja Tuula Puhakainen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 32: p. 138.

Matilainen, Kaarina; Strandén, Ismo; Aamand, Gert P.; Mäntysaari, Esa. 2016. Single-step genomic evaluation for fertility in Nordic Red dairy cattle. In: Book of abstracts of the 67th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Belfast, UK, 29 August - 2 September 2016. Wageningen Academic Publishers. p. 340.

Mehtiö, Terhi; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2016. Lypsylehmien muuntokelpoisen energian saannin mallinnus rehuhyötysuhdeominaisuuksien kehittämistä varten. In: Maataloustieteen Päivät 2016, 12.-13.1.2016 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Laura Alakukku, Nina Schulman ja Tuula Puhakainen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 32: p. 116.

Mehtiö, Terhi; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2016. Partitioning genetic variance of metabolizable energy efficiency in dairy cows. In: Book of abstracts of the 67th annual meeting of the European Association for Animal Production, Belfast, UK, 29 August - 1 September 2016. Wageningen Academic Publishers. p. 453.

Muuttoranta, Kirsi; Tyrisevä, Anna-Maria; Mäntysaari, Esa; Pösö, Jukka; Pedersen Aamand, Gert; Eriksson, Jan-Åke; Sander Nielsen, Ulrik; Lidauer, Martin. 2016. Naarashedelmällisyyden perinnölliset tunnusluvut pohjoismaisilla lypsyroduilla. In: Maataloustieteen Päivät 2016, 12.-13.1.2016 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Laura Alakukku, Nina Schulman ja Tuula Puhakainen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 32: p. 114.

Muuttoranta, K.; Tyrisevä, A.-M.; Mäntysaari, E. A.; Pösö, J.; Aamand, G. P.; Eriksson, J.-Å.; Nielsen, U. S.; Lidauer, M. H. 2016. Genetic parameters for a multiple-trait linear model conception rate evaluation. In: Book of abstracts of the 67th annual meeting of the European Association for Animal Production, Belfast, UK, 29 August - 1 September 2016. Wageningen Academic Publishers. p. 1051.

Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2016. Single-step genomic evaluation with many more genotyped animals. In: Book of abstracts of the 67th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Belfast, UK, 29 August - 2 September 2016. Wageningen Academic Publishers. p. 336.

Mäntysaari, Päivi; Kokkonen, Tuomo; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2016. Elopaino, kuntoluokka ja maidon pitoisuudet lehmän energiataseen kuvaajana. In: Maataloustieteen Päivät 2016, 12.-13.1.2016 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Laura Alakukku, Nina Schulman ja Tuula Puhakainen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 32: p. 120.

Strandén, Ismo; Matilainen, Kaarina; Aamand, G. P.; Mäntysaari, Esa. 2016. Efficient computations for single-step genomic evaluation. In: Book of abstracts of the 67th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Belfast, UK, 29 August - 2 September 2016. Wageningen Academic Publishers. p. 337.

Taskinen, Matti; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2016. Single-step SNP-BLUP with on-the-fly imputed genotypes and residual polygenic effects. In: Book of abstracts of the 67th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Belfast, UK, 29 August - 2 September 2016. Wageningen Academic Publishers. p. 339.

Tyrisevä, Anna-Maria; Muuttoranta, Kirsi; Mäntysaari, Esa; Pösö, Jukka; Pedersen Aamand, Gert; Eriksson, Jan-Åke; Lidauer, Martin. 2016. Lypsykarjan hedelmällisyyden jalostusarvostelu päivitetty eläinmalliksi. In: Maataloustieteen Päivät 2016, 12.-13.1.2016 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Laura Alakukku, Nina Schulman ja Tuula Puhakainen. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 32: p. 115.

Coyne, J. M.; Matilainen, K.; Sevon-Aimonen, M.-L.; Berry, D. P.; Mäntysaari, E. A.; Juga, J.; Serenius, T.; Mchugh, N. 2015. Genetic (co)variance estimation of Gompertz growth curve parameters in Finnish pigs. In: Book of abstracts of the 66th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Warsaw, Poland, 31 August - 4 September, 2015. EAAP Book of Abstracts 21: p. 458.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Pedersen Aamand, Gert; Mäntysaari, Esa A. 2015. Exclusion or inclusion of information of culled bulls on the single-step genomic evaluation. In: Book of abstracts of the 66th annual meeting of the European Association for Animal Production, Warsaw, Poland, 31 August - 4 September 2015. Wageningen Academic Publishers. p. 503.

Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin. 2015. BLUP, REML, and other tools in the age of genomic selection. Journal of Dairy Science 98 Suppl. 2: 197.

Mäntysaari, Päivi; Kokkonen, Tuomo; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa A. 2015. Prediction of daily energy status in early and mid lactation using milk and body traits. Journal of Dairy Science 98 Suppl. 2: 129.

Strandén, I.; Mäntysaari, E. A. 2015. Effect of SNP chip density on model reliability of genomic evaluations. In: Book of abstracts of the 66th annual meeting of the European Association for Animal Production, Warsaw, Poland, 31 August - 4 September 2015. EAAP Book of Abstracts 21: p. 504.

Knürr, Timo; Strandén, Ismo; Koivula, Minna; Aamand, Gert Pedersen; Mäntysaari, Esa A. 2014. Haplotype-assisted genomic evaluations in Nordic Red Dairy Cattle. In: Maataloustieteen Päivät 2014, 8.-9.1.2014 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Risto Kuisma, Nina Schulman, Hanna-Riitta Kymäläinen ja Laura Alakukku. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 31: p. 44.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2014. Genomisten jalostusarvojen laskenta single-step menetelmällä. In: Maataloustieteen Päivät 2014, 8.-9.1.2014 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Risto Kuisma, Nina Schulman, Hanna-Riitta Kymäläinen ja Laura Alakukku. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 31: p. 43.

Lidauer, Martin; Shingfield, Kevin; Rinne, Marketta; Juga, Jarmo; Ahvenjärvi, Seppo; Mäntysaari, Päivi; Sairanen, Auvo; Nyholm, Laura; Hietala, Pauliina; Kokkonen, Tuomo; Negussie, Enyew; Sipiläinen, Timo; Mäntysaari, Esa. 2014. Towards genetic improvement of feed efficiency in dairy cattle. In: Maataloustieteen Päivät 2014, 8.-9.1.2014 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Risto Kuisma, Nina Schulman, Hanna-Riitta Kymäläinen ja Laura Alakukku. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 31: p. 102.

Makgahlela, Mahlako; Strandén, Ismo; Nielsen, U. S.; Sillanpää, M. J.; Mäntysaari, Esa. 2014. Alternative methods of estimating genomic relationships for single-step evaluations. In: Maataloustieteen Päivät 2014, 8.-9.1.2014 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Risto Kuisma, Nina Schulman, Hanna-Riitta Kymäläinen ja Laura Alakukku. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 31: p. 45.

Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa. 2014. Lehmien elopainon ja painonmuutosten mallintaminen päivittäisten punnitusten avulla. In: Maataloustieteen Päivät 2014, 8.-9.1.2014 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Risto Kuisma, Nina Schulman, Hanna-Riitta Kymäläinen ja Laura Alakukku. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 31: p. 264.

Pitkänen, Timo; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2014. Robottilypsyn vaikutukset jalostusarvostelussa käytettäviin malleihin. In: Maataloustieteen Päivät 2014, 8.-9.1.2014 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Risto Kuisma, Nina Schulman, Hanna-Riitta Kymäläinen ja Laura Alakukku. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 31: p. 262.

Knürr, T.; Strandén, I.; Koivula, M.; Aamand, G. P.; Mäntysaari, E. A. 2013. Haplotype-assisted genomic evaluations in Nordic Red dairy cattle. In: Book of abstracts of the 64th annual Meeting of the European federation of animal science, Nantes, France, 26-30 August 2013. EAAP book of abstracts 19: 454.

Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Päivi; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa A. 2013. Genetic parameters for energy efficiency traits in Nordic Red dairy cattle. In: Book of abstracts of the 64th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Nantes, France, 26-30 August 2013. EAAP Book of abstracts 19: 577.

Makgahlela, Mahlako; Strandén, Ismo; Nielsen, U.S.; Sillanpää, M.J.; Mäntysaari, Esa A. 2013. The adjusted genomic relationships by allele frequencies within breeds and use in single-step GBLUP. In: Book of abstracts of the 64th annual meeting of the European Federation of Animal Science, Nantes, France, 26-30 August 2013. EAAP Book of abstracts 19: 237.

Negussie, Enyew; Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin. 2013. Measurement of methane in dairy cows via photoacoustic infrared spectroscopy technique : sources of variation in daily methane output. In: Proceedings of the 5th Greenhouse Gases and Animal Agriculture Conference (GGAA 2013), Dublin, Ireland, 23-26 June 2013. Advances in Animal Biosciences 4 2: 463.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo. 2012. SNP-BLUP, G-BLUP ja H-BLUP : johdanto genomisiin arvosteluihin. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Nina Schulman. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 29: p. 27.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Päivi; Liinamo, Anna-Elisa; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa. 2012. Rehunkäyttökyvyssä on eroja. In: ASMO-päivät 24.10.2012 Jokioinen. [1 p].

Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa. 2012. Lypsylehmien energiatehokkuuden perinnölliset tunnusluvut ja yhteydet maidontuotantoon, kuiva-aineen syöntiin, elopainoon ja kuntoluokkaan. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Nina Schulman. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 29: p. 61.

Makgahlela, Mahlako Linah; Mäntysaari, Esa A.; Strandén, Ismo; Koivula, Minna; Nielsen, U. S.; Sillanpää, M. J.; Juga, J. 2012. Investigation of reliability of genomic predictions in the admixed Nordic Red dairy cattle. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Nina Schulman. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 29: p. 25.

Mäntysaari, Päivi; Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Esa. 2012. Eläinten välinen vaihtelu rehun hyväksikäytössä ayrshire ensikoilla. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Nina Schulman. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 29: p. 64.

Negussie, Enyew; Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin. 2012. Genetic tools to mitigate the environmental impact of milk production systems : experience with a multi-point individual cow methane measurement system. In: Maataloustieteen Päivät 2012, 10.-11.1.2012 Viikki, Helsinki : esitelmä- ja posteritiivistelmät / Toim. Nina Schulman. Suomen maataloustieteellisen seuran tiedote 29: p. 63.

Negussie, Enyew; Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa A.; Lidauer, Martin. 2012. Between and within-individual variation in methane output measurements in dairy cows. In: Book of abstracts of the 63rd annual meeting of the European Federation of Animal Science, Bratislava, Slovakia 27 - 31 August 2012. EAAP book of abstracts 18: p. 170.

Tyrisevä, Anna-Maria; Lidauer, Martin H.; Mäntysaari, Esa A. 2012. Challenges of estimation of international breeding values due to genotype-by-environment interactions in dairy cattle. In: Genotype-by-environment interactions and adaptation of farm animals on phenotypic and molecular levels, 7th-8th of November, 2012, Tuusula, Finland : proceedings of the AnGR-NordicNET Workshop / Eds. Praebel A. and Kristensen T. N. Nordic Genetic Resource Center. p. 36.

Koivula, Minna; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa A. 2011. Comparison of different methods to calculate genomic predictions : results from SNP-BLUP, G-BLUP and one-step H-BLUP. In: Book of abstracts of the 62nd annual meeting of the European Federation of Animal Science, Stavanger, Norway 29 August - 2 September 2011. EAAP book of abstracts 17: 1.

Liinamo, Anna-Elisa; Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa. 2011. Genetic parameters for residual energy intake and its relationships with production and other energy efficiency traits in Nordic Red dairy cattle. In: Book of abstracts of the 62nd annual meeting of the European federation of animal science : Stavanger, Norway 29th August-2nd September 2011. EAAP book of abstracts 17: 87.

Matilainen, Kaarina; Lidauer, Martin; Strandén, Ismo; Thompson, R; Mäntysaari, Esa A. 2009. Comparison of Monte Carlo EM REML and Bayesian estimation by Gibbs sampling in estimation of genetic parameters for a test day model. In: Book of abstracts of the 60th annual meeting of the European association for animal production, Barcelona, Spain, August 24th-27th, 2009. EAAP Book of abstracts 15: p. 599.

Kempe, Riitta; Strandén, Ismo; Rekilä, Teppo; Koskinen, Nita; Mäntysaari, Esa. 2008. Genetiska nyckeltal för blårävens näringupptagningsförmåga. In: Rehunvalmistajien luentopäivät, Tampere 11.-12.2.2008. [1 p.].

Vuori, Kaarina; Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2007. Estimation of breeding values for test day somatic cell score and clinical mastitis using threshold model. In: 58th annual meeting of the EAAP, 26-29 August 2007, Dublin, Ireland / E. Strandberg (toim.), E. Cenkvari (toim.), C. Fourichon (toim.), M. Vestergard (toim.), J. Hermansen (toim.), C. Lazzaroni (toim.), G. Nieuwhof (toim.), C. Wenk (toim.) and W. Martin-Rosset (toim.). p. 67.

Kause, Antti; Tobin, D; Dobly, A; Houlihan, D.F; Mattin, S; Mäntysaari, Esa A; Ritola, Ossi; Ruohonen, K. 2006. Recording long-term feed intake using the x-ray method for selective breeding purposes in rainbow trout. In: International symposium for genetics in aquaculture, June 2006, Montpellier, France. p. 48.

Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 2006. MiX99 - effective solver for large and complex linear mixed models. In: 8th world congress on gentics applied to livestock production, August 13-18, 2006, Belo Horizonte, MG, Brasil. p. 254.

Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2006. Solving large scale nonlinear mixed models. In: 8th World congress on gentics applied to livestock production, August 13-18, 2006, Belo Horizonte, MG, Brasil. p. 239.

Kause, Antti; Mäntysaari, Esa; Tobin, D.; Martin, S.; Houlihan, D.; Ruohonen, K.; Ritola, O. 2005. Breeding for improved feed efficiency in raibow trout : assessing genetic potential on alternative diets. In: Lessons from the past to optimise the future : extended abstracts on short communications : European Aquaculture Society Special publication no. 35. p. 271.

Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2005. Pathogen records as a tool to manage udder health. In: Book of Abstracts of the 56th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Uppsala, Sweden, 5-8 June 2005 / Ynze van der Honing, editor-in-chief. p. 380.

Negussie, Enyew; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2005. Threshold versus linear model estimates of genetic and environmental correlations between udder health and production traits. In: Book of Abstracts of the 56th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Uppsala, Sweden, 5-8 June 2005 / Ynze van der Honing, editor-in-chief. p. 43.

Peura, Jussi; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2005. Genetics of size traits, fur quality traits and litter size in blue fox. In: Book of Abstracts of the 56th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Uppsala, Sweden, 5-8 June 2005 / Ynze van der Honing, editor-in-chief. Wageningen. p. 211.

Toivakka, Minna; Nousiainen, Jouni I.; Mäntysaari, Esa. 2005. Estimation of economic values of longevity and other functional traits in Finnish dairy cattle. In: Book of Abstracts of the 56th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Uppsala, Sweden, 5-8 June 2005 / Ynze van der Honing, editor-in-chief. Wageningen. p. 54.

"Koivula, Minna; Nousiainen, Jouni; Nousiainen, J.; Mäntysaari, Esa. 2004. The use of herd-test-day solutions of the random regression test-day model in dairy herd management web-tool ""Maitoisa"". In: Book of abstracts of the 55th Annual meeting of the European Association for Animal Production / Ynze van der Honing. Annual meeting of the European Association for Animal Production: 296. "

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2004. Across country evaluation for clinical mastitis and somatic cell count by multitrait model. In: Book of abstracts of the 55th Annual meeting of the European Association for Animal Production / Ynze van der Honing. Annual meeting of the European Association for Animal Production: 14.

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2004. Breeding for increased resistance to mastitis in Nordic dairy cattle : bivariate vs univariate model. In: Proceedings of the 38th International congress of the ISAE : Helsinki, Finland 2004 / Laura Hänninen ja Anna Valros (editors). International Society for Applied Ethology. p. 175.

Serenius, Timo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäki-Tanila, Asko; Mäntysaari, Esa. 2004. Possibilities to select for leg soundness in pigs. In: Proceedings of the 38th International congress of the ISAE : Helsinki, Finland 2004 / Laura Hänninen ja Anna Valros (editors). International Society for Applied Ethology. p. 181.

Strandén, Ismo; Lidauer, Martin; Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa. 2004. Joint genetic evaluation of Nordic dairy cattle. In: Abstracts of the XXI Genetic Days : Wroclaw, Poland, 1-3 September 2004. Agricultural University of Wroclaw. [2 p.].

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2004. Comparison of two methods to approximate reliabilities of breeding values from test day model. In: Book of abstracts of the 55th Annual meeting of the European Association for Animal Production / Ynze van der Honing. Annual meeting of the European Association for Animal Production: 90.

Vuori, Kaarina; Strandén, Ismo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa. 2004. Estimation of Compertz growth curve parameters by a nonlinear mixed effects model. In: Book of abstracts of the 55th Annual meeting of the European Association for Animal Production / Ynze van der Honing. Annual meeting of the European Association for Animal Production: 300.

Dobly, Alexandre; Ritola, Ossi; Wahlroos, Heli; Kause, Antti; Mäntysaari, Esa; Ruohonen, Kari; Martin, Samuel A.M.; Houlihan, Dominic F. 2003. Genetic correlates of protein growth efficiency in 210 families of rainbow trout assessed by x-rays. In: International Association for Genetics in Aquaculture : Genetics in aquaculture, VIII, 9-15 November, 2003, Puerto Varas, Chile. p. 117.

Kause, Antti; Wahlroos, Heli; Ritola, Ossi; Paananen, Tuija; Mäntysaari, Esa. 2003. Genetic trends in production and health traits and rate of inbreeding in a long-term breeding programme for rainbow trout. In: International Association for Genetics in Aquaculture : Genetics in aquaculture, VIII, 9-15 November, 2003, Puerto Varas, Chile. p. 92.

Koivula, Minna; Negussie, Enyew; Mäntysaari, Esa. 2003. SCC, clinical mastitis and milk yield in improving udder health. In: Book of abstracts of the 54th Annual meeting of the European Association for Animal Production, Rome, Italy, 31 August - September 2003 / Ynze van der Honing, editor-in-chief. p. 24.

Wahlroos, Heli; Dobly, Alexandre; Kause, Antti; Ritola, Ossi; Mäntysaari, Esa; Ruohonen, Kari; Houlihan, Dominic. 2003. Genetic parameters for growth and food intake in rainbow trout. In: International Association for Genetics in Aquaculture : Genetics in aquaculture, VIII, 9-15 November, 2003, Puerto Varas, Chile. p. 88.

Negussie, Enyew; Koivula, Minna; Mäntysaari, Esa. 2002. Application of test-day models in genetic evaluation of Finnish dairy cattle for Somatic Cell Count. In: Book of Abstracts of the 53rd Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Cairo, Egypt, 1-4 September 2002. Annual meeting of the European Association for Animal Production 8: 25.

Kause, Antti; Ritola, O; Paananen, T; Mäntysaari, Esa; Eskelinen, U. 2001. Genetics of sexual dimorphism in age and size at maturity in rainbow trout. In: Book of Abstracts of the 52nd Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Book of abstracts No. 7 (2001) Budapest, Hungary 26-29 August 2001. Wageningen Pers. p. 67.

Serenius, Timo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa. 2001. The genetics of litter size and farrowing interval. In: Book of Abstracts of the 52nd Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Book of abstracts No. 7 (2001) Budapest, Hungary 26-29 August 2001. Wageningen Pers. p. 42.

Thuneberg-Selonen, Terhi; Mäntysaari, Esa; Ojala, M. 2001. Estimation of genetic parameters for racing performance and racing status. In: Books of Abstracts of the 52nd Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Book of abstracts No. 7 (2001) Budapest, Hungary 26-29 August 2001. Wageningen Pers. p. 349.

Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Lidauer, Martin. 2000. Prediction of breeding values for Finnish dairy cattle using random regression test day model. In: Abstracts : American Dairy Science Association, American Society of Animal Science : July 24-28, 2000, Baltimore, Maryland. Journal of dairy science 83 1: 61.

Parkkonen, Päivi; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 2000. Alternative generation intervals in nucleus breeding scheme for dairy cattle. In: Book of Abstracts of the 51st Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Book of Abstracts No. 6 (2000), The Hague, The Netherlands, 21-24 August 2000. Wageningen Pers. p. 27.

Serenius, Timo; Sevón-Aimonen, Marja-Liisa; Mäntysaari, Esa. 2000. Genetics of leg weakness in the Finnish pig breeding populations. In: Book of Abstracts of the 51st Annual Meeting of the European Associaton for Animal Production : Book of abstracts No. 6 (2000), The Hague, The Netherlands, 21-24 August 2000. Wageningen Pers. p. 80.

Strandén, Ismo; Mälkiä, Katri; Mäntysaari, Esa; Thompson, Robin. 2000. Efficient calculation of accuracy of estimated breeding values by MCMC methods. In: Book of Abstracts of the 51st Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Book of Abstracts No. 6 (2000), The Hague, The Netherlands, 21-24 August 2000. Wageningen Pers. p. 26.

Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa; Lidauer, Martin. 2000. Genetic evaluation of Finnish dairy cattle using random regression test day model. In: Book of Abstracts of the 51st Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Book of abstracts No. 6 (2000), The Hague, The Netherland, 21-24 August 2000. Wageningen Pers. p. 84.

Mäntysaari, Esa. 1999. Derivation of multiple trait reduced rank random regression (RR) model for the first lactation test day records of milk, protein and fat. In: Book of Abstracts of the 50th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Zurich, Switzerland, 22-26 August 1999 / J.A.M. van Arendonk, Editor-in-chief. The EAAP Book of Abstracts 5: p. 26.

Mäntysaari, Esa. 1999. Kestävät tavoitteet lypsykarjan jalostuksessa. In: Mitä Suomi syö - ja millä hinnalla? : Agro-Food '99, Tampere 2.-4.1999, Tampere-talo. Agro-Food ry/Agronomiliitto ry. p. E62.

Pakula, Maria; Strandén, Ismo; Mäntysaari, Esa. 1998. Stochastic simulation to optimize Finnish dairy cattle nucleus breeding scheme. In: Book of Abstracts of the 49th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Warsaw, Poland 24-27 August 1998 / J.A.M. van Arendonk, Editor-in-Chief. The EAAP Book of Abstracts 4: p. 50.

Thuneberg-Selonen, Terhi; Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa; Ojala, Matti. 1998. Estimation of genetic parameters for trotting performance by the use of individual racing results. In: Book of Abstracts of the 49th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Warsaw, Poland 24 - 27 August 1998 / J.A.M. van Arendonk, Editor-in-Chief. The EAAP Book of Abstracts 4: 311.

Thuneberg-Selonen, Terhi; Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa; Ojala, Matti. 1998. Kilpailukohtaiset tulokset ravihevosten jalostusarvostelussa. In: Agro-Food '98 : Tampere 3.-5.2.1998 Tampere-talo. Agro-Food ry. p. E39.

Kettunen, Anne; Mäntysaari, Esa; Strandén, Ismo; Pösö, Jukka. 1997. Genetic parameters for test day milk yields of Finnish Ayrshires with random regression model. In: ADSA '97: 92nd Annual Meeting: University of Guelph: June 22-25, 1997. Journal of dairy science 80 Suppl.1: P219.

Mäntysaari, Päivi; Mäntysaari, Esa. 1997. Relationship of growth and milk production of the Finnish heifers measure from field data. In: ADSA '97 : Program and abstracts : 92nd annual meeting : University of Guelph : June 22-25, 1997. Journal of dairy science 80 Suppl. 1, P346: 231.

Kaustell, Kaisa; Mäntysaari, Esa; Huhtanen, Pekka. 1996. Utilization of feed consumption data and contemporary group solutions in management of milk recorded herds. In: Book of Abstracts of the 47th Annual Meeting of : Lillehammer, Norway, 25-29 August 1996 / J.A.M. van Arendonk, Editor-in-Chief. Wageningen Pers. p. 129.

Lidauer, Martin; Mäntysaari, Esa. 1995. Bias in pedigree indices of first lactating dairy cows. In: Book of Abstracts of the 46th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Prague, Czech Republic, 4 - 7 September 1995. p. 10.

Mäntysaari, Esa. 1995. Incorporation of milk content traits into a breeding goal. In: Book of Abstracts of the 46th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Prague, Czech Republic, 4 - 7 September 1995. p. 45.

Mäntysaari, Esa; Pösö, Jukka. 1995. Genetic correlation between reproductive disorders, operational days open and milk yield in Finnish Ayrshire. Journal of Dairy Science 78 Suppl. 1: 158.

Pösö, Jukka; Mäntysaari, Esa. 1995. Genetic relationship between udder health and milk yield in Finnish Ayrshire. In: Book of Abstracts of the 46th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Prague, Czech Republic, 4 - 7 September 1995. p. 22.

Hyppänen, Kaija; Juga, Jarmo; Mäntysaari, Esa; Mäki-Tanila, Asko. 1994. Use of decentralised MOET breeding scheme in dairy cattle breeding program. In: 45th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : 5-8 September 1994, Edinburgh. European Association for Animal Production. p. 105.

"Velmala, Riikka; Elo, Kari; Vilkki, Johanna; Mäntysaari, Esa; Mäki-Tanila, Asko. 1994. Casein haplotypes in Finnish Ayrshire and their association with milk production traits. In: IVth workshop of the Nordic genome initiative ""Beyond mapping single genes"" : September 3-5, 1994 in Helsinki (Kirkkonummi Majvik), Finland. p. 71. "

Mäntysaari, Esa. 1993. Arvostelumenetelmien paraneminen. In: Agro-Food : suomalaisen elintarviketuotannon kilpailukyky : Tampere 16.-18.11.1993, Tampere-talo. Agro-Food ry. p. A76.

Mäntysaari, Esa; Sillanpää, Mikko. 1993. Bias in pedigree indices of dairy bulls: Should the management group effects be fixed and should we use smaller heritability. In: 44th Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Abstracts : Aarhus, Denmark 16-19 August 1993. EAAP. p. 237.

Mäntysaari, Esa; Nylander, Anne; Mäki-Tanila, Asko; Kangasniemi, Reima. 1992. National animal model evaluation of pigs for growth rate and backfat thickness using on-farm measurements. In: 43rd Annual Meeting of the E.A.A.P.: Madrid : Abstracts Vol. I. p. 36-37.

Nylander, Anne; Mäki-Tanila, Asko; Mäntysaari, Esa; Kangasniemi, R. 1991. Application of animal model prediction in pigs using farm records. In: Berlin 1991 9th-12th September : 42nd Annual Meeting of the European Association for Animal Production : Abstracts : Vol. 2. p. 102-103.